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核酸理化性质讲义

核酸理化性质讲义
核酸理化性质讲义

核算理化性质-讲义

目录

1.一般物理性质;

2.核酸的紫外吸收;

3.变性;

4.复性;

5.杂交;

教学目的:了解核酸的一般物理性质及DNA序列的测定方法,掌握核酸的紫外吸收特性、变性和复性及核酸的分离、提纯和定量测定。

教学重点:核酸的紫外吸收及变性和复性;

教学难点:核酸的变性和复性

1.一般物理性质

1.1形态 DNA ——白色纤维状固体 RNA ——白色粉末状固体

1.2溶解性

微溶于水;不溶于乙醇、乙醚和氯仿等一般的有机溶剂;用乙醇可以沉淀核酸。

RNA核蛋白体(RNP)易溶于0.14mol/L NaCl溶液;DNP可溶于1~2mol/L的NaCl溶液;

RNA在碱性溶液中不稳定;DNA在碱性溶液中稳定。

显色反应:利用核糖和脱氧核糖不同的显色反应鉴定DNA与RNA。

核糖与地衣酚(3,5-二羟甲苯)试剂反应呈鲜绿色。

脱氧核糖与二苯胺试剂反应生成蓝色化合物,而核糖无此反应。

1.3粘度 DNA溶液粘度极高(因其分子直径小而长度大)

RNA溶液粘度要小得多★核酸变性或降解后,粘度降低

1.4两性解离 概念:核酸为两性电解质,因核苷酸含有磷酸基与碱基,磷酸基和碱基可以解离,在不同pH条件下解离程度不同,在一定条件下可形成兼性离子,表现为两性离子状态,通常表现为酸性。

效果:由于磷酸基团的酸性很强,所以pI(等电点)较低,整个分子相当于多元酸。

应用:利用核酸的两性解离可以通过调节核酸溶液的pH来沉淀核酸,也可通过电泳分离纯化核酸。

2. 紫外吸收性质

2.1机理:嘌呤和嘧啶具有共轭双键,能强烈吸收紫外光。

2.2性质1:在260nm处有最大吸收峰。对于纯的DNA或RNA,可以通过测得A260来推测其核酸含量。A260/ A280值可以反映核酸的纯度。

性质2:纯的DNA:A260/ A280 =1.8 纯的RNA:A260/ A280 =2.0

2.3.定义:增色效应(hyperchromic effect)是变性后DNA 溶液的紫外吸收作用增强的效应。

原因:DNA分子对紫外光的吸收峰在260nm。DNA分子中碱基间电子的相互作用是紫外吸收的结构基础,但双螺旋结构有序堆积的碱基又“束缚”了这种作用。变性DNA的双链解开,碱基中电子的相互作用更有利于紫外吸收,故产生增色效应。

差异:不同来源DNA 的变化不一,如大肠杆菌DNA 经热变性后,其260nm 的光密度值可增加40%以上,其它不同来源的DNA 溶液的增值范围多在20~30%之间。

影响:变性后DNA 在260nm 下的紫外吸收光密度的观测值通常较变性前有明显增加。 核酸复性后,光吸收值又回复到原有水平(减色效应)。

2.4测定核酸和核苷酸的紫外吸收的意义:★测定核酸在细胞和组织中的分布★测定核酸或嘌呤、嘧啶衍生物或核酸在纯溶液中的浓度

前提是知道嘌呤、嘧啶衍生物的摩尔吸光系数K (在一定pH 下是常数)

A (吸收值)=K (吸光系数)b (溶液厚度)c (溶液浓度)

碱基的光吸收值受pH 影响,所以测定时要注意一定的pH 条件。

3.核算的变性

3.1. 变性denaturation 的概念

核酸在某些物理或化学因素的作用下,双螺旋结构被破坏,空间结构发生改变,从而引起理化性质的改变(A260值升高、粘度下降、沉降系数加快、……)及生物活性的降低或丧失。★根据变性因素区分为碱变性、热变性等。如DNA 的碱变性、DNA 的热变性,其中以DNA 的热变性更具典型意义。

3.2 引起变性的因素

物理因素:热(热变性);紫外、辐射等;

化学因素:过酸(酸变性);过碱(碱变性);有机溶剂;尿素……

原因:使氢键断裂,破坏碱基堆集力,从而引起核酸二级结构的破坏。

3.3热变性曲线(熔解曲线)

DNA 的热变性是个突变过程,类似结晶的熔解。

在DNA 发生热变性的过程中,A260随温度的变化曲线。——熔解曲线

不同DNA 的熔解曲线不同,但很类似。都是 ——S 形曲线

2.4 Tm 值:将紫外吸收的增加量达到最大增量一半时的温度称熔解温度(melting temperature, Tm)。

★影响Tm 的因素

(1)G-C 比:G-C 的相对含量,值高Tm 高,

已知Tm,依据经验公式求G-C 的含量或Tm 值。(G+C )% =(Tm — 69.3)× 2.44

(2)均一性:质DNA (polyA-T )或(polyG-C)熔链温度发生在一个较小的范围内,异质DNA 熔链温度发生在一个较宽的范围内。:

(3)溶液离子强度:(4)溶液的pH :(5)变性剂:

4.核酸的复性

4.1复性:变性核酸的互补链在适当条件下重新缔合成双螺旋的过程。将热变性的DNA 骤然降温,不能复性形成无规则线团,如缓慢降温,可以复性,叫退火。

4.2影响复性速度的因素:

单链片段的浓度,浓度越高,复性越快;单链片段的大小,片段越大,扩散慢,错配频率高,复性越慢;片段内重复序列的多少,片段内重复序列的多,复性快;溶液一定的离子强度,能消除磷酸基负电荷造成的斥力,可加快复性速度。

4.3复性过程用二级反应动力学公式处理:

20kC dt dC

-= k C o t Co C ?+=11

Cot 曲线:在核酸复性研究过程中,确定一定的温度、离子强度、核酸片段大小等条件

下,以C/Co 对Cot作图,可以得到Cot曲线。

在一定条件下复性的速度可用Cot1/2来衡量,Co为完全变性时的初始浓度,以核苷酸的摩尔浓度表示,t为时间(s),Cot1/2表示复性一半的Cot值

5核酸的分子杂交

核酸分子杂交技术是目前分子生物学中应用很广的技术,它可以鉴定核酸分子之间的同源性,是分子克隆技术的重要组成部分。

5.1分子杂交(简称杂交,hybridization) 是应用核酸分子的变性和复性的性质,使两条来源不同的具有一定同源性(即具有碱基互补关系)的DNA单链分子或DNA单链分子与RNA 分子经退火形成双链DNA分子或DNA-RNA异质双链分子(heteroduplex)的过程。

杂交双链可以在DNA与DNA链之间,也可在RNA与DNA链之间形成。

杂交首先透过加热或碱处理使双螺旋解开成为单链,然后在一定条件下使互补核酸链实现复性。

5.2杂交技术简介

southern:用DNA作为探针杂交DNA。检测目标DNA的存在与否

northern:用DNA或RNA探针杂交RNA。检测目标RNA的存在与否

western:用抗体和目的蛋白结合进行杂交。检测目标蛋白的存在与否。

Eastern:杂交。少数人提议将IEF胶(即等电聚焦电泳)中的蛋白质转印到膜上的技术称为Eastern-blotting,但这一建议并未被广泛接受。

核酸的物理化学性质

7-3 核酸的物理化学性质上册P502 (一)核酸的水解: 所有糖苷键和磷酸酯键都能被水解。 (1)酸水解: 糖苷键比磷酸二酯键易被水解,嘌呤碱糖苷键比嘧啶碱更易水解。 (2)碱水解: 磷酸酯键易水解,RNA比DNA易水解,因为RNA核糖上有2‘-OH,水解过 程见P502。 (3)酶水解: 为水解磷酸二酯键的酶,专一水解核酸的为核酸酶。 1.核酸酶的分类: 按底物专一性分为RNase(核糖核酸酶)和DNase(脱氧核糖核酸酶)。 按对底物作用方式分为内切酶(作用点在核糖核酸酶内部)和外切酶(作用 点在末端)。 2.RNase:如牛胰核糖核酸酶(EC 2.7.7.16),内切酶,作用位点为嘧啶核苷(Py) -3‘-磷酸与其他核苷酸之间的连键。 3.限制性内切酶:为DNase。 剪裁DNA的工具,可用于核酸测序和基因工程。 在细菌中发现,目前已找到限制性内切酶数千种。限制性内切酶往往与甲基 化酶成对存在,自身酶作用位点的碱基被甲基化,内切酶不再降解,因而可 识别和降解外源DNA。 断裂位点处常有二重旋转(轴)对称性(回文结构,正读反读相同),在特定 位点两条链切断后形成粘末端或平末端。 限制性内切酶命名:如E. coR Ⅰ,第1个字母E(大写),为大肠杆菌(E.coli) 属名的第一个字母,第2、3两个字母co(小写)为种名头两个字母,第4 个字母R,表示菌株,最后一个罗马字为该细菌中已分离这一类酶的编号。(二)核酸的酸碱性质: 核苷和核苷酸都是兼性离子,碱基和磷酸基均能解离,见P505,具有酸碱性。 由于DNA酸碱变性,使酸碱滴定曲线不可逆。 (三)核酸的紫外吸收: 嘌呤环与嘧啶环具有共轭双键,核苷和核酸的吸收波段在240~290nm,最大吸收值在260nm附近(蛋白质最大吸收值280nm)。 (1)可用于测样品纯度(测吸光度A): A260/A280比值,纯DNA应大于1.8,纯RNA应达到2.0,若样品混有杂蛋白,比值明显降低。 对于纯样品,从260nm的A值即可算出含量。A值为1,相当于50μg/mL DNA双螺旋,或40μg/mL单链DNA(或RNA),或20μg/mL寡核苷酸。 (2)核酸的摩尔磷吸光系数ε(P):为含有1克原子磷(30.98g)的核酸在260nm 处的吸光系数。 ε(P)= A / CL. = 30.98 A / W L A:吸收值,C:每升溶液的磷摩尔数,C=W/30.98,L:比色杯内径。 一般天然DNA ε(P)为6600,RNA为7700~7800 由于双螺旋结构使碱基对的π电子云发生重叠,使紫外吸收比单链减少,由此可判断DNA是否变性。

萜类化合物

一、萜类化合物概述 萜类化合物(Terpenoids)是所有异戊二烯聚合物及其衍生物的总称[4]。萜类化合物中的烃类常单独称为萜烯。萜类化合物除以萜烯的形式存在外,还以各种含氧衍生物的形式存在,包括醇、醛、羧酸、酮、酯类以及甙等。萜类化合物在自然界中分布广泛,种类繁多,估计有1万种以上,是天然物质中最多的一类。 萜类化合物的分子结构是以异戊二烯为基本单位的,因此其分类依据主要是以异戊二烯单位数目的不同为标准来进行。开链萜烯的分子组成符合通式(C5H8)n(n≥2),含有两个异戊二烯单位的称为单萜,含有三个异戊二烯单位的称为倍半萜,含有四个异戊二烯单位的则称为二萜(图1),以此类推[4]。倍半萜约有7 000多种,是萜类化合物中最大的一类[5]。二萜类以上的也称“高萜类化合物”,一般不具挥发性[6]。此外,有的萜类化合物分子中具有不同的碳环数,因此又进一步区分为链萜、单环萜、双环萜、三环萜等。其中,单萜和倍半萜及其简单含氧衍生物是挥发油的主要成分,而二萜是形成树脂的主要成分,三萜则以皂甙的形式广泛存在。 萜类化合物在植物界中普遍存在[4]。常见含萜类化合物的植物类群有:蔷薇科(Rosaceae)、藜科(Chenopodiaceae)、天南星科(Araceae)、毛茛科(Ranunculaceae)、萝科(Asclepi-adaceae)、莎草科(Cyperaceae)、禾本科(Gramineae)、柏科(Cu-pressaceae)、杜鹃科(Ericaceae)、木犀科(Oleaceae)、木兰科(Magnoliaceae)、樟科(Lauraceae)、胡椒科(Piperaceae)、马鞭草科(Verbenaceae)、马兜铃科(Aristolochiaceae)、芸香科(Ru-taceae)、唇形科(Labiatae)、菊科(Compositae)、松科(Pinaceae)、伞形科(Umbelliferae)、桃金娘科(Myrtaceae)等[7]。 1陈晓亚,叶和春.植物次生代谢及其调控.见:李承森主编.植物学进展(第一卷).北京:高等教育出版社,1998.293~304 2杜近义,胡国赋,秦际威.植物次生代谢产物的生态学意义.生学杂志,1999,16(5):9~10 3陈晓亚,刘培.植物次生代谢的分子生物学及基因工程.生命学,1996,8(2): 8~9 4肖崇厚主编.中药化学.上海:上海科学技术出版社,1991.323~37 5Bohlmann J, Gilbert MG, Rodney C. Plant terpenoid synthases: Molecular biology and phylogenetic analysis. Proc Nati Acad Sci,1998,95(8):4126~4133 6Langenheim J H. Plant resins. Am Sci,1990(78):16~24 7 谷文祥,段舜山,骆世明.萜类化合物的生态特性及其植物的化作用.华南农业大学学 报,1998,19(4):108~110 二、萜类化合物的分类

氨基酸的理化性质

氨基酸的理化性质 生化 1. 氨基酸的理化性质两 性解离等电点紫外吸收 核酸的紫外吸收最大值 2. 蛋白质的分子结构 一级顺序肽键二硫键 二级主链氢键三级全部疏水作用离子键氢键范德华力四级亚基氢键离子键3. 蛋白质的变性 空间构象破坏理化性质改变生物活性丧失 4. DNA 双螺旋结构 反向平行互补双链 = = 手螺旋 横纵 5. 转运 RNA 结构 稀有碱基 茎环结构二级 三级 6. DNA 变性 氢键断裂只改变二级不改变核苷酸排列 增色效应解链吸光值增加 融解温度 Tm 紫外吸收值达最大的 %时的温度 7. 酶结构

结合酶酶蛋白 辅助因子辅酶 辅基 必需集团活性中心结合集团 催化集团 8. 值等于 2005Y25,一个简单的酶促反应,当[S] Km A,反应速度最大 B,反应速度太 慢难以测出 C,反应速度与底物浓 度成正比 D,增加底物浓度反应速 1 度不变 E,增加底物浓度反应速度 降低时 9. 可逆性抑制 竞争性非竞争性反竞争性 Km 丙二酸琥珀酸脱氢酶琥珀酸 磺胺二氢叶酸合成酶对氨基苯甲酸 2 10. 变构酶 速度方程式米氏方程,呈型曲线 多为 多亚基构成, 亚基, 亚基: 中心, 中心:

11. 同工酶 催化化学反应 ,分子结构理化性质免疫学性质乳酸脱氢 LDH1 LDH2 LDH3 LDH5 酶 肌酸激酶 CK1 CK2 CK3 12. 糖酵解的调节 6-磷酸果糖激酶-1 激活 AMP、ADP 1,6-双磷酸果糖: :、2,6-双磷酸果糖: : 抑制 ATP、柠檬酸 丙酮酸激酶激活 1,6-双磷酸果糖 抑制 ATP、丙氨酸 己糖激酶抑制长链脂酰 CoA 13. 底物水平磷酸化 1,3-二磷酸甘油酸 3-磷酸甘油酸磷酸甘油酸激酶 磷酸烯醇式丙酮酸丙酮酸丙酮酸激酶 琥珀酰 CoA 琥珀酸琥珀酰 CoA 合成酶脱氢 琥珀酸延胡索酸琥珀酸脱氢酶 14. 糖异生 己糖激酶葡萄糖-6-磷酸酶 6-磷酸果糖激酶-1 果糖双磷酸酶-1 丙酮酸激酶丙酮酸羧化酶 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶 乙酰 CoA 丙酮酸羧化酶 丙酮酸脱氢酶 15. 脂酸氧化

核酸的性质

核酸的性质 核酸的理化性质及研究方法内容十分庞杂,本节只可能对若干比较重要的核酸理化性质和研究方法作概要叙述。 一、一般物理性质 1. 溶解度DNA为白色纤维状固体,RNA为白色粉末状固体,它们都微溶于水,其钠盐在水中的溶解度较大。它们可溶于2-甲氧乙醇,但不溶于乙醇、乙醚和氯仿等一般有机溶剂,因此,常用乙醇从溶液中沉淀核酸,当乙醇浓度达50%时,DNA就沉淀出来,当乙醇浓度达75%时RNA也沉淀出来。DNA和RNA在细胞内常与蛋白质结合成核蛋白,两种核蛋白在盐溶液中的溶解度不同,DNA核蛋白难溶于0.14mol/L的NaCl溶液,可溶于高浓度(1~2mol/L)的NaCl溶液,而RNA核蛋白则易溶于0.14mol/L的NaCl溶液,因此常用不同浓度的盐溶液分离两种核蛋白。 2. 分子大小DNA分子极大,分子量在106以上,RNA的分子比DNA分子小得多。核酸分子的大小可用长度、核苷酸对(或碱基对)数目、沉降系数(S)和分子量等来表示。 3. 形状及粘度核酸(特别是线形DNA)分子极为细长,其直径与长度之比可达1:107,因此核酸溶液的粘度很大,即使是很稀的DNA溶液也有很大的粘度。RNA溶液的粘度要小得多。核酸若发生变性或降解,其溶液的粘度降低。 二、核酸的紫外吸收 嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键,使碱基、核苷、核苷酸和核酸在240~290nm的紫外波段有一强烈的吸收峰,因此核酸具有紫外吸收特性。DNA钠盐的紫外吸收在260nm附近有最大吸收值(图3-25),其吸光率(absorbance)以A260表示,A260是核酸的重要性质,在核酸的研究中很有用处。在230nm处为吸收低谷,RNA钠盐的吸收曲线与DNA无明显区别。不同核苷酸有不同的吸收特性。所以可以用紫外分光光度计加以定量及定性测定。 实验室中最常用的是定量测定小量的DNA或RNA。对待测样品是否纯品可用紫外分光光度计读出260nm与280nm的OD值,因为蛋白质的最大吸收在280nm处,因此从 A260/A280的比值即可判断样品的纯度。纯DNA的A260/A280应为1.8,纯RNA应为2.0。样品中如含有杂蛋白及苯酚,A260/A280比值即明显降低。不纯的样品不能用紫外吸收法作定量测定。对于纯的核酸溶液,测定A260,即可利用核酸的比吸光系数计算溶液中核酸的量,核酸的比吸光系数是指浓度为1μg/mL的核酸水溶液在260nm处的吸光率,天然状态的双链DNA的比吸光系数为0.020,变性DNA和RNA的比吸光系数为0.022。通常以1OD 值相当于50μg/mL双螺旋DNA,或40μg/mL单螺旋DNA(或RNA),或20μg/mL寡核苷酸计算。这个方法既快速,又相当准确,而且不会浪费样品。对于不纯的核酸可以用琼脂糖凝胶电泳分离出区带后,经啡啶溴红染色而粗略地估计其含量。 三、核酸的沉降特性

20种氨基酸理化性质分组

20种氨基酸记忆口诀 六伴穷光蛋:硫、半、光、蛋→半胱、光、蛋(甲硫)氨酸→含硫氨基酸 酸谷天出门:酸、谷、天→谷氨酸、天门冬氨酸→酸性氨基酸 死猪肝色脸:丝、组、甘、色→丝、组、甘、色氨酸→一碳单位来源的氨基酸 只携一两钱:支、缬、异亮、亮→缬、异亮、亮氨酸→支链氨基酸 一本落色书:异、苯、酪、色、苏→异亮、苯丙、酪、色、苏氨酸→生糖兼生酮 拣来精读之:碱、赖、精、组→赖氨酸、精氨酸、组氨酸→碱性氨基酸 芳香老本色:芳香、酪、苯、色→酪、苯丙、色氨酸→芳香族氨基酸 不抢甘肃来:脯、羟、甘、苏、赖→脯、羟脯、甘、苏、赖氨酸→不参与转氨基的氨基酸 二十种氨基酸的英文名称速记用词根词缀记,凭借读音也很容易。 luna和月光相关,l的就是亮氨酸,加上iso-的前缀就是异亮氨酸了;芦笋是asparagus(G的单词),天门冬属的,所以天冬氨酸是asparagine 就是asp了; his- 作词很是组织的意思,histamine-组胺,thus,histidine-组氨酸:His;苯,Phe,苯丙氨酸就是Phe了。 甘氨酸-----Gly-----G 干gan了le的叶ye子 丙氨酸-----Ala-----A 一个夹心饼干(把A想成一片饼干,两面都是A,中间加点东西) 缬氨酸-----Val-----V 缬读xie,和腹泻的泻同音!四川人管上厕所叫窝(Val)屎 亮氨酸-----Leu-----L 亮的英语单词是light 异亮氨酸---Ile----I 把I想成一 苯丙氨酸---Phe----F 他(he)人又苯,又爱放屁(P),我真的服(F)了他了 脯氨酸-----Pro----P 胸脯(p)肉(ro) 色氨酸-----Trp----W 我w喜欢看三three个人renXXXXp,我太色了 丝氨酸-----Ser----S S的读音 酪氨酸-----Tyr----Y 踢T你的your鸭儿r,让你变成懦夫 半胱氨酸---Cys----C 这个来自一个单词Cyst,是膀胱的意思。读音和妹妹差不多。妹妹的膀胱 蛋氨酸-----Met----M 小的时候,妈妈M老是叫我吃eat鸡蛋 天冬氨酸---Asp----D 把As想成天冬。医生D说AS的尿是酸性的 天冬酰胺---Asn----N 不能在冬天制造血案 谷氨酰胺----Gln---Q 谷物没多少了,最大的问题在于可能发生血案 谷氨酸------Glu---E 谷物的益处E在于可以变成葡萄糖 苏氨酸------Thr---T 他TA喝he了瓶苏打水,终于不热re了 赖氨酸------Lys---K 美国的国务卿耐丝LYS说她可以让台湾占山为王KING,老胡说,你简(碱性氨基酸)直是在放屁 精氨酸------Arg---R 大家都看过周星驰的电影,有一次,他喝了杯精液,观众就在争论argue他喝的是不是热RE的精液 组氨酸------His---H H想成医院,医院切掉了他的his病变组织 8种必需氨基酸——携一两本色书来家(呵呵,自创的,别想歪了!) 非极性氨基酸:仆笨些,梁刚(主人)亦笨-------脯氨酸/丙氨酸/缬氨酸/亮氨酸/甘氨酸/异亮氨酸/苯丙氨酸 外一篇 苏缬亮异亮,苯丙属芳香。 还有色赖蛋,缺一人遭殃。(必需) 丙组丝甘半,天谷建酸胺。 精酪加一脯,20氨基酸。(非必需) 氨基酸记忆口诀 1、必须氨基酸:携一本蛋色书来[缬氨酸,异亮(亮)氨酸,苯丙氨酸,蛋氨酸,色氨酸(甲硫氨酸),苏氨酸,赖氨酸,] 2、半必须氨基酸:半斤组[精(斤)氨酸,组氨酸] 3、含硫氨基酸:硫甲硫,胱半胱[甲硫氨酸,半胱氨酸,胱氨酸] 4、芳香族氨基酸:老芳本色[酪氨酸,苯丙氨酸,色氨酸] 5、支链氨基酸:支姐,亮一亮[缬氨酸,亮氨酸,异亮氨酸] 6、非极性疏水性氨基酸:非姐,脯亮一亮,(给你)本饼干[缬氨酸,脯氨酸,亮氨酸,异亮氨酸,苯丙氨酸,丙氨酸,甘氨酸] 7、酸性氨基酸:酸谷天(三伏天)[谷氨酸,天冬氨酸] 8、碱性氨基酸:碱组精赖[组氨酸,精氨酸,赖氨酸] 9、生糖氨基酸:姐,天天,哭哭(谷谷),脯(羟)脯,(要吃)半斤组蛋饼(和)钢丝[缬氨酸,天冬氨酸,天冬酰氨,谷氨酸,谷氨酰氨,脯(羟)

核酸的理化性质

第15章、核酸的物理化学性质(上册P502) 本章重点:1、核酸的水解,2、核酸的紫外吸收,3、核酸的变性和复性 本章的主要内容: (一)核酸的水解: 所有糖苷键和磷酸酯键都能被水解。 (1)酸水解: 糖苷键比磷酸二酯键易被水解,嘌呤碱糖苷键比嘧啶碱更易水解。 (2)碱水解: 磷酸酯键易水解,RNA比DNA易水解,因为RNA核糖上有2‘-OH,水解过 程见P502。 (3)酶水解: 为水解磷酸二酯键的酶,专一水解核酸的为核酸酶。 1.核酸酶的分类: 按底物专一性分为RNase(核糖核酸酶)和DNase(脱氧核糖核酸酶)。 按对底物作用方式分为内切酶(作用点在核糖核酸酶内部)和外切酶(作用 点在末端)。 2.RNase:如牛胰核糖核酸酶(EC 2.7.7.16),内切酶,作用位点为嘧啶核苷(Py) -3‘-磷酸与其他核苷酸之间的连键。 3.限制性内切酶:为DNase。 剪裁DNA的工具,可用于核酸测序和基因工程。 在细菌中发现,目前已找到限制性内切酶数千种。限制性内切酶往往与甲基 化酶成对存在,自身酶作用位点的碱基被甲基化,内切酶不再降解,因而可 识别和降解外源DNA。 断裂位点处常有二重旋转(轴)对称性(回文结构,正读反读相同),在特定 位点两条链切断后形成粘末端或平末端。 限制性内切酶命名:如E. coR Ⅰ,第1个字母E(大写),为大肠杆菌(E.coli) 属名的第一个字母,第2、3两个字母co(小写)为种名头两个字母,第4 个字母R,表示菌株,最后一个罗马字为该细菌中已分离这一类酶的编号。(二)核酸的酸碱性质: 核苷和核苷酸都是兼性离子,碱基和磷酸基均能解离,见P505,具有酸碱性。 由于DNA酸碱变性,使酸碱滴定曲线不可逆。 (三)核酸的紫外吸收: 嘌呤环与嘧啶环具有共轭双键,核苷和核酸的吸收波段在240~290nm,最大吸收值在260nm附近(蛋白质最大吸收值280nm)。 (1)可用于测样品纯度(测吸光度A): A260/A280比值,纯DNA应大于1.8,纯RNA应达到2.0,若样品混有杂蛋白,比值明显降低。 对于纯样品,从260nm的A值即可算出含量。A值为1,相当于50μg/mL DNA双螺旋,或40μg/mL单链DNA(或RNA),或20μg/mL寡核苷酸。 (2)核酸的摩尔磷吸光系数ε(P):为含有1克原子磷(30.98g)的核酸在260nm 处的吸光系数。 ε(P)= A / CL. = 30.98 A / W L

20种氨基酸缩写,结构,特性,记忆口诀

20种氨基酸缩写,结构,特性,记忆口诀

速记氨基酸英文缩写 2008-08-20 14:27 氨基酸记忆口诀 1、必须氨基酸:携一本蛋色书来[缬氨酸,异亮(亮)氨酸,苯丙氨酸,蛋氨酸,色氨酸(甲硫氨酸),苏氨酸,赖氨酸,] 2、半必须氨基酸:半斤组[精(斤)氨酸,组氨酸] 3、含硫氨基酸:硫甲硫,胱半胱[甲硫氨酸,半胱氨酸,胱氨酸] 4、芳香族氨基酸:老芳本色[酪氨酸,苯丙氨酸,色氨酸] 5、支链氨基酸:支姐,亮一亮[缬氨酸,亮氨酸,异亮氨酸] 6、非极性疏水性氨基酸:非姐,脯亮一亮,(给你)本饼干[缬氨酸,脯氨酸,亮氨酸,异亮氨酸,苯丙氨酸,丙氨酸,甘氨酸]

7、酸性氨基酸:酸谷天(三伏天)[谷氨酸,天冬氨酸] 8、碱性氨基酸:碱组精赖[组氨酸,精氨酸,赖氨酸] 9、生糖氨基酸:姐,天天,哭哭(谷谷),脯(羟)脯,(要吃)半斤组蛋饼(和)钢丝[缬氨酸,天冬氨酸,天冬酰氨,谷氨酸,谷氨酰氨,脯(羟)脯氨酸,半胱氨酸,精氨酸,组氨酸,蛋氨酸,丙氨酸,甘氨酸,丝氨酸] 10、生酮氨基酸:酮赖亮[赖氨酸,亮氨酸] 11、生糖兼生酮氨基酸:一本老色书[异亮氨酸,苯丙氨酸,酪氨酸,色氨酸,苏氨酸] 12、生成一碳单位氨基酸:一组色钢丝[组氨酸,色氨酸,甘氨酸,丝氨酸] 生物化学 人体八种必须氨基酸(第一种较为顺口) 1.“一两色素本来淡些”(异亮氨酸、亮氨酸、色氨酸、苏氨酸、苯丙氨酸、赖氨酸、蛋氨酸、缬氨酸)。 2.“写一本胆量色素来”(缬氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、亮氨酸、色氨酸、苏氨酸、赖氨酸)。 3.鸡旦酥,晾(亮)一晾(异亮),本色赖。 生糖、生酮、生糖兼生酮氨基酸: 生酮+生糖兼生酮=“一两色素本来老”(异亮氨酸、亮氨酸、色氨酸、苏氨酸、苯丙氨酸、赖氨酸、酪氨酸),其中生酮氨基酸为“亮赖”;除了这7个氨基酸外,其余均为生糖氨基酸。 酸性氨基酸: 天谷酸——天上的谷子很酸,(天冬氨酸、谷氨酸); 碱性氨基酸: 赖精组——没什么好解释的,(Lys、Arg、His)。 芳香族氨基酸在280nm处有最大吸收峰 色老笨---只可意会不可言传,(色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸),顺序一定要记清,色>酪>苯丙

食品中的氨基酸、多肽及蛋白类物质的理化性质及应用

食品中的氨基酸、多肽及蛋白类物质 主要内容 1概述 2蛋白质的理化性质 3蛋白质的食品加工学特性 4食品中常见的蛋白质 1概述 1.1氨基酸基本的理化性质 一、基本物理学性质 包括基本组成和结构、溶解性、酸碱性质、立体化学、熔点、沸点、光学行为、旋光性、疏水性等。 (一)溶解性质 根据氨基酸侧链与水相互作用的程度可将氨基酸分作几类。含有脂肪族和芳香族侧链的氨基酸,如Ala、Ile、Leu、Met、Pro、Val及Phe、Tyr,由于侧链的疏水性,这些氨基酸在水中的溶解度均较小;侧链带有电荷或极性集团的氨基酸,如Arg、Asp、Glu、His、Lys和Ser、Thr、Asn在水中均有比较大的溶解度;但根据电荷及极性分析也有一些例外,如脯氨酸属于带疏水基团的氨基酸,但在水中却有异常高的溶解度。

(二)氨基酸的疏水性 氨基酸的疏水性,是影响氨基酸溶解行为的重要因素,也是影响蛋白质和肽的物理化学性质(如结构、溶解度、结合脂肪的能力等)的重要因素。 按照物理化学的原理,疏水性可被定义为:在相同的条件下,一种溶于水中的溶质的自由能与溶于有机溶剂的相同溶质的自由能 相比所超过的数值。估计氨基酸侧链的相对疏水性的最直接、最简单的方法就是实验测定氨基酸溶于水和溶于一种有机溶剂的自由能变化。 一般用水和乙醇之间自由能变化表示氨基酸侧链的疏水性,将此变化值标作△G′。 (三)氨基酸的光学性质 氨基酸中的苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸分子中由于有共轭体系,因此可以吸收近紫外光。它们的最大吸收波长(λmax)分别为260nm、275nm、278nm;在吸收最大波长光线的时候还会发出荧光。 二、基本化学性质 关于氨基酸基本的化学性质,在生物化学中已经进行了介绍。下面再根据Owen R. Fennema, Food Chemistry, 作简要系统介绍;其主要的线索还是氨基酸分子中所带的官能团。 三、重要的分析鉴定反应 (一)与茚三酮的反应(略)

(完整版)核酸的理化性质.doc

第 15 章、核酸的物理化学性质(上册 P502) 本章重点: 1、核酸的水解, 2、核酸的紫外吸收, 3、核酸的变性和复性本 章的主要内容: (一)核酸的水解: 所有糖苷键和磷酸酯键都能被水解。 (1)酸水解: 糖苷键比磷酸二酯键易被水解,嘌呤碱糖苷键比嘧啶碱更易水解。 (2)碱水解: 磷酸酯键易水解, RNA 比 DNA 易水解,因为 RNA 核糖上有 2‘ - OH ,水解过程见 P502。 (3)酶水解: 为水解磷酸二酯键的酶,专一水解核酸的为核酸酶。 1.核酸酶的分类: 按底物专一性分为 RNase(核糖核酸酶)和 DNase(脱氧核糖核酸酶)。按对 底物作用方式分为内切酶(作用点在核糖核酸酶内部)和外切酶(作用 点在末端)。 2.RNase:如牛胰核糖核酸酶( EC 2.7.7.16 ),内切酶,作用位点为嘧啶核苷( Py) ‘ - 3 - 磷酸与其他核苷酸之间的连键。 3.限制性内切酶:为 DNase。 剪裁 DNA 的工具,可用于核酸测序和基因工程。 在细菌中发现,目前已找到限制性内切酶数千种。限制性内切酶往往与甲基 化酶成对存在,自身酶作用位点的碱基被甲基化,内切酶不再降解,因而可 识别和降解外源 DNA 。 断裂位点处常有二重旋转(轴)对称性(回文结构,正读反读相同),在特定位点 两条链切断后形成粘末端或平末端。 限制性内切酶命名:如 E. coR Ⅰ,第 1 个字母 E( 大写 ) ,为大肠杆菌 (E.coli) 属名的第一个字母,第2、 3 两个字母co (小写)为种名头两个字母,第 4 个字母R,表示菌株,最后一个罗马字为该细菌中已分离这一类酶的编号。 (二)核酸的酸碱性质: 核苷和核苷酸都是兼性离子,碱基和磷酸基均能解离,见P505,具有酸碱性。 由于 DNA 酸碱变性,使酸碱滴定曲线不可逆。 (三)核酸的紫外吸收: 嘌呤环与嘧啶环具有共轭双键,核苷和核酸的吸收波段在240~290nm,最大吸收值在 260nm 附近(蛋白质最大吸收值280nm)。 ( 1)可用于测样品纯度(测吸光度 A ): A260/A280 比值,纯DNA 应大于 1.8,纯RNA 应达到 2.0,若样品混有杂 对于纯样品,从 260nm 的A 值即可算出含量。 A 值为1,相当于50μ g/mL ( 2)DNA 双螺旋,或40μ g/mL 核酸的摩尔磷吸光系数ε( 单链 DNA (或 RNA ),或 P):为含有 1 克原子磷( 20μ g/mL 寡核苷酸。 30.98g)的核酸在260nm 处的吸光系数。 ε( P) = A / CL. = 30.98 A / W L

萜类化合物

萜类化合物 萜类化合物是天然物质中最多的一类化合物。如:挥发油、树脂、橡胶以及胡萝卜素等萜类成分中,有些具有生理活性,如:龙脑、山道年和川楝素(驱蛔)、穿心莲内酯(抗菌)、人参皂苷以及甘草酸等 1.萜类的定义 2萜类的结构分类 根据组成分子的异戊二烯单位的数目可将萜分成以下几类: 单萜:含有两个异戊二烯单位,它包含开链单萜,单环萜,二环单萜三种。倍半萜:含有三个异戊二烯单位的萜。双萜:含有四个异戊二烯单位的萜。三萜:含有六个异戊二烯单位的萜。以此类推。这些萜类和单萜一样,也有开链和成环之分。 3. 萜类化合物的理化性质 (一)物理性质 1.性状 (1)形态:单萜、倍半萜—多具有特殊香气的油状液体; 常温可挥发或低熔点的固体。沸点:单萜< 倍半萜(分子量、双键的增加—挥发性降低,熔点和沸点增高—用分馏法进行分离。)二萜和二倍半萜—多为结晶性固体。 (2)味:多具苦味(萜类又称苦味素) (3)旋光和折光性:多具有不对称碳原子,且多有异构体。 (4)溶解度:萜类亲脂性强—易溶醇及脂溶性有机溶剂难溶水;具内酯结构的萜类—溶于碱水,酸化析出(用于分离纯化); 萜类对高热、光和酸碱较为敏感,或氧化,或重排,引起结构改变。 (二)化学性质 1.加成反应 2.氧化反应 3.脱氢反应 4.分子重排 齐墩果酸和熊果酸研究进展 萜类化合物是所有异戊二烯聚合物和衍生物的总称。按异戊二烯单位的多少,可将常见萜类化合物分为单萜、倍半萜、二萜、二倍半萜、三萜、四萜和多萜,每类再根据基本碳链是否成环及成环数的多少进一步分类。三萜类化合物广泛存在于多种植物中,种类繁多,其中,最常见的是五环三萜中的齐墩果烷型和乌苏烷型,其代表化合物分别是齐墩果酸(OA)和熊果酸(UA)及其衍生物。齐墩果酸和熊果酸属于五环三萜类化合物,是由6个异戊二烯单位、30个碳原子组成。 1理化性质 齐墩果酸(别名土当归酸,oleanolic acid OA)和熊果酸(乌索酸,ursolic acid,UA)是五环三枯类化合物,为两个同分异构体,广泛存在于自然界且具有多种生物活性。据不完全统计,

20种氨基酸的缩写

20种氨基酸缩写,结构,特性,记忆口诀体内20种氨基酸按理化性质可分为4组: ①非极性、疏水性氨基酸: 甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸和脯氨酸。 ②极性、中性氨基酸: 色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺和苏氨酸。 ③酸性的氨基酸: 天冬氨酸和谷氨酸。 ④碱性氨基酸: 赖氨酸、精氨酸和组氨酸。 中文名称英文名称三字母缩写单字母符号甘氨酸Glycine Gly G 丙氨酸Alanine Ala A 缬氨酸Valine Val V 亮氨酸Leucine Leu L 异亮氨酸Isoleucine Ile I 脯氨酸Proline Pro P 苯丙氨酸Phenylanine Phe F 酪氨酸Tyrosine Tyr Y 色氨酸Tryptophan Trp W 丝氨酸Serine Ser S

苏氨酸Threonine Thr T 半胱氨酸Cystine Cys C 蛋氨酸Methionine Met M 天冬酰胺Asparagine Asn N 谷氨酰胺Glutarnine Gln Q 天冬氨酸Asparticacid Asp D 谷氨酸Glutamicacid Glu E 赖氨酸Lysine Lys K 精氨酸Argine Arg R 组氨酸Histidine His H 结构 丙氨酸AlanineA 或Ala89.079CH 3 -脂肪族类精氨酸ArgineHN=C(NH 2)-NH-(CHR 或Arg174.188碱性氨基酸类2 ) 3 - N 或Asn132.104H 2 N-CO-CH 2 -酰胺类酸性氨基酸类含硫类天冬酰胺Asparagine 天冬氨酸Aspartic acidD 或Asp133.089HOOC-CH 2 - 半胱氨酸CysteineC 或Cys121.145HS-CH 2 - H 2 N-CO-(CH 2 ) 2谷氨酰胺GlutamineQ 或Gln146.131-谷氨酸Glutamic acidE 或Glu147.116HOOC-(CH 2 ) 2 -酸性氨基酸类甘氨酸GlycineG 或 Gly75.052H-脂肪族类酰胺类N=CH-NH-CH=C-CH 2组氨酸HistidineH 或 His155.141- |_____| CH 3 -CH 2 -CH(CH 异亮氨酸IsoleucineI 或Ile131.160

十种基本氨基酸简写符号

二十种基本氨基酸简写符号 丙氨酸Ala 精氨酸Arg 天冬氨酸Asp 半胱氨酸Cys 谷氨酰胺Gln 谷氨酸Glu 组氨酸His 异亮氨酸Ile 甘氨酸Gly 天冬酰胺Asn 亮氨酸Leu 赖氨酸Lys 甲硫氨酸Met 苯丙氨酸Phe 脯氨酸Pro 丝氨酸Ser 苏氨酸Thr 色氨酸Trp 酪氨酸Tyr 缬氨酸Val 1.等电点:在某一特定pH值溶液时,氨基酸主要以两性离子形式存在,净电荷为零,在电场中不向电场的正极或负极移动,这时的溶液pH值称为该氨基酸的等电点。 2.杂多糖:水解时产生一种以上的单糖或和单糖衍生物,例如果胶物质、半纤维素、肽聚糖和糖胺聚糖等 3.复合糖:糖类的还原端和蛋白质或脂质结合的产物。 4.蛋白多糖:又称黏多糖,为基质的主要成分,是多糖分子与蛋白质结合而成的复合。 5.糖蛋白:糖蛋白是一类复合糖或一类缀合蛋白质,糖链作为缀合蛋白质的辅基,一般少于是15个单糖单位,也称寡糖链或聚糖链。 6.糖胺聚糖:曾称粘多糖,氨基多糖和酸性多糖。糖胺聚糖是一类由重复的二糖单位构成的杂多糖,其通式为:【己糖醛酸-己糖胺】n,n随种类而异,一般在20到60之间。 7.复合脂:除含脂肪酸和醇外,尚有所谓非脂分子成分(磷酸、糖和含氮碱等),如甘油磷脂、鞘磷脂、甘油糖脂和鞘糖脂,其中鞘磷脂和鞘糖脂又合称为鞘脂。 8.必需脂肪酸:体内不能合成或合成速度不能满足机体需要,必须通过食物供给。9.脂蛋白:是由脂质和蛋白质以非共价键结合的复合体。 10.活化能:指在一定温度下,1mol底物全部进入活化态所需要的自由能

11.过渡态:在酶催化反应中,酶与底物或底物类似物间瞬时生成的复合物,是具有高自由能的不稳定状态。 12.全酶:(1)由蛋白质组分(即酶蛋白)和非蛋白质组分(一般为辅酶或激活物)组成的一种结合酶。(2)含有表达全部酶活性和调节活性所需的所有亚基的一种全寡聚酶。 13.反馈抑制:是指最终产物抑制作用,即在合成过程中有生物合成途径的终点产物对该途径的酶的活性调节,所引起的抑制作用。 14.多酶复合体:多种酶靠非共价键相互嵌合催化连续反应的体系,称为多酶复合体15.酶的专一性:指酶对底物的选择性,也称特异性。 16.诱导契合学说:当底物和酶接触时,可诱导酶分子的构象变化,使酶活性中心的各种基团处于和底物互补契合的正确空间位置,有利于催化。 17.不可逆性抑制:抑制剂(大多数毒物)和酶的结合是共价的,不能用一般的物理方法解除抑制而使酶“复活”,必须通过特殊的化学处理才可能将抑制剂从酶分子上移去。18.可逆性抑制:抑制剂与酶的结合是非共价的、可逆的,可以用透析或超过滤等方法除去抑制剂,使酶活性恢复。 19.竞争性抑制:I和S结构相似,竞争酶的活性部位,如丙二酸对琥珀酸脱氢酶的抑制。 20.非竞争性抑制:I与酶活性部位以外的地方结合,既能与游离酶E结合,也能与ES 结合,并且底物和抑制剂与酶的结合严格地互不干扰,有人称之为纯非竞争性抑制。21.反竞争性抑制:I只能和ES结合,形成IES三元复合体。I不影响酶与底物的结合,但它阻止IES生成产物。I倾向于使ES复合体更加稳定。

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