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RNA的变性电泳原理

RNA的变性电泳原理
RNA的变性电泳原理

RNA的琼脂糖凝胶电泳

实验原理

RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。非变性电泳使用1.0%--1.4%的凝胶,不同的RNA条带也能分开,但无法判断其分子量。只有在完全变性的条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。因此要测定RNA分子量时,一定要用变性凝胶。在需快速检测所提总RNA样品完整性时,配制普通的1%琼脂糖凝胶即可。

基本过程同DNA电泳一样,但应明确一点的是,因为RNA分子对RNA酶的作用非常敏感,因此必须用对RNA酶有抑制作用DEPC水来配置所有溶液,所有与RNA接触的仪器和装置都要严格处理以尽量减少RNA酶对样品的降解;另外,因为RNA分子有二、三级结构可以影响其电泳结果,因此电泳时应在变性剂存在下进行,常用的变性剂为甲醛和戊二醛。

RNA非变性琼脂糖凝胶检测

实验材料、器具及药品

蘑菇的总RNA溶液。电泳仪,电泳槽,电子天平,移液器,枪头,微波炉,紫外透射检测仪等。琼脂糖,1XTAE电泳缓冲液,0.5μg/ml溴化乙锭(EB)10X载样缓冲液。

实验步骤

(1)用1×TAE电泳缓冲液制作琼脂糖凝胶,加1×TAE电泳缓冲液至液面覆盖凝胶。(2)在超净工作台上,用移液器吸取总RNA样品4 ul于封口膜上。在实验台上再加入5 ul 1×TAE电泳缓冲液及1 ul 的10X载样缓冲液,混匀后,小心加入点样孔。

(3)打开电源开关,调节电压至100V,使RNA由负极向正极电泳,约30min后将凝胶放入EB染液中染色5min,用清水稍微漂洗。在紫外透射检测仪上观察RNA电泳结果。

非变性电泳:上样量超过3ug,电压超过6V/cm,电泳缓冲液时间太长,均可能导致28S 和18S 条带分不开。使用2ug 上样量,电压小于6V/cm,使用新鲜的电泳缓冲液并且频繁混匀两极的缓冲液,是获得好的电泳结果的前提。(以DNA 标准为参照,28S 和18S 分别位于2.0kb 和0.9kb 左右。)

变性电泳条带变淡:EB 与单链的结合能力要差一些,故同样的上样量,变性电泳比非变性电泳要淡一些。另外的可能是甲醛的质量不高。

RNA的变性琼脂糖凝胶检测

试剂:

(1)MOPS缓冲液(10*):0.4mol/L 吗啉代丙烷磺酸(MOPS)(PH7.0),0.1mol/L NaAc, 10mol/L EDTA。

(2)上样染料:50%甘油,1mmol/L EDTA ,0.4%溴酚蓝,0.4%二甲苯蓝。

(3)甲醛。

(4)去离子甲酰胺。

电泳槽清洗:去污剂洗干净(一般浸泡过夜)——水冲洗——乙醇干燥——3%H2O2灌满——室温放置10分钟——0.1%DEPC水冲洗。

操作:

(1)将制胶用具用70%乙醇冲冼一遍,晾干备用。

(2)配制琼脂糖凝胶。

①称取0.5g琼脂糖,置干净的100ml锥形瓶中,加入40ml蒸馏水,微波炉内加热使

琼脂糖彻底溶化均匀。

②待胶凉至60--70 ℃,依次向其中加入9ml甲醛、5ml 10X MOPS缓冲液和0.5 ul溴

化乙锭,混合均匀。

③灌制琼脂糖凝胶。

(3)样品准备:

①取DEPC处理过的500 ul小离心管,依次加入如下试剂:10x MOPS缓冲液2ul,

甲醛3.5 ul,甲酰胺(去离子)10 ul,RNA 样品4.5 ul,混匀。

②将离心管置于60℃水浴中保10分钟,再置冰上2分钟。

③向管中加入3 ul上样染料,混匀。

(4)上样。

(5)电泳:电泳槽内加入1XMOPS缓冲液,于7.5V/ml 的电压下电泳。

(6)电泳结束后,在紫外灯下检查结果。

RNA提取、电泳注意事项,有几点说得很好啊

快速的操作,低温环境,少量取上清

主要是抽提之后吸取上清时要特别小心,只要不把蛋白层吸出来就不会有RNase污染。

分子克隆第二版343页,上关于提取RNA所用的玻璃容器的处理方法,是用前180度干烤8小时或更长时间;另一种方法是0.1%的depc水浸泡(37度2小时),然后灭菌水淋洗数次,100度干烤15分钟,然后高压灭菌除去depc.我们实验室一直是用170度考4小时,且不准离人,不准过夜,可能是怕烤箱长时间高温,线路老化会发生危险吧

提取RNA所用的枪头,EP管。直接高压烘干即可。如果用0.1%DEPC处理,要在DEPC配置后振摇1小时后再浸泡枪头,EP管方有效。我做的都是将枪头泡在配制好的depc中,摇

振过夜,然后倒掉depc注意要到干净,再高压,为了防止仍残留液体可120度干烤一会

A.对于提取RNA来说,我认为关键的一点在于实验器材的准备.包括从最初的标本的制备,保存,以及之后的试剂的准备,匀浆器,镊子,tip头的去除RNase处理,尤其是去除RNase的DEPC 处理步骤

B. 您在处死大鼠前,先准备好干净的冻存管(用1.5ml的Ep管也可以,就是后面您在从液氮中取出的时候容易爆,您的注意安全),然后将去除的骨骼肌立即用干净的剪刀分成半颗到一颗黄豆大小,装入冻存管后立即投入液氮保存.个人认为在这里使用装标本的管子没必要用DEPC处理

C.在提取RNA之前,将试剂(TRIzol)和器械(tip头,镊子,匀浆器)都准备好

D.从液氮取出标本后,立即转移进入事先加入TRIzol的匀浆器内(最好置冰上操作),立即匀浆,一直到标本完全碾磨碎,这个时候TRIzol液体成浑浊状,而且匀浆器的壁上没有太多的黏附组织,然后将TRIzol转出,继续后续的步骤.

1 RNase是一种蛋白酶,能够降解RNA。

2我们的手上皮肤上有很多,应该是对我们的身体起保护作用。保护不被RNA病毒感染?或者什么的。

3 这个酶高效稳定。要么在DEPC水中处理n小时,要么在160度高温烘烤6小时。此酶才会失效。

4 所谓DEPC,是一种叫做焦碳酸二乙酯的东西。有毒啊。所谓DEPC水,一般指两种状态,a,配制好未消毒;b,配制好已消毒。通过高压消毒,该物质会降解,从而无毒。

1 无菌蒸馏水中加入0.1%(v/v)焦碳酸二乙酯(DEPC),室温搅拌4小时以上至完全溶解,高压灭菌20分钟,冷却备用。这个是DEPC水的b状态。

2 如果你要用DEPC水处理Tips等等东东,那么就要用高压前的水,即DEPC水的a状态。把枪头管子等完全浸泡至少8小时,我一般都是过夜的,或者平时就泡在里面备用。

RNA 提取必须创造无RNase的环境,所有仪器与试剂均按照以下方法进行处理:研钵、研棒、药匙、玻璃器皿等需在180℃烘干4h以上;电泳槽、胶板、梳子、用0.1 %~0.2%DEPC 水处理过夜或者用洗涤灵清洗干净后用0.5%的SDS (Sodium dodecyl sulfate,抑制RNase的活性)浸泡过夜,然后用ddH2O冲洗干净,晾干备用;离心管,枪头等塑料器皿要用0.1%~0.2%DEPC水处理之后(DEPC有致癌之嫌,须小心操作)。37℃保温12h以上,然后高压灭菌,灭活DEPC ( Diethypyrocarbonate );溶液都需用经DEPC处理过的水配置,RNA提取的所有操作应尽可能在超净工作台上进行。

我们研究所里提RNA用的枪头和EP管都是高压两遍的,没有用DEPC水处理。

1、有灭菌过的DEPC水,这一般是用来配75%乙醇用,因为乙醇若高压灭菌会挥发,所以乙醇是新开封专用的。

2、没有经高压灭菌的DEPC水,这主要是用于配你提RNA所用的其他试剂(所说的试剂是可以经高压灭菌的),总的来说,都得经过高压灭菌,目的就是要去除DEPC,以防止它以随后实验的干扰。

3、DEPC处理水:无菌蒸馏水中加入0.1%(v/v)焦碳酸二乙酯(DEPC),室温搅拌4小时以上,121 度高压灭菌20分钟,冷却备用。

凡是不能用高温烘烤的材料如塑料容器等皆可用0.1%的焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶液处理,再

用蒸馏水冲净。DEPC是RNA酶的化学修饰剂,它和RNA 酶的活性基团组氨酸的咪唑环反应而抑制酶活性。DEPC与氨水溶液混合会产生致癌物,因而使用时需小心。试验所用试剂也可用DEPC处理,加入DEPC至0.1%浓度,然后剧烈振荡10分钟,再煮沸15分钟或高压灭菌以消除残存的DEPC,否则DEPC也能和腺嘌呤作用而破坏mRNA活性。但DEPC能与胺和巯基反应,因而含Tris和DTT的试剂不能用DEPC处理。Tris溶液可用DEPC处理的水配制然后高压灭菌。配制的溶液如不能高压灭菌,可用DEPC处理水配制,并尽可能用未曾开封的试剂.

为啥在28s之后还是有影影约约的片断?和模糊的smear?

这都与非变性电泳方式有关。RNA的电泳,严格讲是要使用变性电泳的,我们平时所知道的RNA 电泳的知识,实际上都是由变性电泳获得的。但因为非变性电泳实在是太方便了,同时,就一般检测而言,完全可以替代变性电泳,所以我们日常检测就都使用非变性电泳了。

电泳时间太长了容易产生降解。最好是在120V左右。操作的时候有没有注意戴口罩和手套,注意,手套要经常换,不要太节约了。那样也会影响RNA的质量。无论你是提什么RNA只要是用异丙醇沉淀的,都得用75%的酒精洗涤一次。

1 样品不要太多,抽提务必充分,室温放置5min;

2 200ul氯仿剧烈振荡20s,室温放置2-15min;

3 13000g 离心15min;

4 取上层水相,一般400-450ul就足够了,千万不要贪多!***

5 加入500ul异丙醇摇匀,室温放置10min;

6 12000g 离心10min;

7 75%乙醇1000ul 洗涤沉淀;

8 7500g 离心5min;(12000转速太高了吧,沉淀不容易溶解的)

9 弃乙醇,吸干净残余的微量乙醇,室温干燥3-5min;(时间太久沉淀不易溶解)

10 适量DEPC水溶解沉淀。

电泳的上样量1ug,电泳buffer用DEPC处理的水配制,电泳时间不要太久,95V,10-15min 足够了。

建议跑RNA电泳。先用2%琼脂糖胶,若分离效果不好,可用甲醛变性胶。在上样缓冲液中注意加入RNA酶抑制剂。注意观察带形,质量较好的RNA亮度。28S:18S应为2:1。还要注意观察,在加样孔或刚出加样孔附近,有没有带,若有,可能为基因组DNA污染。OD值只有1.5,可能为基因组DNA污染。参考一下分子克隆3。上面有OD值与污染DNA的关系。建议,酚氯仿抽提后,上清可少吸一些。提取后的RNA样品可用无RNA酶的DNA酶消化一下。注意该酶的buffer中有一种物质在OD260有吸光度,应严格按照其protocol操作,减少误差。

只要用DEPC处理过的水,打开一瓶新的无水乙醇(或者专用于RNA的,即只用处理过的枪头取过乙醇的)配就可以了。DEPC高温高压时变成CO2和水,再加上乙醇也很容易气化,可能是因为有气体产生吧,如果盖子太紧容易发生瓶子破掉的事情。(我还从来没有听说过把乙醇高温灭菌过)而且,湿热灭菌本身不足以去除RNA酶,所以我觉得有时候,灭菌可能反而引入RNA酶污染也不一定哦

75%的乙醇用于提取RNA 时最好还是现用现配,乙醇最好是新的且以后不要用于其他方面,也就是留一瓶专门用于提取RNA。DEPC一般高压灭菌30分钟就可以了!

75%乙醇:灭菌后的千分之一DEPC水25ml 75ml无水乙醇.配好后装入高温烘烤的玻璃瓶中(160干烘四小时),或塑料器皿的用千分之一的DEPC泡12小时以上再灭30分钟,存放于低温冰箱4度保存!!!

实验十一动物组织细胞总RNA的提取

一、实验原理

RNA是基因表达的中间产物,存在于细胞质与核中。对RNA进行操作在分子生物学中占有重要地位。获得高纯度和完整的RNA 是很多分子生物学实验所必需的,如Northern杂交、cDNA合成及体外翻译等实验的成败,在很大程度上取决于RNA的质量。由于细胞内的大部分RNA是以核蛋白复合体的形式存在,所以在提取RNA时要利用高浓度的蛋白质变性剂,迅速破坏细胞结构,使核蛋白与RNA分离,释放出RNA。再通过酚、氯仿等有机溶剂处理、离心,使RNA与其他细胞组分分离,得到纯化的总RNA。在提取的过程中要抑制内源和外源的RNase活性,保护RNA分子不被降解。因此提取必须在无RNase的环境中进行。可使用RNase抑制剂,如DEPC是RNase的强抑制剂,常用来抑制外源RNase活性。提取缓冲液中一般含SDS、酚、氯仿、胍盐等蛋白质变性剂,也能抑制RNase活性。并有助于除去非核酸成分。

本实验介绍异硫氰酸胍法和TRIzol法提取动物组织总RNA并通过电泳进行鉴定。

二、仪器和试剂

1.仪器:

超净工作台、高速冷冻离心机、电泳仪、紫外分光光度计、凝胶成像系统、振荡器、移液器、吸头、Ep管、玻璃匀浆器、试管、

玻璃器皿洗净后置180℃烘烤8h;不耐高温的器皿(如塑料制品)应用0.1% DEPC浸泡2h,70~80℃烘烤干燥,120℃高压20min,再70~80℃烘烤干燥方可使用。

2.试剂:

(1)细胞裂解液:异硫氰酸胍 4mol/L柠檬酸钠(pH7.0) 25mmol/L十二烷基肌氨酸钠 0.5%β-巯基乙醇0.1mol/L 称取柠檬酸钠0.64g,十二烷基肌氨酸钠0.415g,吸取β-巯基乙醇0.7ml,用无Rnase的蒸馏水溶解,定容至50ml。然后取以上配制的溶液(CBS液)33ml,异硫氰酸胍 25g,混合,完全溶解后4℃保存备用。

(2)10×凝胶缓冲液:吗啉代丙璜酸(MOPS)(pH7.0) 200mmol/L ,NaAc 100mmol/L,EDTA(pH 8.0) 10mmol/L 过滤除菌后避光保存。

(3)5×变性上样缓冲液:

(水饱和的溴酚蓝 16μl 500mmol/L EDTA(pH 8.0) 80μl 甲醛(37%) 720μl 甘油 2ml 甲酰胺3084μl 10×凝胶缓冲液 4ml 加无RNase水至10ml,4℃可保存3个月。)

(4)TRIzol RNA抽提试剂

(5)2mol醋酸钠

(6)0.1% DEPC

(7)平衡酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)

(8)平衡酚、氯仿

(9)无水乙醇、70%乙醇、异丙醇

(10)无RNase水

琼脂糖凝胶甲醛变性电泳检测

(1)制备凝胶(1.2%)。称1.2g琼脂糖,加72ml DEPC处理水,加热熔化。冷却至60℃,在通风橱内加入10×凝胶缓冲液10ml,甲醛(37%)18ml,混匀后,倒胶。

(2)制备样品。在离心管中,将RNA样品与5×变性上样缓冲液以4:1混匀。65℃温育5~10min,迅速在冰上冷却5min,离心数秒。

(3)上样前凝胶须预电泳5min,随后将样品卷入上样孔。以5V/cm的电压电泳1.5~2h.。

(4)待溴酚蓝迁移至凝胶长度的2/3~4/5处结束电泳。将凝胶置于溴化乙啶溶液(0.5μg/ml,用0.1mol/L 乙酸胺配制)中染色约30min。

(5)在凝胶成像系统观察并分析。

四、注意事项

1.RNA是极易降解的核酸分子。因此提取总RNA必须在无RNase 环境中,戴口罩、手套、使用无RNase污染的试剂、材料、容器。

2.所有溶液应加DEPC至0.05%~0.1%,室温处理过夜,然后高压处理或加热至70℃ 1 小时或60℃过夜,以除去石油残留的DEPC。

3.所用的化学试剂应为新包装,称量时使用干烤处理的称量勺,所有操作均应在冰浴中进行,低温条件可减低RNA酶活性。

4.根据RNA样品的紫外吸收OD值,可计算出RNAd 浓度。

单链RNA [ssRNA]=40×(OD260-OD310)×稀释倍数

纯RNA OD260 / OD280比值通常在1.7~2.0。若比值低于1.7,说明有蛋白质等污染,应用酚/氯仿在抽提。若比值低于2.0,表明有盐、胍、糖可用LiCL选择沉淀RNA以除去杂质。

毛细管电泳的基本原理及应用

毛细管电泳的基本原理及应用 摘要:毛细管电泳法是以弹性石英毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,依据样品中各组分之间淌度和分配行为上的差异而实现分离的电泳分离分析方法。该技术可分析的成分小至有机离子、大至生物大分子如蛋白质、核酸等。可用于分析多种体液样本如血清或血浆、尿、脑脊液及唾液等,比HPLC 分析高效、快速、微量。 关键词:毛细管电泳原理分离模式应用 1概述 毛细管电泳(Caillary Electrophoresis)简称CE,是一类以毛细管为分离通道,以高压直流场为驱动力的新型液相分离分析技术。CE的历史可以追溯到1967年瑞典Hjerten最先提出在直径为3mm的毛细管中做自由溶液的区带电泳(Capillary Zone Electro-phoresis,CZE)。但他没有完全克服传统电泳的弊端[1]。现在所说的毛细管电泳(CE)是由Jorgenson和Lukacs在1981年首先提出,他们使用了75mm的毛细管柱,用荧光检测器对多种组分实现了分离。1984年Terabe将胶束引入毛细管电泳,开创了毛细管电泳的重要分支: 胶束电动毛细管色谱(MEKC)。1987年Hjerten等把传统的等电聚焦过程转移到毛细管内进行。同年,Cohen 发表了毛细管凝胶电泳的工作。近年来,将液相色谱的固定相引入毛细管电泳中,又发展了电色谱,扩大了电泳的应用范围。 毛细管电泳和高效液相色谱(HPLC)一样,同是液相分离技术,因此在很大程度上HPCE与HPLC可以互为补充,但是无论从效率、速度、样品用量和成本来说,毛细管电泳都显示了一定的优势毛细管电泳(C E)除了比其它色谱分离分析方法具有效率更高、速度更快、样品和试剂耗量更少、应用面同样广泛等优点外,其仪器结构也比高效液相色谱(HPLC)简单。C E只需高压直流电源、进样装置、毛细管和检测器。 毛细管电泳具有分析速度快、分离效率高、试验成本低、消耗少、操作简便等特点,因此广泛应用于分子生物学、医学、药学、材料学以及与化学有关的化工、环保、食品、饮料等各个领域[2]。

非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Native-PAGE)

非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Native-PAGE)的分类 有三种常用的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳方法:blue native(BN-PAGE),clear native (CN-PAGE),quantitative preparative native continuous(QPNC-PAGE)。 在一个典型的native PAGE方法中,复合物被CN-PAGE或BN-PAGE分离。然后可以用其它分离方法如SDS-PAGE或等电聚焦做进一步分离。随后切割凝胶,蛋白复合物每一个部 分都被分开。蛋白的每个条带可以消化后做肽链指纹图谱或重新测序。这样就可以提供一个蛋白复合物中单个蛋白的重要信息。 1. Blue Native PAGE Blue Native PAGE是最古老的Native-PAGE技术。是以考马斯亮蓝作为电泳分离后蛋白 质鉴定染料的一种电泳方法。这种方法的缺点是:考马斯亮蓝与蛋白的结合起到了去垢剂的作用,可能导致复合物的分离;并对化学发光或蛋白质辅基的荧光或荧光染料的标记具有潜在的猝灭作用。 Blue Native PAGE在分析蛋白质-蛋白质相互作用以及膜蛋白复合物方面有很大的优势,其分离范围在100KDa-10MDa。在Blue native PAGE过程中,最重要的化合物就是考马斯亮蓝,除了增溶作用以外,蛋白质表面结合了大量的考马斯亮蓝染料而带上负电荷,这会导致即使碱性蛋白在pH7.5条件下也会向阴极迁移。但是,蛋白质虽然带有大量的负电荷,然而其分离依据的根本还是根据不连续的凝胶梯度-凝胶孔径的逐渐减小,蛋白质最终迁移 到其自身大小与凝胶孔径相近似的位置而停止。并且在分离膜蛋白的过程中,由于带有负电荷,而不会引起蛋白聚合,与酸性染料的结合,膜蛋白也由疏水性变成亲水性,溶解性大大提高。 1.2 Clear Native PAGE Clear Native PAGE是通过除染色以的其它方法如SLS鉴定蛋白的电泳技术。然而,这种方法最大的应用还是研究蛋白质-蛋白质相互作用,特别是和质谱联用。 Clear Native PAGE是在聚丙烯酰胺凝胶中分离酸性水溶性蛋白和膜蛋白(PI<7)的电泳

电泳的基本原理

电泳的基本原理 电泳是指带电颗粒在电场的作用下发生迁移的过程。许多重要的生物分子,如氨基酸、多肽、蛋白质、核苷酸、核酸等都具有可电离基团,它们在某个特定的pH值下可以带正电或负电,在电场的作用下,这些带电分子会向着与其所带电荷极性相反的电极方向移动。电泳技术就是利用在电场的作用下,由于待分离样品中各种分子带电性质以及分子本身大小、形状等性质的差异,使带电分子产生不同的迁移速度,从而对样品进行分离、鉴定或提纯的技术。 电泳过程必须在一种支持介质中进行。Tiselius等在1937年进行的自由界面电泳没有固定支持介质,所以扩散和对流都比较强,影响分离效果。于是出现了固定支持介质的电泳,样品在固定的介质中进行电泳过程,减少了扩散和对流等干扰作用。最初的支持介质是滤纸和醋酸纤维素膜,目前这些介质在实验室已经应用得较少。在很长一段时间里,小分子物质如氨基酸、多肽、糖等通常用滤纸或纤维素、硅胶薄层平板为介质的电泳进行分离、分析,但目前则一般使用更灵敏的技术如HPLC等来进行分析。这些介质适合于分离小分子物质,操作简单、方便。但对于复杂的生物大分子则分离效果较差。凝胶作为支持介质的引入大大促进了电泳技术的发展,使电泳技术成为分析蛋白质、核酸等生物大分子的重要手段之一。最初使用的凝胶是淀粉凝胶,但目前使用得最多的是琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶。蛋白质电泳主要使用聚丙烯酰胺凝胶。 电泳装置主要包括两个部分:电源和电泳槽。电源提供直流电,在电泳槽中产生电场,驱动带电分子的迁移。电泳槽可以分为水平式和垂直式两类。垂直板式电泳是较为常见的一种,常用于聚丙烯酰胺凝胶电泳中蛋白质的分离。电泳槽中间是夹在一起的两块玻璃板,玻璃板两边由塑料条隔开,在玻璃平板中间

电泳设备基本原理

电泳设备基本原理
阴极电泳涂料所含的树脂带有碱性基团,经酸中和后成盐而溶于水。通直流 电后,酸根负离子向阳极移动,树脂离子及其包裹的颜料粒子带正电荷向阴极移 动,并堆积在阴极上,这便是电泳涂装的基本原理(俗称镀漆)。电泳涂装是一 个很杂乱的电化学反响,一般以为至少有电解、电泳、电堆积、电渗这四种效果 一起发作。 1、 电解
任何一种导电液体在通电时发作分化的现象,如水的电解 能分化成 H2 和 O2。 2、 电泳
在导电介质中,带电荷的胶体粒子在电场的效果下向相反电极移动的现 象,如阴极电泳中带正电荷的胶体粒子(R3N H)夹藏和吸附颜料粒子由电泳进 程移向阴极。 3、电堆积
漆粒子在电极上的堆积现象。电堆积的第一步是 H2O 的电化学分化,这一 反响至使在阴极外表区发作高碱性(OH)界面层,当阳离子(树脂和颜料)与 OH 反响变成不溶性时,就发作涂膜的堆积。 4、电渗
刚堆积到被涂物外表的涂膜是半浸透的膜,在电场的继续效果下,涂膜内 部所含的水分从涂膜中渗分出来移向槽液,使涂膜脱水,这种现象称电渗。电渗 使亲水的涂膜变为涂膜,脱水而使涂膜细密化。
制造进程 它包含四个进程:
1 )电解(分化) 在阴极反响开始为电解反响,生成氢气及氢氧根离 子 OH ,此反响构成阴极面构成一高碱性边界层,当阳离子与氢氧根效果成为 不溶于水的物质,涂膜堆积,方程式为:H2O→OH+H 2 )电泳动(泳动、搬迁)阳离子树脂及 H+ 在电场效果下,向阴极移动, 而阴离子向阳极移动进程。 3 )电堆积(分出) 在被涂工件外表,阳离子树脂与阴极外表碱性效果, 中和而分出不堆积物,堆积于被涂工件上。 4 )电渗(脱水) 涂料固体与工件外表上的涂膜为半透明性的,具有大都 毛细孔,水被从阴极涂膜中排渗出来,在电场效果下,引起涂膜脱水,而涂膜则 吸附于工件外表,而完结整个电泳进程。
工艺特色 电泳外表处理工艺的特色: 电泳漆膜具有涂层饱满、均匀、平坦、润
滑的长处,电泳漆膜的硬度、附着力、耐腐、冲击功能、浸透功能显着优于其它 涂装工艺。
(1)选用水溶性涂料,以水为溶解介质,节省了很多有机溶剂,大大下降了 大气污染和环境危害,安全卫生,一起避免了火灾的危险;
(2)涂装功率高,涂料丢失小,涂料的利用率可达 90%~95%; (3)涂膜厚度均匀,附着力强,涂装质量好,工件各个部位如内层、洼陷、 焊缝等处都能取得均匀、滑润的漆膜,处理了其他涂装办法对杂乱形状工件的涂

聚丙烯酰胺凝胶电泳

聚丙烯酰胺凝胶电泳 (Polyacrylamide gel electrophoresis,PAGE) 聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺(acrylamide,Acr)单体相互聚合成多条长链,再与N,N-甲叉双丙烯酰胺(methylene-bisacrylamide,Bis)在引发剂和加速剂的作用下交联而成的凝聚胶多孔聚合物。凝胶孔径的大小可通过控制单体和交联剂的浓度来调节,从而满足不同分子量物质的分离要求。不同浓度的聚丙烯酰胺非变性凝胶的有效分离范围如表所示: 表1 DNA在聚丙烯酰胺凝胶中的有效分离范围 丙稀酰胺[%(w/v)]a有效分离范围(bp)二甲苯青FF b溴酚蓝b 3.51000-2000 460 100 5.080-500 260 65 8.060-400 160 45 12.040-200 70 20 15.025-150 60 15 20.0 6-100 45 12 a.N,N′-亚甲双丙稀酰胺占丙稀酰胺浓度的1/30 b.给出的数字是迁移率与染料相同的双链DNA片段的粗略大小(核苷酸对)。 聚丙烯酰胺凝胶的制备和电泳都比琼脂糖凝胶更为费事。聚丙烯酰胺凝胶几乎总是铺于两块玻璃板之间,两块玻璃板由间隔片隔开冰封以绝缘胶布。在这种配置形式下,大多数丙烯酰胺溶液不会与空气接触,所以氧对聚合的抑制仅限于凝胶顶部的一个窄层里。聚丙烯酰胺凝胶一律是进行垂直电泳,根据分离的需要,其长度可以在10-100cm之间。聚丙烯酰胺凝胶与琼脂糖凝胶相比有3个主要优点:(1)分辨力强,长度仅仅相差0.2%(即500bp中的1bp)的DNA分子即可分开;(2)所能装载的DNA分子量远远琼脂糖凝胶:多达10μg的DNA可以加样于聚丙烯酰胺凝胶的一个标准样品槽(1cm×1mm)而不致显著影响分辨力;(3)从聚丙烯酰胺凝胶中回收的DNA纯度很高,可适用于要求最高的实验(如鼠胚胎微注射)。 常用的是两种聚丙烯酰胺凝胶: (1)用于分离和纯化双链DNA片段非变性聚丙烯酰胺凝胶 (2)用于分离、纯化单链DNA的变性聚丙烯酰胺凝胶 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 【原理】 非变性聚丙烯酰胺凝胶用于分离和纯化小分子双链DNA片段(<1 000bp),多数双链DNA在此胶中的迁移率大略与其大小的对数值成反比,但迁移率也受碱基组成和序列的影响,同等大小的DNA分子可能由于空间结构的不同而使迁移率

电泳原理.pdf

电泳原理 阳极电泳用水溶性树脂是一种高酸值的羧酸盐,在水中溶解后以分子和离子平衡 状态存在于直流电场中,通电后,由于两极的电位差,离子定向移动,阴离子沉积在阳极表面,而阳离子在阴极表面获得电子还原成胺,它是一个电化学反应,包括电泳、电解、电沉 积和电渗四个同时进行的过程。 1.电泳:在直流电压作用下,分散在介质中的带电胶体粒子在电场作用下向与其所 带电荷相反的电极方面移动,叫电泳。 2.电沉积:阴离子树脂放出电子沉积在阳极表面,形成不溶水的漆膜,此过程叫电 沉积。 3.电渗:电泳逆过程,当阴离子树脂在阳极上,吸附在阳极上的介质在内渗力的作 用下,从阳极穿过沉积的漆膜进入漆液,称电渗。 4.电解:电流通过漆液时水便发生电解阴极放出氢气,阳极放出氧气,此过程 即为电解。 电泳涂料 有人说,电泳涂料可划分为三代,第一代为环氧树脂涂料,第二代为丙烯酸树脂涂料, 第三代为聚氨酯涂料。由于环氧涂料主要应用于汽车底盘,第三代主要用于阴极电泳漆,涂覆于首饰表面,故目前主要介绍第二代,即丙烯酸树脂涂料。此树脂如一团乱麻,羧基藏于里,胺基接于外,其中最先的羧基有70%被胺基取代,因其树脂中存在-COONHR,使树脂成为水溶性。铝型材表面涂覆的丙烯酸树脂多采用胺基树脂为固化剂进行交联固化,同时, 涂料分子均匀性对工艺操作有很大影响,一般说,乳化越好,分子越均匀。 涂装工艺流程 1 .除油:如有酸回收装置,推荐采用碱性除油,因碱性除油后,铝型材表面比较光亮,且 不会与后面的碱蚀发生副作用,如用碱性除油,其主要成份是 Na 2 CO 3 和NaOH。 2 .水洗:自来水洗去前道工序的酸或碱。 3 .蚀:加入碱蚀剂的碱蚀工序,会降低型材表面光亮度,但效果并不十分明显,主要应注意不可使槽中Al 3 含量过大,温度过高,否则易产生洗不去的花斑,涂漆烘干后呈黄色。 二道水洗:最好有喷淋或加大溢流,以保证清洗彻底。 除灰:用HNO 3 效果较好,但要注意加强水洗(最少二道+喷淋)。 水洗:自来水用H 2 SO 4 除灰,一道水洗即可,用HNO 3 除灰,需二道水洗 氧化:H 2 SO 4 氧化一般为20min,使氧化膜达到9u,某些公司推销的所谓的 高温氧化剂,其主要成份是一种混酸,建议不要使用,对氧化膜的色泽、硬度、可着色性均 无好处。 水洗:自来水二道加大溢流。 着色:用单锡盐、单镍盐、锡镍复合盐均可,注意不要有色差,因为色差会在 电泳涂漆后加大。 水洗:最好加喷淋,以期尽量减少对后道工序酸的带入量。 热纯水洗:要求电导率<100us/cm,温度70-80℃,PH=4-6,尤其是银白涂漆型材或氧化中电压较大的型材应在此槽中处理较长的时间,PH值可用三乙胺进行调整。

非变性凝胶电泳技术

Native-PAGE原理 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Native-PAGE)是在不加入SDS 疏基乙醇等变性剂的条件下,对保持活性的蛋白质进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,常用于同工酶的鉴定和提纯。未加SDS的天然聚丙烯酰胺凝胶电泳可以使生物大分子在电泳过程中保持其天然的形状和电荷,它们的分离是依据其电泳迁移率的不同和凝胶的分子筛作用,因而可以得到较高的分辨率,尤其是在电泳分离后仍能保持蛋白质和酶等生物大分子的生物活性,对于生物大分子的鉴定有重要意义,其方法是在凝胶上进行两份相同样品的电泳,电泳后将凝胶切成两半,一半用于活性染色,对某个特定的生物大分子进行鉴定,另一半用于所有样品的染色,以分析样品中各种生物大分子的种类和含量。 实验方法 非变性聚丙烯酰胺凝胶和变性sds-page电泳在操作上基本上是相同的,只是非变性聚丙烯酰胺凝胶的配制和电泳缓冲液中不能含有变性剂如SDS等。 一般蛋白进行非变性凝胶电泳要先分清是碱性还是酸性蛋白。分离碱性蛋白时候,要利用低pH凝胶系统,分离酸性蛋白时候,要利用高pH凝胶系统。 酸性蛋白通常在非变性凝胶电泳中采用的pH是8.8的缓冲系统,蛋白会带负电荷,蛋白会相阳极移动;而碱性蛋白通常电泳是在微酸性环境下进行,蛋白带正电荷,这时候需要将阴极和阳极倒置才可以电泳分离酸性蛋白。 工作液配制 1.40%胶贮液(Acr:Bis=29:1); 2.4×分离胶Buf(1.5 M Tris-HCl,pH 8.8):18.2 g Trisbase 溶于ml 水,用浓HCl调pH 8.8,加水定容到100ml,4℃贮存; 3. 4×堆积胶Buf(0.5 M Tris-HCl,pH 6.8):6g Trisbase 溶于80ml 水,用浓HCl调pH 6.8,加水定容到100ml,4℃贮存; 4.10×电泳Buf(pH8.8 Tris-Gly):30.3 g Trisbase,144g 甘氨酸,加水定容到L,4℃贮存; 5.2×溴酚蓝上样Buf:1.25ml pH 6.8, 0.5M Tris-Cl,3.0ml甘油,.2ml 0.5% 溴酚蓝,5.5ml dH2O;-20℃贮存;

电泳

电泳技术简介 带电颗粒在电场作用下,向着与其电性相反的电极移动,称为电泳(electrophoresis, EP)。利用带电粒子在电场中移动速度不同而达到分离的技术称为电泳技术。1937 年瑞典学者A.W.K.蒂塞利乌斯设计制造了移动界面电泳仪,分离了马血清白蛋白的3种球蛋白,创建了电泳技术。 目录 什么是电泳 电泳种类 电泳原理 电泳 展开 什么是电泳 电泳种类 电泳原理 电泳 展开 电泳Electrophoresis 什么是电泳 在确定的条件下,带电粒子在单位电场强度作用下,单位时间内移动的距离(即迁移率)为常数,是该

电泳图谱 带电粒子的物化特征性常数[1]。不同带电粒子因所带电荷不同,或虽所带电荷相同但荷质比不同,在同一电场中电泳,经一定时间后,由于移动距离不同而相互分离。分开的距离与外加电场的电压与电泳时间成正比。 在外加直流电源的作用下,胶体微粒在分散介质里向阴极或阳极作定向移动,这种现象叫做电泳。利用电泳现象使物质分离,这种技术也叫做电泳。胶体有电泳现象,证明胶体的微粒带有电荷。各种胶体微粒的本质不同,它们吸附的离子不同,所以带有不同的电荷。 电荷移动规律 利用电泳可以确定胶体微粒的电性质,向阳极移动的胶粒带负电荷,向阴极移动的胶粒带正电荷 电泳仪 。 一般来讲, 金属氢氧化物、金属氧化物等胶体微粒吸附阳离子,带正电荷 非金属氧化物、非金属硫化物等胶体微粒吸附阴离子,带负电荷。 因此,在电泳实验中,氢氧化铁胶体微粒向阴极移动,三硫化二砷胶体微粒向阳极移动。利用电泳可以分离带不同电荷的溶胶。 例如,陶瓷工业中用的粘土,往往带有氧化铁,要除去氧化铁,可以把粘土和水一起搅拌成悬浮液,由于粘土粒子带负电荷,氧化铁粒子带正电荷,通电后在阳极附近会聚集出很纯净的粘土。工厂除尘也用到电泳。利用电泳还可以检出被分离物,在生化和临床诊断方

琼脂糖凝胶电泳技术

电泳检测技术是指利用带电颗粒在电场中能向异性电极泳动这一现象来分离、纯化或分析检测供试品的一种生物化学技术。 原理:许多生物分子都带有电荷,在电场作用下可发生移动,由于混合物中各组分所带电荷性质、数量以及相对分子质量各不相同,使在同一电场作用下,各组分的泳动方向和速率也各有差异,所以在一定时间内,它们移动距离不同,从而可达到分离鉴定的目的。 DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时,包括电荷效应和分子筛效应。 琼脂糖是由天然的琼脂加工制得,是一种直链杂聚多糖,溶于热水,形成溶胶,冷却后成为孔径范围从50nm到大于200nm的大网孔径凝胶。由于孔径较大,对一般蛋白质不起分子筛作用,该电泳技术是目前分离、分析DNA片段的标准方法。 DNA琼脂糖凝胶电泳的原理 DNA 分子是两性电解质,在高于其等电点的溶液(pH8.0~pH8.3 DNA分子本身的大小和构型、凝胶浓度决定了DNA分子的迁移速度。)中,碱基几乎不解离,磷酸基团全部解离,DNA 分子带负电荷,在电场中向正极移动。 DNA分子大小对迁移速率的影响:相对分子质量大,迁移慢;相对分子质量小,迁移快。DNA分子构型对迁移速率的影响:迁移速度:闭环﹥直链DNA﹥开环DNA。 琼脂糖凝胶浓度的影响:同样大小的线性DNA片段,在不同浓度的琼脂糖凝胶中的迁移速度不同,浓度越大,迁移的越慢 常用的电泳上样缓冲液含溴酚蓝,有的还含有二甲苯青,这些指示剂可以指示电泳的速度。溴化乙淀(EB)是核酸的染色剂,能插入DNA分子中形成荧光结合物,EB在紫外线照射下的发射荧光。荧光的强度与DNA的含量成正比,从而可以确定DNA片段在凝胶中的位置及估计出待测样品的浓度。 EB是强致癌剂。 电泳操作步骤(整个过程要求带一次性手套 1、胶槽准备 ①将凝胶托盘放入制胶盒中; ②将加样梳垂直插入到制胶盒的小凹槽内,梳齿底端和凝胶托盘有1mm的间隙; ③将制胶盒放在调整好的水平台上。 2、凝胶准备用1×TAE配制1%琼脂糖凝胶。 ①称0.15g琼脂糖置三角瓶中,加15ml 1×TAE; ②微波炉加热大约1分钟,熔化琼脂糖; ③熔化的琼脂糖自然冷却到60~70℃时,加入DNA染料,并轻轻混匀。 3、倒胶:将冷却致60℃的凝胶倒入准备好的制胶盒内,凝胶厚度3~5mm,室温下静置半小时左右冷却,凝胶固化。 4、轻轻拔出固定在凝胶中的加样梳。将带凝胶的凝胶托盘置于电泳槽中,并使样品孔位于电场负极,向电泳槽中加入1×TAE电泳缓冲液,越过凝胶表面即可,出去样品孔的气泡。 6、样品准备:向核酸样品中加入约为样品体积1/10的上样缓冲液,用加样器轻轻混匀。 7、上样:用加样器吸取样品,轻轻的加入到凝胶的样品孔中。加样量一般5-7μl。 8、盖上电泳槽,接通电源,开始电泳。 开始电泳前,再次确认凝胶样品孔处于电场的负极。 电泳条件:5v/cm;时间20-30分钟左右 9、电泳结束后,切断电源,取出凝胶。

电泳的基本原理

电泳的基本原理 mm,近年来新研制的电泳槽,胶面更小、更薄,以节省试剂和缩短电泳时间。制胶时在凝胶溶液中放一个塑料梳子,在胶聚合后移去,形成上样品的凹槽。水平式电泳,凝胶铺在水平的玻璃或塑料板上,用一薄层湿滤纸连接凝胶和电泳缓冲液,或将凝胶直接浸入缓冲液中。由于pH值的改变会引起带电分子电荷的改变,进而影响其电泳迁移的速度,所以电泳过程应在适当的缓冲液中进行的,缓冲液可以保持待分离物的带电性质的稳定。E =V/L为了更好的了解带电分子在电泳过程中是如何被分离的,下面简单介绍一下电泳的基本原理。在两个平行电极上加一定的电压(V),就会在电极中间产生电场强度(E),上式中L是电极间距离。在稀溶液中,电场对带电分子的作用力(F),等于所带净电荷与电场强度的乘积:F=q*E上式中q是带电分子的净电荷,E是电场强度。这个作用力使得带电分子向其电荷相反的电极方向移动。在移动过程中,分子会受到介质粘滞力的阻碍。粘滞力(F’)的大小与分子大小、形状、电泳介质孔径大小以及缓冲液粘度等有关,并与带电分子的移动速度成正比,对于球状分子,F’的大小服从Stokes定律,即:F’=6πrηυ式中r是球状分子的半径,η是缓冲液粘度,υ是电泳速度(υ= d / t,单位时间粒子运动的距离,cm / s )。当带电分子匀速移动时:F =

F’,∴qE =6πrηυ电泳迁移率(m)是指在单位电场强度 (1V/cm)时带电分子的迁移速度:所以: v/E=Q/6πrη这就是迁移率公式,由上式可以看出,迁移率与带电分子所带净电荷成正比,与分子的大小和缓冲液的粘度成反比。用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳测定蛋白质分子量时,实际使用的是相对迁移率mR。即:上式中:d-带电粒子泳动的距离,t -电泳的时间,V-电压,L-两电极交界面之间的距离,即凝胶的有效长度。因此,相对迁移率mR就是两种带电粒子在凝胶中泳动迁移的距离之比。 带电分子由于各自的电荷和形状大小不同,因而在电泳过程中具有不同的迁移速度,形成了依次排列的不同区带而被分开。即使两个分子具有相似的电荷,如果它们的分子大小不同,由于它们所受的阻力不同,因此迁移速度也不同,在电泳过程中就可以被分离。有些类型的电泳几乎完全依赖于分子所带的电荷不同进行分离,如等电聚焦电泳;而有些类型的电泳则主要依靠分子大小的不同即电泳过程中产生的阻力不同而得到分离,如SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳。分离后的样品通过各种方法的染色,或者如果样品有放射性标记,则可以通过放射性自显影等方法进行检测。

SDS-PAGE电泳的基本原理及浓缩胶浓缩样品的原理

SDS-PAGE电泳的基本原理及浓缩胶浓缩样品的原理 SDS-PAGE(十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳)是目前最常用的分离蛋白质的电泳技术 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS,SDS能断裂分子内和分子间氢键,破坏蛋白质的二级和三级结构,强还原剂能使半胱氨酸之间的二硫键断裂,蛋白质在一定浓度的含有强还原剂的SDS溶液中,与SDS分子按比例结合,形成带负电荷的SDS-蛋白质复合物,这种复合物由于结合大量的SDS,使蛋白质丧失了原有的电荷状态形成仅保持原有分子大小为特征的负离子团块,从而降低或消除了各种蛋白质分子之间天然的电荷差异,由于SDS与蛋白质的结合是按重量成比例的,因此在进行电泳时,蛋白质分子的迁移速度取决于分子大小。当分子量在15KD到200KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为常数,若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。 SDS-PAGE电泳成功的关键是什么? ①溶液中SDS单体的浓度 SDS在水溶液中是以单体和SDS-多肽胶束的混合形式存在,能与蛋白质分子结合的是单体。为了保证蛋白质

与SDS的充分结合,它们的重量比应该为1∶4或1∶3。②样品缓冲液的离子强度因为SDS结合到蛋白质上的量仅仅取决于平衡时SDS单体的浓度,不是总浓度,而只有在低离子强度的溶液中,SDS 单体才具有较高的平衡浓度。所以,SDS电泳的样品缓冲液离子强度较低,常为10-100 mM。③二硫键是否完全被还原只有二硫键被完全还原以后,蛋白质分子才能被解聚,SDS才能定量地结合到亚基上从而给出相对迁移率和分子质量对数的线性关系。Sample buffer 中的β-巯基乙醇的浓度常为4-5%,二硫苏糖醇的浓度常为2-3%。前者有挥发性,最好使用前加入。 SDS-PAGE缓冲液系统的选择,Tris-Glycine、Tris-Tricine、Tris-硼酸盐或者其他? 一般来说,在被分析的蛋白质稳定的pH范围,凡是不与SDS发生相互作用的缓冲液都可以使用,但缓冲液的选择对蛋白带的分离和电泳的速度是非常关键的。Tris-甘氨酸系统是目前使用最多的缓冲系统。Tris-甘氨酸系统是目前使用最多的缓冲系统。如果要测定糖蛋白的分子量,最好采用Tris-硼酸盐缓冲系统,对于分子质量小于15 kDa的蛋白样品,可以使用SDS-尿素系统,也可以采用Tris-tricine缓冲系统。 积层胶(或称浓缩胶)的作用原理?

DNA非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳银染配方及步骤

DNA非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳银染配方及步骤 最近需要做DNA非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,需要用银染显示条带,但是找不到具体的配方和步骤,不知和蛋白PAGE电泳银染有什么差别,哪位师兄师姐有配方可否发一份,十分感谢!一、电泳试剂: 1、30%聚丙烯酰胺(29:1) 丙稀酰胺29克,Bis1克,水100ml。 2、10%过硫酸胺 过硫酸胺1克,水10ml。 3、TEMED 4、5xTBE Tris 27克,硼酸13.75克,0.5M EDTA(pH 8.0) 10ml,定容至500ml。 二、银染试剂 1、固定液:100ml无水乙醇,5ml冰醋酸,定容至1000ml。 2、0.2% AgNO3:AgNO3 1克,水500ml。 3、1.5% NaOH:NaOH 7.5克,水500ml。 4、37%甲醛。 三、配胶(6%): 30%聚丙烯酰胺(29:1) 8ml,5xTBE 8ml,定容至40ml,加10%过硫酸胺 200ul;T EMED 20ul。室温凝固时间>1小时。 四、银染: 1、固定液固定10m。 2、水洗2m x3次。 3、0.2% AgNO3 100ml +37%甲醛50ul,混匀,避光染色30~50m。 4、水洗 20秒x2次。 5、1.5% NaOH 100ml,加37%甲醛 0.5ml,混匀,显色3~10m。 6、水洗若干次,终止显色。 电泳时间:150v x 3h,溴酚兰的位置相当于40bp。 银染后胶面积将膨胀10%。 在终止显色过程中,将依惯性继续显色,所以不等显色到位即可进行终止显色。 显色到位后立即拍摄,水浸泡过夜将使背景加深转贴!!! 聚丙烯酰胺凝胶电泳是分子生物学常用的一种技术。我们实验室应用该项技术进行基因组甲基化的筛选,取得了一定结果。因为全基因组的筛选需要很高的灵敏度,背景干扰降到最低,因此在对凝胶进行染色时,往往采用同位素法或银染法,而且配制的胶往往很大,我们配制的是大约40×35cm的胶,0.4mm厚。同位素十分灵敏,特异,但是由于其操作的复杂性,许多实验室开展有一定困难。银染法相对简便易行,便于一般的实验室开展。 需要指出的是,应用与筛选基因组的银染往往采用测序胶的染色方法,这样才能保证灵敏性,我们在长期的工作中积累了一些银染的经验,与大家分享。 下面是网上的一个银染方法,我们使用后觉得效果不错,然后以此为基础,介绍一下我们的经验 测序凝胶的银染

凝胶电泳

凝胶电泳

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论文题目:凝胶电泳 专业:化学 年级:10级 学号:10101550203 姓名:马慧 摘要 凝胶电泳(Gel electrophoresis)或称胶体电泳,也可称为扁平式电泳法,是一大类技术,被科学工作者用于分离不同物理性质(如大小、形状、等电点等)的分子。它是以淀粉胶、琼脂或琼脂糖凝胶、聚丙烯酰胺凝胶等作为支持介质的区带电泳法。凝胶电泳通常用于分析用途,但也可以作为制备技术,在采用某些方法,如质谱、聚合酶链式反应、克隆、DNA测序或者 免疫印迹检测之前,进行部分提纯分子。通过学习,了 解凝胶电泳的类别、原理、特点及其应用范围。 关键词:制备,类别,定义,原理,特点,应用范围 正文 一、凝胶制备 1、设备与试剂:琼脂糖凝胶电泳分为垂直及水平型两种。其中水平型可制备低浓度琼脂糖凝胶,而且制胶与加样都比较方便,故应用比较广泛。核酸分离一般用连续缓冲体系,常用的有TBE(0.08mol/L Tris?HCl,pH8.5,0.08mol/L硼酸,0.0024mol/L EDTA)和THE(0.04mol/L Tris?HCl。pH7.8,0.2mol/L醋酸钠,0.0018mol/L EDTA)。 2、凝胶制备:用上述缓冲液配制0.5%-0.8%琼脂糖凝胶溶液,沸水浴或微波炉加热使之融化,冷至55℃时加入溴化乙锭(EB)至终浓度为0.5μg/ml,然后将其注入玻璃板或有机玻璃板组装好的模子中,厚度依样品浓度而定。注胶时,梳齿下端距玻璃板0.5-1.0mm,待脱凝固后,取出梳子,加入适量电极缓冲液使板胶浸没在缓冲液下1mm处。

五种电泳技术的比较

五种电泳技术的比较-标准化文件发布号:(9456-EUATWK-MWUB-WUNN-INNUL-DDQTY-KII

五种电泳技术的比较 SDSPAGE 名词解释: 相对迁移率(Rf) 问答题: 1.简述SDS-PAGE的基本原理。 2.影响SDS电泳的关键因素有哪些 AGE 名词解释 1.迁移率 2.电渗 3.电泳 问答题 1.影响电泳迁移率的因素有哪些? 2.试述琼脂糖凝胶电泳分离脂蛋白的原理。 CAME 1.CAME的基本原理是什么? 2.CAME分离血清蛋白电泳时应注意哪些问题? PAGE 名词解释 1.凝胶总浓度 2.交联度 问答题 1.与CAME相比,PAGE有哪些特点。 2.试比较CAME与PAGE操作的区别。 3.简述不连续PAGE的原理。 1.琼脂糖凝胶电泳Agarose Gel Electrophoresis Gel Electrophoresis :由琼脂、琼脂糖、淀粉胶及聚丙烯酰胺等物质作支持体的电泳。 特点(characteristic): 1.可以制成非常均匀的凝胶,带电质点在凝胶的孔中泳动。 2. 电泳操作方法简便,电泳速度快。 3. 分辨率高,重复性好,电泳图谱清晰。 4. 适用于生化,免疫等定性定量测定。 (一)优点(advantage) 1.因不含硫酸根和羧基,几乎消除了琼脂的电渗。 2.对蛋白质吸附极微,故无拖尾现象。 3.凝胶结构均匀,孔径较大,可用来分离酶的复合物、核酸、病毒等大分子物质。 4.透明度较好,可直接或干燥成薄膜后进行染色。 5.不吸收紫外光,可直接利用紫外光吸收法作定量测定。 6.有热可逆性。

(二)缺点(disadvantage) 1.机械强度差,易破碎,浓度不能太低。 2.易被细菌污染,不易保存,临用前配制。 3.琼脂糖支持层上的区带易于扩散,电泳后必须立即固定染色。 4.与PAGE相比,分子筛(molecular sieve)作用小,区带少。 应用 1. 适用于大分子的核酸、核蛋白等的分离、鉴定及纯化 2. 临床生化检验中常用于LDH、CK等同工酶的分离与检测 3. 为不同类型的高脂蛋白血症、冠心病等提供生化指标 影响迁移的因素 the size of the molecule conformation of the molecule the agarose concentration of a gel Voltage 百分浓度和分辨率限制 Most agarose gels are made with between 0.7% (good separation or resolution of large 5–10kb DNA fragments) and 2% (good resolution for small 0.2–1kb fragments) agarose dissolved in electrophoresis buffer. Up to 3% can be used for separating very tiny fragments but a vertical polyacrylamide gel 聚丙烯酰胺is more appropriate in this case. Low percentage gels are very weak and may break when you try to lift them. High percentage gels are often brittle and do not set evenly. 1% gels are common for many applications. 琼脂糖凝胶分离血浆脂蛋白 原理:血清脂蛋白经饱和苏丹黑B预染后,以琼脂糖凝胶为支持介质,在pH8.6巴比妥缓冲液中电泳,根据各脂蛋白的组成、大小、形状分离成不同区带。 pH 8.6 > pI ,各种脂蛋白均带负电,电泳时由负极到正极;VLDL为圆 形,受阻力小,LDL形态不规则,受阻力大,所以VLDL跑在前。 加样槽在负极,由负极到正极分别是CM\LDL\VLDL\HDL 2.醋酸纤维薄膜电泳Cellulose acetate membrane electrophoresis,CAME 特点:低吸附作用,低电渗作用,样本用量少,亲水性 1.Low sorption 2.Low electroosmosis 3.Small sample 4.Hydrophilic 电泳图谱不齐 ①点样时血清点加不均匀 ②薄膜局部干燥 ③电泳时供给薄膜的液量不均匀或过少 ④缓冲液变质 ⑤电泳时薄膜位置不正,与电流方向不平行 电泳图谱分理不清 ①点样时血清点加不均匀

PAGE电泳原理与步骤

PAGE 电泳的操作步骤及试剂配方 聚丙烯酰胺凝胶电泳作为检测DNA 序列差异的有效手段,变性凝胶电泳在我室广泛使用,但是也有其使用范围。在我室还有一种常用的非变性凝胶电泳技术,简称SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism ,单链构象多态性)。 原理:在SSCP 测定中,双链DNA (dsDNA )被变性成为单链DNA (ssDNA ),每一条单链DNA 都基于它们的内部序列而呈现出一种独有的折叠构象,即使同样长度的DNA 单链因其碱基顺序不同、甚至单个碱基的不同会形成不同的构象。这些单链DNA 在非变性条件下,用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,单链DNA 的迁移率和带型,都取决于其折叠构象和电泳时的温度。 SSCP 与变性凝胶电泳基本一致,不同之处有以下几点:a .SSCP 使用非变性凝胶进行电泳,即在凝胶配制中不加入变性剂。我室常用8%非变性胶(丙烯酰胺80g ,N-N ,-亚甲双丙烯酰胺 2.76g ,10×TBE 50ml ,加水定容到1L )b .工作环境,由于SSCP 受温度影响,所以在电泳过程中应防止温度的升高,所以电泳环境为电压400V ,电流50mA ,单板电泳功率为9W ,不用预热。缓冲液最好用新配制的。c .由于电泳功率较低,所以电泳时间较长,通常需要10小时以上,因此一般电泳需要过夜。室温在25。C 以下。 1.聚丙烯酰胺凝胶电泳 聚丙烯酰胺凝胶电泳适宜分离鉴定低分子量的蛋白质,小于1kb 的DNA 片段和DNA 序列。分析装载的样品容量大,可回收,DNA 纯度高。在催化剂TEMED (N-N-N ,-N ,-四甲基乙二胺)和过硫酸胺的作用下,丙烯酰胺聚合成长链,聚丙烯酰胺链在交联剂,N-N ,-亚甲双丙烯酰胺的参与下,聚丙烯酰胺链与链之间交叉联结形成凝胶。 1.1配制30%丙烯酰胺:丙烯酰胺29g 、N-N ,-亚甲双丙烯酰胺1g 、加水至100ML ,40C 棕色瓶可保存1.2配制5×TBE 缓冲液:TRIS 碱54克、硼酸27.5克、EDTA 3.72克、加水至1L 1.3制备聚丙烯酰胺凝胶所用试剂体积 1.4DNA 在聚丙烯酰胺凝胶中有效分离范围 丙烯酰胺(%) 有效分离范围(bp ) 二甲苯氰FF 溴酚蓝3.51000-20004601005.080-500260658.060-4001604512.040-200702015.025-150601520.0 6-100 45 12 2.聚丙烯酰胺凝胶电泳具体步骤 2.1从NaOH 池中捞出浸泡的玻璃板,取出上面的残胶2.2把玻璃板拿到流动水处洗刷干净2.3洗干净的玻璃板至于玻璃板架上晾干2.4用乙醇擦洗玻璃板 试剂制备不同浓度(%)凝胶所用试剂体积(ml ) 3.5 5.08.012.020.030%丙烯酰胺 11.616.626.640.066.6水67.762.752.739.312.75×TBE 20.020.020.020.020.010%过硫酸铵 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7

电泳涂装基本原理

电泳涂装基本原理 所谓电泳涂装,是将被涂物浸渍在水溶性涂料中作为阳极(阳极电泳),另设一与其相对应的阴极,在两极间通直流电,靠电流所产生的物理化学作用,使涂料均匀涂在被涂物上的一种涂装技术。 电泳涂装必须使用电泳漆,电泳漆通常又称水溶性涂料,电泳漆与蒸馏水必须按一定比例进行稀释,才能使用。 电泳涂装一般包括四个同时进行的过程: 1、电泳:在直流电场的作用下,正,负带电胶体粒子向负,正方向运动,也称泳动。 2、电解:电极上分别进行着氧化还原反应,反而在电极上形成氧化与还原现象。 3、电沉积:由于电泳作用,移至阳极附近的带电胶体粒子在模板表体放出电子,而呈不溶状态沉积,析出的现象,此时漆膜形成。 4、电渗:在电场作用下,固相不动,而液相移动的现象。电渗作用使漆膜内所含水份逐渐被排到涂膜外,最后形成几乎连电流也通不过去,含水率极低,电阻相当高的致密漆膜。 5、铁红环氧电泳漆为例:该电泳漆系改性环氧树脂,丁醇,乙醇胺,滑石粉,铁红的物质组成,电泳漆与蒸馏水混合后,在直流电场的作用下,即分离成带正电荷的阳离子和带负电荷的阴离子,并进行一系列复杂的物理化学胶体化学,电化学变化过程。 电泳涂装的方法及技巧 (1)一般金属表面的电泳涂装,其工艺流程为:预清理→上线→除油→水洗→除锈→水洗→中和→水洗→磷化→水洗→钝化→电泳涂装→槽上清洗→超滤水洗→烘干→下线。 (2)被涂物的底材及前处理对电泳涂膜有极大影响。铸件一般采用喷砂或喷丸进行除锈,用棉纱清除工件表面的浮尘,用80#~120#砂纸清除表面残留的钢丸等杂物。钢铁表面采用除油和除锈处理,对表面要求过高时,进行磷化和钝化表面处理。黑色金属工件在阳极电泳前必须进行磷化处理,否则漆膜的耐腐蚀性能较差。磷化处理时,一般选用锌盐磷化膜,厚度约1~2μm,要求磷化膜结晶细而均匀。 (3)在过滤系统中,一般采用一级过滤,过滤器为网袋式结构,孔径为25~75μm。电泳涂料通过立式泵输送到过滤器进行过滤。从综合更换周期和漆膜质量等因素考虑,孔径50μm的过滤袋最佳,它不但能满足漆膜的质量要求,而且解决了过滤袋的堵塞问题。 (4)电泳涂装的循环系统循环量的大小,直接影响着槽液的稳定性和漆膜的质量。加大循环量,槽液的沉淀和气泡减少;但槽液老化加快,能源消耗增加,槽液的稳定性变差。将槽液的循环次数控制6~8次/h较为理想,不但保证漆膜质量,而且确保槽液的稳定运行。

变性与非变性聚丙烯酰胺的区别

非变性和变性聚丙烯酰胺凝胶的区别?“变性”体 现在哪里? 作者: 墨池(站内联系TA)收录: 2011-07-31 发布: 2011-07-21 1 非变性和变性聚丙烯酰胺凝胶的区别?“变性”体现在哪里? 2 SRAP标记用6%聚丙烯酰胺凝胶电泳,是变性还是非变性?配方是什么?配胶时,过硫酸铵是不是要最后加入? 谢谢(*^__^*) 嘻嘻 收、蛋白质分子量测定会使用变性PAGE,而DNA跑PAGE通常是采用非变性PAGE,另外回收活性蛋白也有用非变性PAGE的。 2. SRAP(貌似叫什么...相关序列扩增多态性)标记这个应该是非变性PAGE,6%的PAGE胶配方就不用发了吧,google一下一大堆。TEMED和过硫酸铵都是最 Originally posted by holyala at 2011-07-21 2121: 1. 变性胶加尿素或者其他变性剂,非变性胶是不加的。一般做RNA分离或回收、蛋白质分子量测定会使用变性PAGE,而DNA跑PAGE通常是采用非变性PAGE,另外回收活性蛋白也有用非变性PAGE的。 2. SRAP(貌似叫什么...相 ... Originally posted by 墨池 at 2011-07-21 2138: TEMED和过硫酸铵的先后呢? Originally posted by 墨池 at 2011-07-21 2019: 1 非变性和变性聚丙烯酰胺凝胶的区别?“变性”体现在哪里?

2 SRAP标记用6%聚丙烯酰胺凝胶电泳,是变性还是非变性?配方是什么?配胶时,过硫酸铵是不是要最后加入? 谢谢(*^__^*) 嘻嘻 1. “变性”体现在聚丙烯酰胺凝胶中加入尿素(一般跑DNA)或SDS(一般跑蛋白),另外,如果样品也要变性(DNA的loanding buffer也与普通的琼脂糖电泳所用的不同,同理所用Marker也不同;蛋白也要变性)。 2.SRAP一般用变性的聚丙烯酰胺,毕竟片段还是比较小。 3.配胶时不用加入过硫酸铵,灌胶前同时加入过硫酸铵(注意有毒!低温保存)和TEMED(也有毒,特臭)。 另外,这些问题貌似分子克隆那本书非常详细,只不过SRAP标记较新而已,没 Originally posted by changes at 2011-07-21 2107: 1. “变性”体现在聚丙烯酰胺凝胶中加入尿素(一般跑DNA)或SDS(一般跑蛋白),另外,如果样品也要变性(DNA的loanding buffer也与普通的琼脂糖电泳所用的不同,同理所用Marker也不同;蛋白也要变性)。 2.SRAP一般 ... Originally posted by 墨池 at 2011-07-21 2104: 你说SRAP是变性的,我看师姐的配胶过程没有一点体现变性的物质。 非变性胶也可以,但是分辨率会低些。另外,你是用SRAP标记做什么的,多态 Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-07-22 0727: APS和TEMED虽然不好,但也比不上丙烯酰胺有神经毒性,可随皮肤渗入人体,所以我是什么东西都加完之后最后加丙烯酰胺。 ...额~~话说我们一般都是把丙烯酰胺和甲叉丙烯酰胺配成40%的母液,用的时候根据所需要的浓度加一定量的母液即可。要是每次都搞丙烯酰胺来配,那谁

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