三、核酸电泳相关试剂、缓冲液的配制方法
50×TAE Buffer (pH8.5)
组份浓度 2 M Tris-醋酸,100 mM EDTA
配制量 1 L
配制方法 1.称量下列试剂,置于1 L烧杯中。
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加入57.1 ml的乙酸,充分搅拌。
4.加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。
10×TBE Buffer (pH8.3)
组份浓度890 mM Tris-硼酸,20 mM EDTA
配制量 1 L
配制方法l.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。
10×MOPS(3-吗啉基丙磺酸)Buffer
组份浓度200 rnM MOPS,20 mM NaOAc,10 mM EDTA
配制量 1 L
配制方法 1.称41.8 g MOPS,置于1 L烧杯中。
2.加约700 ml DEPC处理水,搅拌溶解。
3.使用2 N NaOH调节pH值至7.0。
4.再向溶液中加入下列试剂。
5.用DEPC处理水将溶液定容至1 L。
6.用0.45 m滤膜过滤除去杂质。
7.室温避光保存。
注:溶液见光或高温灭菌后会变黄。变黄时也可使用,但变黑时不要使用。
溴乙锭(10 mg/ml)
组份浓度10 mg/ml溴乙锭
配制量100 ml
配制方法 1.称量1 g溴乙锭,加入到100 ml容器中。
2.加入去离子水100 ml,充分搅拌数h完全溶解溴乙锭。
3.将溶液转移至棕色瓶中,室温避光保存。
4.溴乙锭的工作浓度为0.5 g/ml。
注意:溴乙锭是一种致癌物质,必须小心操作。
Agarose凝胶
配制方法 1.配制适量的电泳及制胶用的缓冲液(通常是0.5×TBE或1×TAE)。
2.根椐制胶量及凝胶浓度,准确称量琼脂糖粉,加入适当的锥形瓶中。
3.加入一定量的电泳缓冲液(总液体量不宜超过锥形瓶的50%容量)。
注:用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须统一。
4.在锥形瓶的瓶封上保鲜膜,并在膜上扎些小孔,然后在微波炉中
加热熔化琼脂糖。加热过程中,当溶液沸腾后,请戴上防热手套。
小心摇动锥形瓶。使琼脂糖充分均匀熔化。此操作重复数次,直
至琼脂糖完全熔化。必须注意,在微波炉中加热时间不宜过长,
每次当溶液起泡沸腾时停止加热,否则会引起溶液过热暴沸,造
成琼脂糖凝胶浓度不准,也会损坏微波炉。熔化琼脂糖时,必须
保证琼脂糖充分完全熔化,否则,会造成电泳图像模糊不清。
5.使溶液冷却至60℃左右,如需要可在此时加入溴乙锭溶液(终浓
度0.5 μg/ml)。并充分混匀。
注:溴乙锭是一种致癌物质。使用含有溴乙锭的溶液时,请戴好手套。
6.将琼脂糖溶液倒入制胶模中,然后在适当位置处插上梳子。凝胶
厚度一般在3~5 min之间。
7.在室温下使胶凝固(大约30 min~1 h),然后放置于电泳槽中进行
电泳。
注:凝胶不立即使用时,请用保鲜膜将凝胶包好后在4℃下保存,
一般可保存2~5天。
琼脂糖凝胶浓度与线形DNA的最佳分辨范围
6× Loading Buffer(DNA电泳用)
组份浓度
配制量500 ml
配制方法 1.称量下列试剂,置于500 ml烧杯中。
2.向烧杯中加入约200 ml的去离子水后,加热搅拌充分溶解。
3.加入180 ml的甘油(Glycerol)后,使用2 N NaOH调节pH值至7.0。
4.用去离子水定容至500 ml后,室温保存。
10 × Loadlng Buffer(RNA电泳用)
组份浓度
配制置10 ml
配制方法 1.称量下列试剂,置于10 ml离心管中。
2.向离心管中加入约4 ml的DEPC处理水后,充分搅拌溶解。
3.加入5 ml的甘油(Glycerol)后,充分混匀。
4.用DEPC处理水定容至10 ml后,室温保存。
四、核酸、蛋白质杂交用相关试剂、缓冲液的配制方法
20×SSC
组份浓度 3.0 M NaCl,0.3 M Na
3citrate·2H
2
O(柠檬酸钠)
配制量 1 L
配制方法 1.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3滴加14 N HCl,调节pH值至7.0后,加去离子水将溶液定容至1 L。
4.高温高压灭菌后,室温保存。
20×SSPE Buffer
组份浓度 3.0 M NaCl,0.2 M NaH
2PO
4
,0.02 M EDTA
配制量 1.L
配制方法 1.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加NaOH调节pH值至7.4(约6.5 ml的10 N NaOH)。
4.加去离子水将溶液定容至l L。
5.高温高压灭菌后,室温保存。
50 X Denhardt’S溶液
组份浓度
配制量500 ml
配制方法 1.称量下列试剂,置于500 ml烧杯中。
2.加去离子水约400 ml,充分搅拌溶解
3.加去离子水将溶液定容至500 ml。
4.用0.45μm滤膜过滤后,分装成每份25 ml。
5.-20℃保存。
0.5 M磷酸盐Buffer
组份浓度0.5 M Na
2HPO
4
。
配制量l L
配制方法 1.称量134 g Na
2HPO
4
·7H
2
O置于l L烧杯中。
2.加入约800 ml的去离子水充分搅拌溶解。
3.加入85%的H
3PO
4
(浓磷酸)调节溶液pH值至7.2。
4.加去离子水定容至1 L。
5.高温高压灭菌后,室温保存。
Salmon DNA (鲑鱼精DNA)
组份浓度10 mg/ml Salmon DNA
配制量约100 ml
配制方法 1.称取鲑鱼精DNA 2 g置于500 ml烧杯中,加入约200 ml的TE Buffer。
2用磁力搅拌器室温搅拌2~4 h,溶解后加入4 ml的5 M NaCl,使
其终浓度为0.1 M。
3.用苯酚和苯酚/氯仿各抽提1次。
4.回收水相溶液后,使用17号皮下注射针头快速吸打溶液约20次,
以切断DNA。
5.加入2倍体积的预冷乙醇进行乙醇沉淀。
6.离心回收DNA后,溶解于100 ml的去离子水中。测定溶液的OD
260值。
7.计算溶液的DNA浓度后,稀释DNA溶液至10 mg/ml。
8.煮沸10min后,分装成小份(1 ml/份)。-20℃保存。
9.使用前在沸水浴中加热5min后,迅速冰浴冷却。
DNA变性缓冲液
组份浓度 1.5 M NaCl,0.5 M NaOH
配制量 1 L
配制方法 1.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。
预杂交液/杂交液(DNA杂交用)
配制方法 1.称量下列试剂,置于200 ml烧杯中。
2.充分混匀后,使用0.45 μm 滤膜滤去杂质后使用。
预杂交液/杂交液(RNA 杂交用) 组份浓度
配制量 100 mL
配制方法 1.称量下列试剂,置于200 ml 烧杯中。
2.充分混匀后,使用0.45μm滤膜滤去杂质后使用。
膜转移缓冲液(Western杂交用)
组份浓度39 mM Glycine,48 mM Tris,0.037%(W/V)SDS,20%(V/V)甲醇配制量 1 L
配制方法 1.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2.向烧杯中加入约600 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加去离子水将溶液定溶至800 ml后,加入200 ml的甲醇。
4.室温保存。
TBST Buffer(Western杂交膜清洗液)
组份浓度20 mM Tris-HCl,150 mM NaCl,0.05%(V/V)Tween 20
配制量 1 L
配制方法 1.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加入0.5 ml Tween 20后充分混匀。
4.加去离子水将溶液定容至l L后,4℃保存。
封闭缓冲液(Western杂交用)
组份浓度5%(W/V)脱脂奶粉/TBST Buffer
配制量100 ml
配制方法 1.称5 g脱脂奶粉加入到100 ml TBST Buffer中,充分搅拌溶解。
2.4℃保存待用(本封闭液应该现配现用)。
五、实验室常用培养基的配制方法
Ampicillin(氨卡青霉素)(100 mg/ml)
组份浓度100 mg/ml Ampicillin
配制量50 ml
配制方法 1.称量5 g Ampicillin置于50 ml离心管中。
2.加入40 ml灭菌水,充分混合溶解后,定容至50 ml。
3.用0.22 μm过滤膜过滤除菌。
4.小份分装(1 ml/份)后,-20℃保存。
IPTG(异丙基-β-D-硫代半乳糖苷)(24 mg/ml)
组份浓度24 mg/mL IPTG
配制量50 mL
配制方法 1.称1.2 g IPTG置于50 ml离心管中。
2.加入40 ml灭菌水,充分混合溶解后,定容至50 ml。
3.用0 22 μm过滤膜过滤除菌。
4小份分装(1 ml,份)后,-20℃保存。
X-Gal (20 mg/ml)
组份浓度20 mg/ml X-Gal
配制量50 ml
配制方法 1.称量l g X-Gal置于50 ml离心管中。
2.加入40 ml DMF(二甲基甲酰胺),充分混合溶解后,定容至50 ml。
3.小份分装(1 ml/份)后,-20℃避光保存。
LB培养基
组份浓度1%(W/V)Tryptone(胰蛋白胨),0.5%(W/V)Yeast Extract(酵母提取物),1%(W/V)NaCl
配制量 1 L
配制方法 1.称取下列试剂,置于l L烧杯中。
2.加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.滴加5 N NaOH(约0.2 m1),调节pH值至7.0。
4.加去离子水将培养基定容至1 L。
5高温高压灭菌后,4。C保存。
LB/Amp培养基
组份浓度
配制量 1 L
配制方法 1.称取下列试剂,置于l L烧杯中。
2.加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.滴加5 N NaOH(约0.2 mL)。调节pH值至7.0。
4.加去离子水将培养基定容至1 L。
5.高温高压灭菌后,冷却至室温。
6.加入1 ml Ampicillin(100 mg/ml)后均匀混合。
7.4℃保存。
TB 培养基
组份浓度
配制量 1.L
配制方法 1.配制磷酸盐缓;中液(0.17 M KH 2PO4,0.72 M K 2HPO 4)100 ml 。 溶解2.31 g KH 2PO 4和l2.54 g K 2HPO 4于90 ml 的去离子水中,搅拌
溶解 后,加去离子水定容至100 ml ,高温高压灭菌。
2.称取下列试剂,置于l L 烧杯中。
3.加入约800 ml 的去离子水,充分搅拌溶解。
4.加去离子水将培养基定容至1 L 后,高温高压灭菌。
5.待溶液冷却至60℃以下时,;加入100 ml 的上述灭菌磷酸盐缓冲
液。
6.4℃保存。
TB/Amp培养基
组份浓度
配制量 1 L
配制方法 1.配制磷酸盐缓冲液(0.17 M KH
2PO
4
,0.72 M K
2
HPO
4
)100 ml。
溶解2.31 g KH
2PO
4
,和12.54g K
2
HPO
4
于90 ml的去离子水中,搅拌
溶解后,加去离子水定容至100 ml,高温高压灭菌。
2.称取下列试剂,置于l L烧杯中。
3.加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
4.加去离子水将培养基定容至l L后,高温高压灭菌。
5.待溶液冷却至60℃以下时,加入100 ml的上述灭菌磷酸盐缓冲
液。
6.均匀混合后4℃保存。
SOB培养基
组份浓度
配制量 1 L
配制方法 1.配制250 mM KCl溶液。
在90 ml的去离子水中溶解l.86 g KCl后,定容至100 ml。
2.配制2 M MgCl
溶液。
2
后,定容至100 ml,高温高压在90 ml去离子水中溶解19 g MgCl
2
灭菌。
3.称取下列试剂,置于l L烧杯中。
4.加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
5.量取10 m1 250 mM KCl溶液,加入到烧杯中。
6.滴加5 N NaOH溶液(约0.2 m1),调节pH值至
7.0。
7.加入去离子水将培养基定容至l L。
8.高温高压灭菌后,4℃保存。
溶液。
9.使用前加入5 ml灭菌的2 M MgCl
2
SOC培养基
组份浓度
配制量100 mL
配制方法 1.配制l M Glucose溶液。
将18 g Glucose溶于90 ml去离子水中,充分溶解后定容至100 ml。
用0.22 μm滤膜过滤除菌。
2.向l 00 ml SOB培养基中加入除菌的1 M Glucose溶液2 ml,均匀混合。
3.4℃保存。
2×YT培养基
组份浓度 1.6%(WV)Tryptone,1%(W/V)Yeast Extract,0.5%(W/V)NaCl 配制量 1 L
配制方法 1.称取下列试剂,置于l L烧杯中。
2.加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.滴加5 N NaOH,调节pH值至7.0。
4.加去离子水将培养基定容至1 L。
5.高温高压灭菌后,4℃保存。
Фb×broth
组份浓度2%(W/V)Tryptone,0.5%(W/V)Yeast Extract,o 5%(W/V)MgSO
4·7H
2
O
配制量 1 L
配制方法 1.称取下列试剂,置于l L烧杯中。
2.加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.滴加1 N KOH。调节pH值至7.5。
4.加去离子水将培养基定容至1 L。
5.高温高压灭菌后,4℃保存。
NZCYM培养基
组份浓度
配制量 1 L
配制方法 1.称取下列试剂。置于l L烧杯中。
2.加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。