WHONET 微生物中英文对照及其代码
WHONET 微生物中英文对照及其代码常见细菌中英文对照、菌组、菌属及代码（革兰阴性部
分）代码革兰英文名称中文名称细菌分类菌属
139-Vibrio cholerae O139 霍乱弧菌O139 血清型FERM弧菌属157-Escherichia coli O157:H7 大肠埃希菌O157:H7EBC 埃希菌属aba-Acinetobacter baumannii 鲍曼不动杆菌NFR 不动杆菌属abu-Arcobacter butzleri 比茨莱弓形菌GNCB 弓形菌属ac--Acinetobacter sp.不动杆菌属NFR 不动杆菌属aca-Acinetobacter calcoaceticus 醋酸钙不动杆菌NFR 不动杆菌属acb-Actinobacillus sp.放线杆菌属GNCB 放线杆菌属ach-Achromobacter sp.无色杆菌属NFR 无色杆菌属acv-Aeromonas caviae 豚鼠气单胞菌FERM 气单胞菌属acx-Acidovorax sp.食酸菌属NFR 食酸菌属acy-Arcobacter cryaerophilus 嗜低温弓形菌GNCB 弓形菌属ade-Alcaligenes xylosoxidans ss. denitrificans 反硝化无色杆菌NFR 无色杆菌属adf-Acidovorax delafieldii 德拉菲尔德食酸菌NFR 食酸菌属adf-Pseudomonas delafieldii 德拉菲尔德食酸菌NFR 食酸菌属aeh-Aeromonas hydrophila 嗜水气单胞菌FERM 气单胞菌属aeq-Actinobacillus equuli 马驹放线杆菌马驹亚种GNCB 放线杆菌属aer-Aeromonas sp.气单胞菌属FERM 气单胞菌属aeu-Aeromonas eucrenophila 嗜矿泉气单胞菌FERM 气单胞菌属afa-Alcaligenes odorans 香味类香味菌NFR 产碱杆菌属afc-Acidovorax facilis 速生食酸菌NFR 食酸菌属afc-Pseudomonas facilis 速生食酸菌NFR 食酸菌属afd-Afipia clevelandensis 克利夫兰阿菲波菌GNCB 阿菲波菌属afi-Afipia sp.阿菲波菌属GNCB 阿菲波菌属afo-Afipia broomeae 布氏阿菲波菌GNCB 阿菲波菌属agr-Agrobacterium sp.根瘤菌属NFR 根瘤菌属aha-Acinetobacter haemolyticus 溶血不动杆菌NFR 不动杆菌属aja-Aeromonas jandaei 让达气单胞菌FERM 气单胞菌属ajo-Acinetobacter johnsonii 约氏不动杆菌NFR 不动杆菌属aju-Acinetobacter junii 琼氏不动杆菌NFR 不动杆菌属alc-Alcaligenes sp.
产碱杆菌属NFR 产碱杆菌属ali-Actinobacillus lignieresii 利尼埃放线杆菌GNCB 放线杆菌属alm-Alteromonas sp.交替单胞菌属check 交替单胞菌属alw-Acinetobacter lwoffii 鲁氏不动杆菌NFR 不动杆菌属aly-Alysiella sp.小链球菌check 小链球菌amd-Aeromonas media 中间气单胞菌FERM 气单胞菌属ant-Arcobacter nitrofigilis 固氮弓形菌GNCB 弓形菌属apf-Afipia felis 猫阿菲波菌GNCB 阿菲波菌属api-Alcaligenes piechaudii 皮埃肖无色杆菌NFR 产碱杆菌属apl-Actinobacillus pleuropneumoniae 胸膜肺炎放线杆菌GNCB 放线杆菌属apl-Haemophilus pleuropneumoniae 胸膜肺炎放线杆菌GNCB 放线杆菌属apn-Aeromonas punctata 斑点气单胞菌斑点亚种FERM 气单胞菌属apn-Aeromonas punctata ss. punctata 斑点气单胞菌斑点亚种FERM 气单胞菌属arc-Arcobacter sp.弓形菌属GNCB 弓形菌属ari-Arizona sp.亚利桑那菌属EBC 沙门菌属
asa-Aeromonas salmonicida 杀鲑气单胞菌FERM 气单胞菌属asb-Aeromonas veronii biovar sobria 温和气单胞菌FERM 气单胞菌属ash-Aeromonas schubertii 舒氏气单胞菌FERM 气单胞菌属aso-Aeromonas sobria 温和气单胞菌FERM 气单胞菌属asu-Actinobacillus suis 猪放线杆菌GNCB 放线杆菌属atm-Acidovorax temperans 中等食酸菌NFR 食酸菌属atr-Aeromonas trota 肠棕气单胞菌FERM 气单胞菌属atu-
Agrobacterium radiobacter 放射杆菌根瘤菌NFR atu-Rhizobium radiobacter 放射杆菌根瘤菌NFR aur-Actinobacillus ureae 脲放线杆菌GNCB 放线杆菌属aur-Pasteurella ureae 脲放线杆菌GNCB 放线杆菌属ave-Aeromonas veronii 维龙气单胞菌FERM 气单胞菌属avv-Aeromonas veronii biovar veronii 维龙气单胞菌FERM 气单胞菌属axy-Alcaligenes xylosoxidans 木糖氧化无色杆菌木糖氧化亚种NFR 产碱杆菌属axy-Alcaligenes xylosoxidans ss. xylosoxidans 木糖氧化无色杆菌木糖氧化亚种NFR 无色杆菌属b01-Shigella boydii serotype 1 鲍氏志贺菌血清 1 型EBC 志贺菌属b02-Shigella boydii serotype 2 鲍氏志贺菌血清2 型EBC 志贺菌属b03-Shigella boydii serotype 3 鲍氏志贺菌血清 3 型EBC 志贺菌属b04-Shigella boydii serotype 4 鲍氏志贺菌血清 4
型EBC 志贺菌属b05-Shigella boydii serotype 5 鲍氏志贺菌血清 5 型EBC 志贺菌属
b06-Shigella boydii serotype 6 鲍氏志贺菌血清6 型EBC 志贺菌属b07-Shigella boydii serotype 7 鲍氏志贺菌血清7 型EBC 志贺菌属b08-Shigella boydii serotype 8 鲍氏志贺菌血清8 型EBC 志贺菌属b09-Shigella boydii serotype 9 鲍氏志贺菌血清9
型EBC 志贺菌属b10-Shigella boydii serotype 10 鲍氏志贺菌血清10 型EBC 志贺菌属b11-Shigella boydii serotype 11 鲍氏志贺菌血清11 型EBC 志贺菌属b12-Shigella boydii serotype 12 鲍氏志贺菌血清12 型EBC 志贺菌属b13-Shigella boydii serotype 13 鲍氏志贺菌血清13 型EBC 志贺菌属b14-Shigella boydii serotype 14 鲍氏志贺菌血清14 型EBC 志贺菌属b15-Shigella boydii serotype 15 鲍氏志贺菌血清15 型EBC 志贺菌属b16-Shigella boydii serotype 16 鲍氏志贺菌血清16 型EBC 志贺菌属b17-Shigella boydii serotype 17 鲍氏志贺菌血清17 型EBC 志贺菌属b18-Shigella boydii serotype 18 鲍氏志贺菌血清18 型EBC 志贺菌属baq-Budvicia aquatica 水生布戴约维采菌EBC 布戴约维采菌属bar-Bartonella sp.巴尔通体属GNCB 巴尔通体属bav-Bordetella avium 鸟鲍特菌GNCB 鲍特菌属bba-Bartonella bacilliformis 杆状巴尔通体check 巴尔通体属bbr-Bordetella bronchiseptica 支气管炎鲍特菌GNCB 鲍特菌属bca-Branhamella catarrhalis 卡他莫拉菌NFR 莫拉菌属bca-Moraxella (Branh.) catarrhalis 卡它摩拉菌NFR 莫拉菌属bd--Bordetella sp.鲍特菌属GNCB 鲍特菌属ber-Bergeyella sp.伯杰菌属NFR 伯杰菌属bez-Bartonella elizabethae 伊丽沙白巴尔通体GNCB 巴尔通体属bez-Rochalimaea elizabethae 伊丽沙白巴尔通体GNCB 巴尔通体属bgl-Burkholderia gladioli 唐菖蒲伯克霍尔德菌NFR 伯克霍尔德菌属bgl-Pseudomonas gladioli 唐菖蒲伯克霍尔德菌+B1447NFR 伯克霍尔德菌属bhe-Bartonella henselae 汉氏巴尔通体GNCB 巴尔通体属bhe-Rochalimaea henselae 汉氏巴尔通体(罗卡利马
体)GNCB 巴尔通体属bhm-Bordetella holmesii 霍氏鲍特菌GNCB 鲍特菌属bhz-Bordetella hinzii 欣茨鲍特菌GNCB 鲍特菌属bma-Burkholderia mallei 鼻疽伯克霍尔德菌NFR 伯克霍尔德菌属bma-Pseudomonas mallei 鼻疽伯克霍尔德菌NFR 伯克霍尔德菌属bmt-Brucella melitensis 马耳他布鲁菌GNCB 布鲁菌属boc-Bacteroides ochraceus 黄褐二氧化碳嗜纤维菌GNCB boc-Capnocytophaga ochracea 黄褐二氧化碳嗜纤维菌GNCB bpa-Bordetella parapertussis 副百日咳鲍特菌GNCB 鲍特菌属bpe-Bordetella pertussis 百日咳鲍特菌GNCB 鲍特菌属bqu-Bartonella quintana 五日热巴尔通体GNCB 巴尔通体属bqu-Rochalimaea quintana 五日热巴尔通体GNCB 巴尔通体属br--Brucella sp.布鲁菌属GNCB 布鲁菌属brv-Brevundimonas sp.短波单胞菌属NFR 短波单胞菌属bua-Buttiauxella sp.布丘菌属EBC 布丘菌属bud-Budvicia sp.布戴约维采菌属EBC 布戴约维采菌属buk-Burkholderia sp.伯克霍尔德菌属NFR 伯克霍尔德菌属bvi-
Rochalimaea vinsonii 文森巴尔通体GNCB 巴尔通体属bvi-Bartonella vinsonii 文氏巴尔通体文氏亚种GNCB 巴尔通体属c10-Citrobacter genomospecies 10 柠檬酸杆菌基因种10EBC 柠檬酸杆菌属c11-Citrobacter genomospecies 11 柠檬酸杆菌基因种11EBC 柠檬酸杆菌属c2c-Flavobacterium group IIc 黄杆菌IIc 生物群NFR 黄杆菌属c2e-Flavobacterium group IIe 黄杆菌IIe 生物群NFR 黄杆菌属c2h-Flavobacterium group IIh 黄杆菌IIh 生物群NFR 黄杆菌属c2i-Flavobacterium group IIi 黄杆菌IIi 生物群NFR 黄杆菌属c4d-Pseudomonas-like group 2 类假单胞菌 2 型NFR 假单胞菌属cac-Comamonas acidovorans 食酸代尔夫特菌NFR cac-Delftia acidovorans 食酸代尔
夫特菌cac-Pseudomonas acidovorans 食酸代尔夫特菌NFR 丛毛单胞菌属caj-Campylobacter jejuni 空肠弯曲菌空肠亚种GNCB 弯曲菌属caj-Campylobacter jejuni ss. jejuni 空肠弯曲菌空肠亚种GNCB 弯曲菌属cam-Campylobacter sp.弯曲菌属GNCB 弯曲菌属cap-Capnocytophaga sp.二氧化碳嗜纤维菌属GNCB car-Cardiobacterium sp.心杆菌属HAK 心杆菌属cas-Capnocytophaga sputigena 生痰二氧化碳嗜纤维菌GNCB cbb-Campylobacter sputorum ss. bulbulus 唾液弯曲菌牛生物变种GNCB 弯曲菌属
cbk-Citrobacter braakii 布拉克柠檬酸杆菌EBC 柠檬酸杆菌属cbt-Coxiella burnetii 伯氏考克斯体（立克次体）GNCB 考克斯体属ccm-Capnocytophaga canimorsus 狗咬二氧化
碳嗜纤维菌GNCB cco-Campylobacter coli 大肠弯曲菌GNCB 弯曲菌属ccy-Capnocytophaga cynodegmi 犬咬二氧化碳嗜纤维菌GNCB cda-Cedecea davisae 戴维斯西地西菌EBC 西地西菌属cdi-Citrobacter diversus 差异柠檬酸杆菌EBC 柠檬酸杆菌属ce3-Cedecea sp. 3 西地西菌3EBC 西地西菌属ce5-Cedecea sp. 5 西地西菌5EBC 西地西菌属ced-Cedecea sp.西地西菌属EBC 西地西菌属cfa-Citrobacter farmeri 法默柠檬
酸杆菌EBC 柠檬酸杆菌属cfe-Campylobacter fetus 胎儿弯曲菌胎儿亚种GNCB 弯曲菌属cfe-Campylobacter fetus ss. fetus 胎儿弯曲菌胎儿亚种GNCB 弯曲菌属cfr-Citrobacter freundii 弗劳地柠檬酸杆菌EBC 柠檬酸杆菌属cfv-Campylobacter fetus ss. venerealis 胎儿弯曲菌性病亚种GNCB 弯曲菌属cgi-Capnocytophaga gingivalis 牙龈二氧化碳嗜纤维菌GNCB cgn-Capnocytophaga granulosa 颗粒二氧化碳嗜纤维菌GNCB cgr-Calymmatobacterium granulomatis 肉芽肿鞘杆菌GNCB 鞘杆菌属chb-Chryseobacterium sp.金黄杆菌属NFR 金黄杆菌属chc-Capnocytophaga haemolytica 溶血二氧化碳嗜纤维菌GNCB chl-Chlamydia sp.衣原体属GNCB 衣原体属chm-Chromobacterium sp.色杆菌属FERM 色杆菌属cho-Cardiobacterium hominis 人心杆菌HAK 心杆菌属chr-Chryseomonas sp.金色单胞菌属check 金色单胞菌属cht-Chlamydia trachomatis 沙眼衣原体GNCB 衣原体属chy-Campylobacter hyointestinalis 豚肠弯曲菌GNCB 弯曲菌属ci--Citrobacter sp.柠檬酸杆菌属EBC 柠檬酸杆菌属ci9-Citrobacter genomospecies 9 柠檬酸杆菌基因种9EBC 柠檬酸杆菌属cj1-Campylobacter jejuni biotype 1 空肠弯曲菌生物1 型GNCB 弯曲菌属cj2-Campylobacter jejuni biotype 2 空肠弯曲菌生物2 型GNCB 弯曲菌属cjd-Campylobacter jejuni ss. doylei 空肠弯曲菌德莱亚种GNCB 弯曲菌属cle-Cedecea lapagei 拉氏西地西菌EBC 西地西菌属clr-Campylobacter laridis 海鸟弯曲菌GNCB 弯曲菌属clr-Campylobacter lari 红嘴鸥弯曲菌GNCB 弯曲菌属clt-Chryseomonas luteola 浅黄假单胞菌check 金色单胞菌属clt-Pseudomonas luteola 浅黄假单胞菌check 金色单胞菌属cmb-Calymmatobacterium sp.鞘杆菌属GNCB 鞘杆菌属cml-Citrobacter amalonaticus 无丙二酸柠檬酸杆菌EBC 柠檬酸杆菌属cmu-Campylobacter
mucosalis 粘膜弯曲菌GNCB 弯曲菌属cnt-Cedecea neteri 内特西地西菌EBC 西地西菌属cnt-Cedecea sp. 4 西地西菌4EBC 西地西菌属com-Comamonas sp.丛毛单胞菌属NFR 丛毛单胞菌属cox-Coxiella sp.考克斯体属GNCB 考克斯体属cpn-Chlamydia pneumoniae 肺炎嗜衣原体GNCB cpn-Chlamydophila pneumoniae 肺炎嗜衣原体GNCB cpt-Chlamydia psittaci 鹦鹉热嗜衣原体GNCB cpt-Chlamydophila psittaci 鹦鹉热嗜衣原体GNCB csk-Citrobacter sedlakii 塞德拉克柠檬酸杆菌EBC 柠檬酸杆菌属ctg-Comamonas terrigena 土生丛毛单胞菌NFR 丛毛单胞菌属cts-Comamonas testosteroni 睾丸酮丛毛单胞菌NFR 丛毛单胞菌属cts-Pseudomonas testosteroni 睾丸酮丛毛单胞菌NFR 丛毛单胞菌属cup-Campylobacter upsaliensis 乌普萨拉弯曲菌GNCB 弯曲菌属cvb-Pseudomonas stutzeri-like 类斯氏假单胞菌NFR 假单胞菌属cvi-Chromobacterium violaceum 紫色色杆菌FERM 色杆菌属cwe-Citrobacter werkmanii 沃克曼柠檬酸杆菌EBC 柠檬酸杆菌属cyo-Citrobacter youngae 杨氏柠檬酸杆菌EBC 柠
檬酸杆菌属d01-Shigella dysenteriae serotype 1 痢疾志贺菌血清 1 型EBC 志贺菌属
d02-Shigella dysenteriae serotype 2 痢疾志贺菌血清2 型EBC 志贺菌属d03-Shigella dysenteriae serotype 3 痢疾志贺菌血清3 型EBC 志贺菌属d04-Shigella dysenteriae serotype 4 痢疾志贺菌血清4 型EBC 志贺菌属d05-Shigella dysenteriae serotype 5 痢疾志贺菌血清 5 型EBC 志贺菌属d06-Shigella dysenteriae serotype 6 痢疾志贺菌血清 6 型EBC 志贺菌属d07-Shigella dysenteriae serotype 7 痢疾志贺菌血清7 型EBC 志贺菌属d08-Shigella dysenteriae serotype 8 痢疾志贺菌血清8 型EBC 志贺菌属
d09-Shigella dysenteriae serotype 9 痢疾志贺菌血清9 型EBC 志贺菌属d10-Shigella dysenteriae serotype 10 痢疾志贺菌血清10 型EBC 志贺菌属d11-Shigella dysenteriae serotype 11 痢疾志贺菌血清11 型EBC 志贺菌属d12-Shigella dysenteriae serotype 12 痢疾志贺菌血清12 型EBC 志贺菌属d13-Shigella dysenteriae serotype 13 痢疾志贺菌血清13 型EBC 志贺菌属d14-Shigella dysenteriae serotype 14 痢疾志贺菌血清14 型EBC 志贺菌属d15-Shigella dysenteriae serotype 15 痢疾志贺菌血清15 型EBC 志贺菌属e26-Bordetella-like species 类鲍特菌GNCB 鲍特菌属ea1-Enterobacter amnigenus 1 河生肠杆菌生物1 型EBC 肠杆菌属ea2-Enterobacter amnigenus 2 河生肠杆菌生物2 型EBC 肠杆菌属ead-Escherichia coli (alkalescens-dispar)大肠埃希菌(产碱殊异株)EBC 埃希菌属eae-Enterobacter aerogenes 产气肠杆菌EBC 肠杆菌属eag-Enterobacter agglomerans 成团泛菌EBC 泛菌属eag-Pantoea agglomerans 成团泛菌EBC 泛菌属eal-Erwinia amylovora 解淀粉欧文氏菌EBC 欧文菌属eam-Enterobacter amnigenus 河生肠杆菌EBC 肠杆菌属ear-Ewingella americana 美洲爱文菌EBC 爱文菌属eas-Enterobacter asburiae 阿氏肠杆菌EBC 肠杆菌属ebl-Escherichia blattae 蟑螂埃希菌EBC 埃希菌属ebr-Empedobacter brevis 短稳杆菌NFR 稳杆菌属ebr-Flavobacterium breve 短稳杆菌NFR 稳杆菌属ece-Erwinia carnegieana 大仙人掌欧文菌EBC 欧文菌属ecg-Enterobacter taylorae 生癌肠杆菌EBC 肠杆菌属ecl-Enterobacter cloacae 阴沟肠杆菌阴沟亚种EBC 肠杆菌属eco-Escherichia coli 大肠埃希菌EBC 埃希菌属ecr-Eikenella corrodens 啮蚀艾肯菌HAK 艾肯菌属ect-Erwinia carotovora 胡萝卜软腐病解果胶杆菌胡萝卜软腐亚种EBC 欧文菌属edi-Enterobacter dissolvens 阴沟肠杆菌液化亚种EBC 肠杆菌属edw-Edwardsiella sp.爱德华菌属EBC 爱德华菌属efe-Escherichia fergusonii 弗格森埃希菌EBC 埃希菌属egg-Enterobacter gergoviae 日沟维肠杆菌EBC 肠杆菌属ehc-
Ehrlichia canis 犬埃里希体GNCB 埃里希体属ehe-Escherichia hermannii 赫氏埃希菌EBC 埃希菌属ehf-Ehrlichia chaffeensis 恰菲埃里希体GNCB 埃里希体属ehm-Enterobacter hormaechei 霍尔姆肠杆菌EBC 肠杆菌属eho-Edwardsiella hoshinae 保科爱德华菌EBC 爱德华菌属ehr-Ehrlichia sp.埃里希体属GNCB 埃里希体属ehs-Ehrlichia sennetsu 腺热埃里希体GNCB 埃里希体属eic-Edwardsiella ictaluri 鲶鱼爱德华菌EBC 爱德华菌属eik-Eikenella sp.艾肯菌属HAK 艾肯菌属ein-Enterobacter intermedius 中间肠杆菌EBC 肠杆菌属emp-Empedobacter sp.稳杆菌属NFR 稳杆菌属en--Enterobacter sp.肠杆菌属EBC 肠杆菌属enp-Enterobacter nimipressuralis 超压肠杆菌EBC 肠杆菌属erw-Erwinia sp.欧文菌属EBC 欧文菌属esa-Enterobacter sakazakii 阪崎肠杆菌EBC 肠杆菌属esc-Escherichia sp.埃希菌属EBC 埃希菌属eta-Edwardsiella tarda 迟钝爱德华菌EBC 爱德华菌属evu-Escherichia vulneris 伤口埃希菌EBC 埃希菌属ewi-Ewingella sp.爱文菌属EBC 爱文菌属f01-Shigella flexneri serotype
1 福氏志贺菌血清1 型EBC 志贺菌属f02-Shigella flexneri serotype
2 福氏志贺菌血清
2 型EBC 志贺菌属f03-Shigella flexneri serotype
3 福氏志贺菌血清3 型EBC 志贺菌属f04-Shigella flexneri serotype
4 福氏志贺菌血清4 型EBC 志贺菌属f05-Shigella flexneri serotype
5 福氏志贺菌血清5 型EBC 志贺菌属f06-Shigella flexneri serotype
6 福氏志贺菌血清6 型EBC 志贺菌属f1a-Shigella flexneri serotype 1a 福氏志贺菌1a 血清型EBC 志贺菌属f1b-Shigella flexneri serotype 1b 福氏志贺菌1b 血清型EBC 志贺菌属f2a-Shigella flexneri serotype 2a 福氏志贺菌2a 血清型EBC 志贺菌属f2b-Shigella flexneri serotype 2b 福氏志贺菌2b 血清型EBC 志贺菌属f3a-Shigella flexneri serotype 3a 福氏志贺菌3a 血清型EBC 志贺菌属f3b-Shigella flexneri serotype 3b 福氏志贺菌3b 血清型EBC 志贺菌属f4a-Shigella flexneri serotype 4a 福氏志贺菌4a 血清型EBC 志贺菌属f4b-Shigella flexneri serotype 4b 福氏志贺菌4b 血清型EBC 志贺菌属f4c-Shigella flexneri serotype 4c 福氏志贺菌4c 血清型EBC 志贺菌属f5a-Shigella flexneri serotype 5a 福氏志贺菌5a 血清型EBC 志贺菌属f5b-Shigella flexneri serotype 5b 福氏志贺菌5b 血清型EBC 志贺菌属fgl-Chryseobacterium gleum 粘金黄杆菌NFR 金黄杆菌属fgl-Flavobacterium gleum 粘金黄杆菌NFR 金黄杆菌属fho-Francisella tularensis ss. holarctica 土拉热弗郎西斯菌全北区亚种GNCB 弗郎西斯菌属fin-Chryseobacterium indologenes 产吲哚金黄杆菌NFR 金黄杆菌属fin-Flavobacterium indologenes 吲哚金黄杆菌NFR 金黄杆菌属fla-Flavobacterium sp.黄杆菌属NFR 黄杆菌属flu-Fluoribacter sp.荧光杆菌属check 荧光杆菌属flv-Flavimonas sp.黄单胞菌属check 黄单胞菌属fmd-Francisella tularensis ss. mediasiatica 土拉热弗郎西斯菌中亚细亚亚种GNCB 弗郎西斯菌属fme-Chryseobacterium meningosepticum 脑膜败血伊丽莎白金菌NFR 金黄杆菌属fme-Elizabethkingia meningosepticum 脑膜败血伊丽莎白金菌NFR fme-Flavobacterium meningosepticum 脑膜败血伊丽莎白金菌NFR 金黄杆菌属fmz-Flavobacterium mizutaii 水氏黄杆菌NFR 黄杆菌属fmz-Sphingobacterium mizutae 水田黄杆菌NFR 黄杆菌属fnv-Francisella novicida 新凶手弗郎西斯菌GNCB 弗郎西斯菌属fod-Flavobacterium odoratum 香味类香味菌NFR for-Flavimonas oryzihabitans 栖稻假单胞菌check 黄单胞菌属for-Pseudomonas oryzihabitans 栖稻假单胞菌check 黄单胞菌属fph-Francisella philomiragia 蜃楼弗郎西斯菌GNCB 弗郎西斯菌属fph-Yersinia philomiragia 蜃楼弗郎西斯菌GNCB 弗郎西斯菌属fpl-Francisella tularensis Type B 土拉热弗郎西斯菌B 型GNCB 弗郎西斯菌属fra-
Francisella sp.弗郎西斯菌属GNCB 弗郎西斯菌属fth-Flavobacterium thalpophilum 嗜温鞘氨醇杆菌NFR 鞘氨醇杆菌属fth-Sphingobacterium thalpophilum 嗜温鞘氨醇杆菌NFR 鞘氨醇杆菌属ftu-Francisella tularensis 土拉热弗郎西斯菌GNCB 弗郎西斯菌属ftu-Francisella tularensis Type A 土拉热弗郎西斯菌A 型GNCB 弗郎西斯菌属ftu-Francisella tularensis ss. tularensis 土拉热弗郎西斯菌土拉热亚种GNCB 弗郎西斯菌属gm--Gram negative bacteria 革兰阴性gnc-Gram negative cocci 革兰阴性球菌GNC gne-Gram negative enteric organism 革兰阴性肠道菌EBC gnr-Gram negative rods 革兰阴性杆菌GNR ha--Haemophilus sp.嗜血杆菌属GNCB 嗜血杆菌属hac-Actinobacillus actinomycetemcomitans 伴放线菌凝聚杆菌HAK hac-Haemophilus actinomycetemcomitans 伴放线凝聚杆菌HAK haf-Hafnia sp.哈夫尼亚菌属EBC 哈夫尼亚菌属hag-Haemophilus aegyptius 埃及嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hal-Hafnia alvei 蜂房哈夫尼亚菌EBC 哈夫尼亚菌属hap-Haemophilus aphrophilus 嗜沫凝聚杆菌HAK 嗜血杆菌属hap-Haemophilus paraphrophilus 副嗜沫凝聚杆菌HAK 嗜血杆菌属hdu-Haemophilus ducreyi 杜克嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hel-Helicobacter sp.螺杆菌属GNCB 螺杆菌属heq-Haemophilus equigenitalis 马生殖器泰勒菌check 泰勒菌属heq-Taylorella equigenitalis 马生殖器泰勒菌check 泰勒菌属hfe-Helicobacter felis 猫螺杆菌GNCB 螺杆菌属hfn-Campylobacter fennelliae 芬内尔螺杆菌GNCB 螺杆菌属hha-Haemophilus haemoglobinophilus 嗜血红素嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hhe-Haemophilus haemolyticus 溶血嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hib-Haemophilus influenzae (type b)流感嗜血杆菌(b 型)GNCB 嗜血杆菌属hin-Haemophilus influenzae 流感嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hmu-Helicobacter mustelae 红嘴欧螺杆菌GNCB 螺杆菌属hne-Helicobacter nemestrinae 幽门螺杆菌GNCB 螺杆菌属hpc-Haemophilus paracuniculus 副兔嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hpg-Haemophilus paragallinarum 类鹑鸡鸟杆菌GNCB 嗜血杆菌属hph-Haemophilus parahaemolyticus 副溶血嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hpi-Haemophilus parainfluenzae 副流感嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hpl-Haemophilus paraphrohaemolyticus 副溶血嗜沫嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hpr-Haemophilus parasuis 副猪嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hpu-Helicobacter pullorum 幼禽螺杆菌GNCB 螺杆菌属hpy-Helicobacter pylori 幽门螺杆菌GNCB 螺杆菌属hse-Haemophilus segnis 惰性凝聚杆菌HAK hxb-Haemophilus influenzae (not type b)非b 型流感嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属hxt-Haemophilus influenzae (not typable)未分型流感嗜血杆菌GNCB 嗜血杆菌属inf-Salmonella Infantis 沙门菌婴儿血清型EBC 沙门菌属kas-Kluyvera ascorbata 抗坏血酸克吕沃菌EBC 克吕沃菌属kcr-Kluyvera cryocrescens 栖冷克吕沃菌EBC 克吕沃菌属kde-Kingella denitrificans 脱硝金菌HAK 金菌属kin-Kingella sp.金菌属HAK 金菌属kki-Kingella kingae 金氏金菌HAK 金菌属kl--Klebsiella sp.克雷伯菌属EBC 克雷伯菌属klu-Kluyvera sp.克吕沃菌属EBC 克吕沃菌属kol-Kingella oralis 口金菌HAK 金菌属kor-Klebsiella ornithinolytica 解鸟氨酸拉乌尔菌EBC 克雷伯菌属kor-Klebsiella Enteric Group 47 克雷伯菌肠道菌群47 型EBC 克雷伯菌属kox-Klebsiella oxytoca 产酸克雷伯菌EBC 克雷伯菌属koz-Klebsiella ozaenae 肺炎克雷伯菌臭鼻亚种EBC 克雷伯菌属koz-Klebsiella pneumoniae ss. ozaenae 肺炎克雷伯菌臭鼻亚种EBC 克雷伯菌属kpl-Klebsiella trevisanii 植生拉乌尔菌EBC 克雷伯菌属
kpn-Klebsiella pneumoniae 肺炎克雷伯菌EBC 克雷伯菌属kpn-Klebsiella pneumoniae ss. pneumoniae 肺炎克雷伯菌肺炎亚种EBC 克雷伯菌属krn-Klebsiella
rhinoscleromatis 鼻硬结克雷伯菌EBC 克雷伯菌属krn-Klebsiella pneumoniae ss. rhinoscleromatis 肺炎克雷伯菌鼻硬结亚种EBC 克雷伯菌属
kte-Klebsiella terrigena 土生拉乌尔菌EBC 克雷伯菌属laa-Legionella anisa 不同军团菌GNCB 军团菌属lad-Escherichia adecarboxylata 非脱羧勒克菌EBC 勒克菌属lad-Leclercia adecarboxylata 非脱羧勒克菌EBC 勒克菌属lan-Listonella anguillarum 鳗利斯顿菌check 利斯顿菌属lbi-Legionella birminghamensis 伯明翰军团菌GNCB 军团菌属lbn-Legionella brunensis 布吕嫩军团菌GNCB 军团菌属lbo-Fluoribacter bozemanii 博兹曼荧光杆菌check 荧光杆菌属lbo-Legionella bozemanii 博兹曼荧光杆菌check 荧光杆菌属lch-Legionella cherrii 彻氏军团菌GNCB 军团菌属lcn-Legionella cincinnatiensis 辛辛那提军团菌GNCB 军团菌属ldu-Fluoribacter dumoffii 迪莫夫荧光杆菌check 荧光杆菌属ldu-Legionella dumoffii 杜莫夫荧光杆菌check 荧光杆菌属lec-Leclercia sp.勒克菌属EBC 勒克菌属leg-Legionella sp.军团菌属GNCB 军团菌属lem-Leminorella sp.勒米诺菌属EBC 勒米诺菌属len-Legionella pneumophila 嗜肺军团菌GNCB 军团菌属len-Legionella pneumophila ss. pneumophila 嗜肺军团菌嗜肺亚种GNCB 军团菌属ler-Legionella erythra 艾里塔拉军团菌GNCB 军团菌属lfr-Legionella pneumophila ss. fraseri 嗜肺军团菌弗雷泽亚种GNCB 军团菌属lge-Legionella geestiae 吉斯特军团菌GNCB 军团菌属lgo-Fluoribacter gormanii 戈尔曼荧光杆菌check 荧光杆菌属lgo-Legionella gormanii 戈曼荧光杆菌check 荧光杆菌属lgr-Leminorella grimontii 格利蒙勒米诺菌EBC 勒米诺菌属lha-Legionella hackeliae 哈开理军团菌GNCB 军团菌属lir-Legionella israelensis 以色列军团菌GNCB 军团菌属lit-Listonella sp.利斯顿菌属check 利斯顿菌属lja-Legionella jamestowniensis 詹姆斯敦军团菌GNCB 军团菌属ljr-Legionella jordanis 约旦军团菌GNCB 军团菌属llg-Legionella lansingensis 兰斯格军团菌GNCB 军团菌属lln-Legionella londoniensis 伦敦军团菌GNCB 军团菌属llo-Legionella longbeachae 长滩军团菌GNCB 军团菌属lma-Legionella maceachernii 麦凯克伦埃特洛克菌check 埃特洛克菌属lma-Tatlockia maceachernii 麦凯克伦埃特洛克菌check 埃特洛克菌属lmc-Legionella micdadei 麦克达德埃特洛克菌check 埃特洛克菌属lmc-Tatlockia micdadei 麦克达德埃特洛克菌check 埃特洛克菌属lmr-Legionella moravica 摩拉维采军团菌GNCB 军团菌属lna-Legionella nautarum 水手军团菌GNCB 军团菌属lok-Legionella oakridgensis 橡树岭军团菌GNCB 军团菌属lpa-Legionella parisiensis 巴黎军团菌GNCB 军团菌属lpc-Legionella pneumophila ss. pascullei 嗜肺军团菌牧场亚种GNCB 军团菌属lpe-Listonella pelagia 海利斯顿菌check 利斯顿菌属
lqi-Legionella quinlivanii 昆里万军团菌GNCB 军团菌属lqu-Legionella quateirensis 考特拉军团菌GNCB 军团菌属lri-Leminorella richardii 理查德勒米诺菌EBC 勒米诺菌属
lru-Legionella rubrilucens 红光军团菌GNCB 军团菌属lsc-Legionella santicrucis 卫生十字军团菌GNCB 军团菌属lsh-Legionella sainthelensi 赫伦荒原军团菌GNCB 军团菌属lsk-Legionella shakespearei 沙氏军团菌GNCB 军团菌属lsp-Legionella spiritensis 斯皮里特湖军团菌GNCB 军团菌属lst-Legionella steigerwaltii 斯太格尔沃特军团菌GNCB 军团菌属ltu-Legionella tucsonensis 图森军团菌GNCB 军团菌属lwa-Legionella wadsworthii 沃斯沃军团菌GNCB 军团菌属lwo-Legionella worsleiensis 沃斯利军团菌GNCB 军团菌属mat-Moraxella atlantae 亚特兰大莫拉菌NFR 莫拉菌属mbv-Moraxella bovis 牛莫拉菌NFR 莫拉菌属meb-Methylobacterium sp.甲基杆菌属NFR 甲基杆菌属mex-Methylobacterium extorquens 扭脱甲基杆菌NFR 甲基杆菌属mla-Moraxella lacunata 腔隙摩拉菌NFR 莫拉菌属mme-Methylobacterium mesophilicum 嗜中温甲基杆菌NFR 甲基杆菌属mme-Pseudomonas mesophilica 嗜中温甲基杆菌NFR 甲基杆菌属
…Topmargin：页面上边距列表标记 标题格式标记 1.无序
微生物：一类肉眼看不到货看不清，必需借助光学显微镜或电子显微镜才能观察的微小生物的总称。 微生物学：研究微生物生命现象及生命活动规律的科学。 细胞膜：紧贴着细胞壁内侧，包裹着细胞质的一层柔软的富有弹性的半透性薄膜。细胞质：细胞膜内具有一定流动性的除原核以外所有透明的、颗粒状或胶体状物质的总合。 原核：又称核质体、拟核、核区等，是原核生物所特有的无核膜结构的原始细胞核。它只有DNA，不与组蛋白结合。 内含物：细胞质内的颗粒状、胶质样物质的总称。 异染颗粒：又称迂回体，最初是在迂回罗军中发现的被美兰或甲苯胺兰染成红紫色而得名，为五级偏磷酸的聚合物。 鞭毛：生长在某些细菌表面的常丝状、波曲的蛋白附属物，据运动功能。 芽胞：某些细菌在其生长发育后期在胞内形成的圆形或椭圆形，壁厚、质浓含水量低，抗逆性强的休眠构造。 荚膜：某些细胞表面包被着的一层具有固定层次的透明的胶状物质。 菌落由单个微生物细胞经过繁殖而在固体培养基表面形成的肉眼可见的微生物集落，在平板上的称菌落 菌苔：，菌落由单个微生物细胞经过繁殖而在固体培养基表面形成的肉眼可见的微生物集落，在斜面上的称菌苔。 质粒：质粒是细菌染色体以外的遗传物质，能独立复制，为共价闭合环状双链DNA，分子量比染色体小，每个菌体内有一个或几个质粒，它分散在细胞质中或附着在染色体上。 菌丝：丝状真菌的结构单元，是一条具有分枝的管形丝状体，外由细胞璧包被，里面充满原生质和细胞核。幼时无色，老后常呈各种不同的颜色。 13、菌丝体：菌丝在基质上或基质中不断伸长和分枝，并由许多菌丝连结在一起所组成的整个营养体称菌丝体。 14、革兰氏染色：丹麦科学家Gram十九世纪八十年代发明的一种细菌染色法。染色方法为：在一个已固定的细菌涂片上用结晶紫染色，再加媒染剂 ---碘液处理，使菌体着色，然后用乙醇脱色，最后用蕃红复染。显微镜下菌体呈紫色者为G+细菌，菌体呈红色者为G-细菌。 15、LPS：脂多糖，G-细菌细胞壁外层的主要组分由类脂A、核心多糖、O-特意侧链三部分构成。 16、DAP：二氨基苯二酸，G-细胞壁太聚糖中存在的一种特殊氨基酸。 17、PHB：聚 -羟基丁酸，某些细菌中存在的一种可作为碳源和能源储藏物质。 18、异型胞：丝状蓝细菌中存在的一种特殊细胞，缺乏PSII，可进行不产氧的光合作用，细胞透明，壁厚具有固氮能力。 19、核糖体：核糖核蛋白体是核糖核酸和蛋白质的大分子化合物，是多肽和蛋白质合成的场所。 20、16S rRNA：原核细胞核糖体小亚基中的一种核糖核酸分子，沉降系数为16 S，
A/O法活性污泥中氨氧化菌群落的动态与分布 摘要: 我们研究了在厌氧—好氧序批式反应器（SBR)中氨氧化菌群落(AOB)和亚硝酸盐氧化菌群落(NOB)的结构活性和分布。在研究过程中,分子生物技术和微型技术被用于识别和鉴定这些微生物。污泥微粒中的氨氧化菌群落结构大体上与初始的接种污泥中的结构不同。与颗粒形成一起，由于过程条件中生物选择的压力,AOＢ的多样性下降了。DGGE测序表明，亚硝化菌依然存在,这是因为它们能迅速的适应固定以对抗洗涤行为。DGGE更进一步的分析揭露了较大的微粒对更多的AOB种类在反应器中的生存有好处。在SＢR反应器中有很多大小不一的微粒共存，颗粒的直径影响这AＯB和NOB的分布。中小微粒（直径<0．6ｍm）不能限制氧在所有污泥空间的传输。大颗粒(直径>０．9mm）可以使含氧量降低从而限制NＯB的生长。所有这些研究提供了未来对ＡOB微粒系统机制可能性研究的支持。 关键词:氨氧化菌(AＯB），污泥微粒,菌落发展，微粒大小,硝化菌分布，发育多样性 ?简介 在浓度足够高的条件下，氨在水环境中对水生生物有毒，并且对富营养化有贡献。因此,废水中氨的生物降解和去除是废水处理工程的基本功能。硝化反应,将氨通过硝化转化为硝酸盐,是去除氨的一个重要途径。这是分两步组成的，由氨氧化和亚硝酸盐氧化细菌完成。好氧氨氧化一般是第一步,硝化反应的限制步骤:然而,这是废水中氨去除的本质。对16S ｒRNA的对比分析显示，大多数活性污泥里的氨氧化菌系统的跟?-变形菌有关联。然而，一系列的研究表明,在氨氧化菌的不同代和不同系有生理和生态区别,而且环境因素例如处理常量,溶解氧，盐度,pH，自由氨例子浓度会影响氨氧化菌的种类。因此,废水处理中氨氧化菌的生理活动和平衡对废水处理系统的设计和运行是至关重要的。由于这个原因,对氨氧化菌生态和微生物学更深一层的了解对加强处理效果是必须的。当今,有几个进阶技术在废水生物处理系统中被用作鉴别、刻画微生物种类的有价值的工具。目前,分子生物技术的应用能提供氨氧化菌群落的详细分类说明。
Dreamweaver代码div+css Dreamweaver代码 基本结构标签: ,表示该文件为HTML文件
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属性是用来修饰标志的,属性放在开始标志内. 例:属性bgcolor="BLACK"表示背景色为黑色. 引用属性的例子: 表格标识的开始和结束. 属性: cellpadding=数值单位是像素,定义表元内距 cellspacing=数值单位是像素,定义表元间距 border=数值单位是像素,定义表格边框宽度 width=数值单位是像素或窗口百分比,定义表格宽度 background=图片链接地址,定义表格背景图
表格中一个表格行的开始和结束; 表格中行内一个单元格的开始和结束 属性:
2.2.3 字型设置标记 功能：设置文字的风格，如黑体、斜体、带下划线等，这是一组标记，它们可以单独使用，也可以混合使用产生复合修饰效果。常用的标记有以下一些： … ：文字以粗体显示。 … ：文字显示为斜体。 … ：显示下划线。 … ：删除线。 … ：使文字大小相对于前面的文字增大一级。 … ：使文字大小相对于前面的文字减小一级。 … ：使文字成为前一个字符的上标。 …：使文字成为前一个字符的下标。 ：使文字显示为闪烁效果。 …：以等宽体显示西文字符。 …：输出引用方式的字体，通常是斜体。 …：强调文字，通常用斜体加黑体。 …：特别强调的文字，通常也是斜体加黑体。 注：有些标记的效果必须在动态环境下才能显示，例如
A Abortive infection 顿挫感染 * Absorption 吸附 * Acid-fast bacilli 抗酸杆菌 Acquired immunity 获得性免疫 * Acquired immunodeficiency syndrome，AIDS 获得性免疫缺陷综合征* Actinomyces 放线菌属 Acute infection 急性感染 * Adenovirus 腺病毒 Adhesin 粘附素 A.flavus 黄曲霉 A. israelii 衣氏放线菌 * Anaerobic bacteria 厌氧性细菌 Anaerobic medium 厌氧培养基 Antibody dependent enhancement,ADE 抗体依赖的促进作用Antigenic drift 抗原漂移 Antigenic shift 抗原性转换 * Antisepsis 防腐 * Antistreptolysin O (ASO) test, 抗链球菌溶素O试验 Antiviral protein,AVP 抗病毒蛋白 Apoptosis 细胞凋亡 * Apparent infection 显性感染 Arbovirus 虫媒病毒 * Artificial active immunization 人工主动免疫 * Artificial passive immunization 人工被动免疫 * Asepsis 无菌 Aspergillus 曲霉 * Assembly and release 装备与释放 * Astrovirus 星状病毒 Autotroph 自养菌 * Attenuated vaccine 减毒疫苗 B * Bacillus 杆菌、芽胞杆菌属 * Bacillus anthracis 炭疽芽胞杆菌 Bacillus cereus 蜡样芽胞杆菌 * Bacteremia 菌血症 Bacterial infection 细菌感染 * Bacterial L form 细菌L型 * Bacteriocin 细菌素 * Bacteriophage 噬菌体 * Bacterium 细菌 Bartonella 巴尔通体属 * Bacteriodes fragilis 脆弱类杆菌
常见微生物 界（Domain）、门(Phylum)、纲（Class）、目(Order)、科(Family)、中英文对照(Species)、种(Genus)属界（Domain） Bacteria细菌 古生菌Archaea 门（Phylum） Proteobacteria变形菌门 Bacteroidetes拟杆菌门 Actinobacteria放线菌门 Gemmatimonadetes芽单胞菌门 Acidobacteria酸杆菌门 Planctomycetes浮霉菌门 Verrucomicrobia疣微菌门 Chloroflexi绿弯菌门 Nitrospirae硝化螺旋菌门 Firmicutes厚壁菌门 Chlorobi绿菌门 Cyanobacteria蓝藻细菌门 Fibrobacteres纤维杆菌门 Elusimicrobia迷踪菌门 Armatimonadetes装甲菌门 Euryarchaeota广古菌门 Chlamydiae衣原体 Crenarchaeota泉古菌门 Tenericutes无壁菌门 螺旋体属Spirochaetes 纲（Class） Alphaproteobacteria甲型（α）变形杆菌纲 Gammaproteobacteria丙型变形菌纲 Betaproteobacteriaβ-变形菌纲 Actinobacteria放线菌门、纲 Cytophagia纤维粘网菌 Gemmatimonadetes芽单胞菌门、纲 Deltaproteobacteriaδ-变形菌纲 Acidobacteria-6酸杆菌门
Acidimicrobiia酸微菌纲Verrucomicrobiae疣微菌纲Opitutae丰佑菌纲 Nitrospira消化螺菌属Thermomicrobia热微菌门Bacteroidia拟杆菌纲 Bacilli杆菌 Chloroflexi绿弯菌门Anaerolineae厌氧绳菌纲Clostridia梭状芽胞杆菌Elusimicrobia迷踪菌门Ktedonobacteria纤线杆菌纲Thermoplasmata热原体纲Chlamydiia衣原体Thaumarchaeota奇古菌门Mollicutes柔膜菌纲Methanomicrobia甲烷微菌纲Holophagae全噬菌纲 螺旋体属Spirochaetes 目（Order）Xanthomonadales黄单孢菌目Sphingomonadales鞘脂单胞菌目Burkholderiales伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales放线菌目Cytophagales噬纤维菌目Myxococcales粘球菌目Acidimicrobiales酸微菌目Rhizobiales根瘤菌目Sphingobacteriales鞘脂杆菌目Flavobacteriales黄杆菌目Caulobacterales柄杆菌目Rhodospirillales红螺菌目Alteromonadales交替单胞菌目Enterobacteriales肠杆菌目Verrucomicrobiales疣微菌目Opitutales丰佑菌目Gemmatimonadales芽单胞菌目Nitrospirales硝化螺旋菌目Pseudomonadales假单胞菌目Planctomycetales浮霉菌目Bacteroidales拟杆菌目Syntrophobacterales互营杆菌目Bacillales芽孢杆菌目
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顏色名稱代碼顏色 maroon #800000 darkred #8B0000 brown #A52A2A firebrick #B22222 crimson #DC143C red #FF0000 桃紅~紛紅 顏色名稱代碼顏色 mediumvioletred #C71585 palevioletred #D87093 deeppink #FF1493 fuchsia(magenta) #FF00FF hotpink #FF69B4 pink #FFC0CB lightpink #FFB6C1 mistyrose #FFE4E1 lavenderblush #FFF0F5 紫 顏色名稱代碼顏色 indigo #4B0082 purple #800080
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Role of Special Histochemical Stains in Staining Microorganisms Rashmil Saxena, BFA, HT(ASCP)CM Division of Transplantation Department of Surgery, Indiana University Indianapolis, IN, USA M icroorganisms encountered in routine pathology specimens include bacteria, fungi, protozoa and viruses1. Several histochemical stains help to visualize the first three groups of organisms; however, histochemical stains do not offer an advantage over H&E in the visualization of viruses and immunohistochemistry is the preferred method for this purpose. Histochemical stains also help to identify and classify bacteria, fungi and protozoa. The Giemsa and Gram’s stains help to visualize bacteria as well as classify them on their morphological characteristics. Thus bacteria can be classified into cocci or bacilli and cocci can be further classified into diplococci, staphylococci and streptococci based on their appearances on the Gram and Giemsa stains. The Gram stain also classifies bacteria into Gram-positive and Gram-negative organisms depending upon whether they take up the Gram stain or not; this classification is clinically useful and helps in therapeutic decisions. Some bacteria may not be adequately visualized with the Gram’s and Giemsa stains. Of these, the clinically most significant ones are mycobacteria and spirochetes. Mycobacteria stain with carbol fuschin and resist decolorization with acid-alcohol, leading to their designation as “acid-fast bacilli”. Spirochetes can be stained with a variety of silver stains such as the Warthin-Starry, Dieterle and Steiner stains. Finally, due to the large number of gastrointestinal biopsies in routine practice, a large number of stains are available for visualization of the Gram-negative bacillus, Helicobacter pylori. These include Giemsa, Alcian yellow - toludine blue, Diff-Quik, Genta, and Sayeed stains. A large number of laboratories prefer immunohistochemistry for identification of Helicobacter pylori. The Giemsa stain highlights several protozoa such as toxoplasma, leishmania, plasmodium, trichomonas, cryptosporidia and giardia. Ameba can be highlighted by the PAS stain due to their large glycogen content. Histochemical stains for fungi are discussed separately in this publication. Special Stains for Detection of Bacteria Gram Stain Utility of the Stain: The Gram stain is used to stain both bacillary and coccal forms of bacteria (Fig. 1). The most basic classification of bacteria consists of dividing them into Gram-positive and Gram negative bacteria based on whether they take up the Gram’s stain or not. Although the exact mechanism of staining is not known, bacteria that have large amounts of peptidoglycan in their walls retain the methyl violet stain, i.e., they are gram positive, whereas those that have more lipids and lipopolysaccharides in their cell walls are Gram-negative. The definite diagnosis of a bacterial species requires culture but the Gram stain provides a good initial indication of the nature of infection. 1 Some microbiologists also include viruses as microorganisms, but others consider these as non-living. Lwoff (1957). “The concept of virus”. J. Gen. Microbiol. 17 (2): 239–53. T echnical Articles
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