KEGG数据库的使用方法与介绍（转）
KEGG的数据KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系；基因组信息主要是从NCBI 等数据库中得到的，除了有完整的基因序列外，还有没完成的草图；另外KEGG中有一个“专有名词”KO（KEGG Orthology），它是蛋白质（酶）的一个分类体系，序列高度相似，并且在同一条通路上有相似功能的蛋白质被归为一组，然后打上KO（或K）标签。下面就首先来讲一下KEGG orthology。任找一个代谢通路图，在上方有pathway meue | payhway entry | Show(Hide) description | 这3个选项，点击pathwayentry, 出现了一个页面，这个随时被连接出来的页面相信大家一定再熟悉不过了。在这个页面中的pathway map项中点击按钮状的链接Ortholog table 。就进入了Ortholog table如下的页面：在这个表中，行与物种对应，3个字母都是相应物中的英文单词缩写，比如has 表示Homo sapiens，mcc表示Macaca mulatta；列就表示相应的Ortholog分类，比如K00844就表示生物体内的己糖激酶hexokinase 这一类序列和功能相似的蛋白质类（酶类）。如上图has后有3101，3098，3099这3个条目，它表示在人类细胞中中存在3中不同的己糖激酶，它们分别由以上这3
组数字代表的基因所编码，这3组数字应该是这3个基因的登录号。空白则表示在该物种中不存在这种酶。点击K00844则这一KO分类信息及成员列表都可显示出来；点击has则链接到物种（人类）基因组去了；点击P，则显示相应的代谢通路。下面我们点击3101，如下：
如上图，就是我们常见的一个页面，3101是KEGG中的基因ID（登录号），H.sapiens表示物种，然后是基因的名称，表达的酶，属于哪个KO分类以及参与哪些代谢途径；下面还有结构、序列信息等等。所以从Ortholog table 中可以很容易地知道一张代谢通路上有哪些KO分类（酶类），并且这些酶类的成员在各物种中分配存在的情况以及特定的名称。怎么看KEGG中代谢通路图比如以上这个图，方框一般就是酶，方框里面的5.4.2.2不是IP 而是EC编号；小圆圈代表代谢物，你把鼠标放上去，（别放我这上面，放KEGG中去）会出现C00668的东西，C代表compound，00668是这种化合物在KEGG中的编号，一般在KEGG中数据条目都是这样的，前面一个标志，后面一个五位数编号；大的圆方块，就表示是另一个代谢图了，所以就不展开了。但是：为什么这个图上有的小框框是绿色呢？（这是绿色吧？我蓝绿不分的，下同）因为这是一张特定物种（S. cere. 酿酒酵母）的代谢图，蓝色的框框表示专属于这个物种。在KEGG中有两种代谢图，一
种是参考代谢通路图reference pathway，是根据已有的知识绘制的概括的、详尽的具有一般参考意义的代谢图，这种图上就不会有绿色的小框，而都是无色的，所有的框都可以点击查看更详细的信息；另一种就是像上面这样的属于特定物种的代谢图species-specific pathway，会用绿色来标出这个物种特有的基因或酶，只有这些绿色的框点击以后才会给出更详细的信息。这两种图很好区分，reference pathway 在KEGG 中的名字是以map 开头的，比如map00010，就是糖酵解途径的参考图，而特定物种的代谢通路图开头三个字符不是map而是种属英文单词的缩写（应该就是一个属的首字母+2个种的首字母）比如酵母的糖酵解通路图，就是sce00010，大肠杆菌的糖酵解通路图就应该是eco00010吧。那么：怎么找这两种图呢？（1）有下拉列表的时候，在列表选择reference 或者是特定物种即可。（2）在pathway检索的页面
http://www.genome.jp/kegg/pathway.html ，如下图：
默认的就是map，参考图，你想要什么物中的代谢图写上它的名称就好了（种属缩写），如果不知道是哪3个字母，点击organism 选择即可。（不过你点进去也是一片空白，你要提示两个字母才会给出下拉条目）顺便问一下：怎么找基因呢？还是上面这张图，看到了吗，除了PATHWAY 之外是不是还有BRITE、DISEASE..以及GENES等等，点击基因GENES，就可以查找基因了，如下图：不
过这里要按一定的格式（org:gene）输入要查找的目的基因，比如它给出的示例：syn表示物中，ssr3451表示基因ID，查找出来的基因名称是psbE。其实我试了一下，若直接检索基因名称（而不是KEGG中的基因ID）syn:psbE 也是一样的。因为我不知道KEGG中基因ID如何编制的，但是，我同时也不知道基因的名称是如何定义的。比如果糖1，6-二磷酸酶Fructose 1,6-biphosphatase 的基因就叫fbp,我放进去能检索，但是我把有名的gal填上去就不能检索，当然这可能与基因后面的乱七八糟的序号后缀有关，比如填上gal1就能检索了，所以我真不知道基因到底怎么命名的？当然我在syn 中没找到gal1在sce中检索到了，这也说明了基因果然不是乱长的。依旧是上面这个图，看到KEGG2了吗？点击。也会出现检索框，这是一个总体性地检索框，在这里面输入关键词，代谢通路也好，glycolysis也好，gal也好，化合物也好，没那么多限制，KEGG中的相关东西都会检索出来，在这里浏览一下，再进行后续检索，也是一个不错的方法。当然，代谢通路图，还有其他的查看形式（比如以KO查看），以及图上可以点击，链接到这链接到那，点来点去总能点出奇怪的页面来，熟悉一下也就熟悉了，这些东西会很有用，所以我就不说了。下面讲一下KEGG的自动注释功能。KEGG的自动注释KEGG Automatic Annotation Server，KEGG的自动注释服务简称
KAAS。在线网址为http://www.genome.jp/tools/kaas/ 。就是你提交一段蛋白质序列或者基因序列（必须是fasta格式），它自动在内部进行相似性比对，找到最相似的基因，并确定检索基因的KO分类，然后给出这些基因所在的代谢通路并以以不同的颜色标示这些基因。如下图：我在help 中随便复制了它的两条示例氨基酸序列，然后粘贴到检索框中，进行了检索。检索框默认的蛋白质序列，如果不是的话要改选。然后填上一个邮箱地址，点击又下角的compute即可。不出意外的话，你在接下来的页面中应该看不到任何结果，甚至连提示都没有，原来它把结果发到你邮箱去了。我也不明白就一个网页链接为什么还硬要发送到邮箱。首先发你一封信说已经接受，并给你一个期待结果显示的网址，一段时间后，会发你另外一封邮件，说已经完成。打开它给的网址，就能看到结果了，如下：看来从1：20开始计算到1：50 才结束，两条氨基酸链计算了30分钟（不过我感觉没这么长呀）。人家说了，计算时间是与要和检索序列对比的目标序列成正比，因此在检索的时候最好限制一下检索范围。点击html 有两条代谢通量图的条目，点开他们就可以直观地看出我们检索的未知序列在代谢通路中的位置和作用了。Text给出的是两个KO分类。好像北京大学的生命科学学院也搞了一个KOBA，也是基于KEGG 中的KO进行注释的一个服务，应该和这个差不多
吧。代谢通路的着色怎么在KEGG检索出来的代谢通路中给特定的一些化合物或者基因（酶）着色以高亮显示呢？进入网页
http://www.genome.jp/kegg/tool/color_pathway.html ，或者由pathway主页的Color objects in KEGGpathways进入，看图：如上图，search against 下拉出你可供选择的代谢通量图，总所周知的一个很烦人的问题就是，在这些下拉列表中，条目排序竟然是乱七八糟的很难索引。还好我发现把焦点定在这个下拉列表的最顶端的文本框上（即文本框变成选中的蓝色），然后在键盘上拼写你要的那个物中的英文单词，只需要拼两三个字符相应的代谢通量图就出现在顶端了。比如我要找酵母的代谢通量图，只需要在文本框变蓝的时候拼写“sacc”这几个字符“Saccharomyces cerevisiae(budding yeast)”就自动被置于上面了。或者不把焦点集中在文本框中也行，但是你要很快地拼写sacc，否者的话焦点会在以这几个字符开头的条目之间切换。如上图，右边有示例，这个貌似不要太简单。想给谁着色就把它写出来后面跟上颜色就好了，一个一行。比如写上C00118 blue 就表示在代谢通路图中把C00118这种代谢物（3-磷酸甘油醛，GAP）给着上蓝色。但是大家也看出来了，着色可以自定义背景色，也可以同时定义前景色。我曾一度琢磨前景色是干嘛的，琢磨半天发现没用。背景色就是把方框或者圆圈涂成选定的颜
色，这自然是要的；而前景色是谁的颜色，就是方框里面的5.4.2.2 这几个数字的颜色，或者是小圆圈圆周的颜色，这有必要定义吗，所以后面直接跟一种颜色就行了。
然后就可以了。我随便弄个gal1想去着色，KEGG突然说在酵母中找不到gal1，怎么可能找不到呢？我前面还在GENES 中搜过呢，分明是酵母，分明是gal1,分明搜的到，我当时还大为兴叹，唉，看来基因果然不能乱长啊，怎么可能一顿饭就说找不到了呢？我又回去搜里一下，确实搜的到，我再回来着色还说找不到。发现没有哪里不对呀，难道在这里KEGG 着色只能输入基因ID而不能输入名称？不是，输入基因ID 能给着色，基因名称也应该能给…哈哈，我突然大笑起来，一定是KEGG区分大小写了！果然，我把搜到的GAL1输进去，好了！用gal1又不行了。我突然觉得好玩起来，就一次次地改大小写，一次次地看它给出的错误报告，一次次得意地嗤笑它的弱智。既然区分大小写，那red能着红色，Red、RED肯定就不认识了，果然改写一个大小写的red就没反应了，c00118也不认识了。前面那么多检索一直都不区分大小写的，在这里怎么区分大小写呢？KEGG显然把这点疏忽了。着色结果如下：（红色的就是GAL1的酶，右上角的就是
C00118）代谢物还好，如果要着色酶，没必要去找基因，还免得像我那样麻烦，直接在输入框中输入相应的酶就好了，比如ec:2.7.1.6 red(ec 要小写) 跟GAL1 red 是
一样的。或者直接写2.7.1.6 red 也是一样的。这种着色功能还可用于对比（或寻找）两个不同物种的一些基因，或者根据芯片数据，直观地示意一些基因的表达调控。着色内容也可以预先按以上规定的格式写在文本文件中，然后直接浏览导入也行。基因芯片数据的分析我对基因芯片数据（表达谱）的分析也是蛮感兴趣的。利用基因芯片的表达数据，分析不同实验条件下的一些上调或下调基因，并与生物通路结合起来，用不同的颜色来直观地反映代谢通路中各基因表达的变化情况，可以为更好地研究代谢网络提供了很大的帮助。以前出去听人家讲课，只知道GenMapp不错，可以把基因芯片数据和通路结合起来，没想到在KEGG中也可以实现这一功能。进入网页http://www.genome.jp/kegg/expression/ 。网页左边是KEGG 自身拥有的一些基因表达数据集KEGG EXPRESSION Database。网页的右边KegArray就是要进行芯片分析的工具了。在KEGG EXPRESSION 下面，点击“list of experimental data available”，就打开了KEGG中的基因芯片数据，见下图：这是芯片数据的一个目录层次，箭头向右和向下分别表示收起和展开数据。我们以上图中的第一条数据为例，即Suzuki et al. 做的关于Synechocystis PCC6803 冷激响应的一条数据ex0000012, 点击这个数据，在打开的页面下面有个option 列表，点击Launch KegArray,加载这个应用程序来分析这条数
据。出现如下对话框：问你是打开还是保存，打开就相当于临时用一下，网页关掉就没了；保存就是把这个软件下载到自己的电脑上，以后还可以用。你先打开试试吧，这个不是关键，关键的是你可能打不开这个文件。大家都知道，生物信息学的一些软件往往要求安装JA V A才能运行，我JA V A早就安装了，但是仍然告诉我打不开这个文件，我看了一下文件格式，是什么JNLP格式的没见过，看看属性，又从网上搜搜，说需要java web start 才能打开和运行，我安装了JA V A,java web start 在哪里找到和启动，查了半天也没个头绪，忽然一想，java web start 肯定在JA V A安装文件夹里，取首字母缩写，很有可能是javaws.exe,我一搜还真在安装文件夹里搜到这个执行程序了，用作JNLP的默认打开方式，立马就呼呼地启动了。出现了如下的界面：
图中的File Name、Organism还都对，下面的参数一般都是默认的，不需要改。右边还有一个统计图，用以显示上调、下调和不调的基因数目比例。绿色表示下调，红色上调，黄色无明显差异（之前有文献说红色是下调，搞的我迷糊了好大一阵子！）。那怎么在生物学通路中看这些基因的调整情况呢？看到最下面的Mapping to 了吗，选择pathway(默认的也是pathway),GO一下，就OK了。然后它就会把这个芯片数据涉及到的基因所在的通路图列
出来，并在通路中用不同的颜色标明基因表达差异。如下图
（选取的是嘌呤代谢通路的一部分）绿色表示基因下调，黄色表示没明显变化，灰色是什么，这个可能species-specific 基因，与芯片无关的吧。那怎么没红色？（1）通路中本就没有基因上调（2）虽然绿色表示下调，红色上调，但是在他们之间有过渡的颜色，比如某个基因只是稍微上调，因此不能大红大紫，只能呈现过渡的暗黄色。如果你一定有见红情结的话，那你可以在help 菜单中选择preferences,把颜色梯度改成1，即下调就是绿色，上调就是红色，没中间余地。此时一旦有所上调不论多少都是大红。（呵呵）除此之外，看到了吗，KegArray还有一个做聚类Clustering的命令，你可以点击GenomeNet从KEGG中选择芯片数据进行聚类，不过貌似做得很简单，也没有红绿颜色。当然，你可以选择KEGG其他芯片数据进行类似分析，可可以从本地导入其他的芯片数据。也可以把KegArray保存在本地运行，但是不管怎样，不管你选在KEGG中选了那条数据，需要指出的一点是，当你再运行KegArray时，加载的数据总是你第一次使用的数据。比如我即使在KEGG中选择ex000013 而不是ex000012,然后launch KegArray, 启动后出现的数据依旧是我第一次分析的数据ex000012而不是ex000013, 只有打开以后，点击GenemoNet重新选择芯片数据。而KegArray本身又找不到可以设置这些东西的地方，真不知道KEGG想要干嘛！
KGML与通路编辑这个我不打算多讲，因为我自己也在踌躇着要不要学习呢。KGML，即KEGG Markup Language的简称，我自己的理解就是它包含代谢通路中各组件以及各组件之间的相互联系，因此是代谢通路构建的指令。在KEGG中可以以xml的格式进行下载：ftp://ftp.genome.jp/pub/kegg/xml/ 。据说这种KGML文件，打开时，能以另一种方式查看代谢通路，即酶和化合物之间的各种交叉联系，我很想看，但郁闷的是，我xml也下了，一个叫什么KGML DTD的也下了（见http://www.genome.jp/kegg/xml/），但是打开后没反应啥图也没有。可能需要一些专门的软件才能打开吧，比如VisANT, GenMAPP, PathwayExpert等。另一方面就是越来越多的软件开始支持并应用到KGML了，但是我感兴趣的是有些软件已经能够基于KGML进行KEGG代谢通路的编辑了。单是一个图的话，用PS修饰或许也能搞定，但是如果是大规模地建模或修改代谢通路，显然需要这些软件。有个软件KGML-ED
（http://kgml-ed.ipk-gatersleben.de/Introduction.html），安装竟然需要1.6的java版本，我用1.5的试了试，还真不行...
其他的软件有的能把KGML转换成SBML(如KGMLConverter)，貌似SBML也是生物学软件中主流的东西，能建模能可视化。不知道有没有人知道呢？最后做个总
结吧，KEGG也是一个很全面的数据库，不仅是代谢通路，基因信息，化合物反应等数据也是很不错的，但是难免又有一些疏忽之处，比如，着色输入框区分大小写，KegArray启动时数据不对等，总的来讲还是很cool的数据库。有越来越多的科研者基于KEGG开发了一些实用的工具，比如基于KEGG KO的注释工具KAAS, KOBA等，基于KEGG KGML 的通路建模工具KGML-ED, KGMLconverter等，相信大家对KEGG的利用会越来越充分的。另外，KEGG也在不断的发展和更新中，本文中的一些页面都有可能改动和变化，希望后来交流者，有所知晓，也希望大家一起分享经验
数据库及其应用 1、名词解释（英文一定要写全称！） DB:即数据库(Database)，是统一管理的相关数据的集合。DB能为各种用户共享具有最小冗余度数据间联系密切而又有较高的数据独立性。 DBS：即数据库系统(Database System)，是实现有组织地、动态地存储大量关联数据方便多用户访问的计算机软件、硬件和数据资源组成的系统即采用了数据库技术的计算机系统。 DBMS：即数据库管理系统(Database Management System)，对数据库进行管理的系统软件，是与数据库之间的接口。DBA：即数据库管理员(Database Administrator)，是数据库系统中的高级用户，全面负责数据库系统的管理、维护、正常使用等工作。 ODBC：即开放数据库互连(Open Database Connectivity)，是微软公司开放服务结构(WOSA，Windows Open Services Architecture)中有关数据库的一个组成部分，它建立了一组规范，并提供了一组对数据库访问的标准API（应用程序编程接口）。 SQL：结构化查询语言(Structured Query Language)，是美国国家标准局ANSI确认的关系数据库语音的标准。OOP：即面向对象的程序设计(Object Oriented Programming)，是一种计算机编程架构，由单个能起到子程序作用的单元或者对象组合而成。 E-R图：是E-R模型的图形表示法，它是直接表示概念模型的有力工具。 数据模型：表示实体类型及实体类型间联系的模型称为“数据模型”。它可分为概念数据模型和结构数据模型两种类型。 主关键字：所有字段中最重要的，唯一能确定其他字段值的关键字。 外部关键字：关系表中某个属性或属性组合并非关键字，但却是另一个关系表的主关键字。 元数据：是最小数据，不可再分割的数据就是元数据。 数据处理：对各种数据的进行收集、存储、分类、计算、加工、检索和传输的过程。 面向对象的概念 类：把具有相关性的一类对象的整体的总和。 基类：即基本类，系统提供的内部定义的类，可用作其他用户自定义类的基础。 子类：在基类上派生出来的类。 对象：是类的实例化的产物，并具有相关的成员变量和成员函数（方法）。 属性：描述对象特性的字段称为属性。 15：20事件：是单一的一个动作 方法：是事件如何运行的操作手段 工作区：work space 在内存里单独存储一张表的区域，一张表对应一个工作区。 主控索引：当前起作用的索引称为主控索引。 关系模型：是用二维表结构来表示实体以及实体间联系的模型。 参照完整性：对关系数据库中建立关联关系的关系间数据参照引用的约束，也就是对外键的约束。准确的说，参照完整性是指关系中的外键必须是另一个关系的主键有效值，或者是Null。 2、文件的扩展名：（t都是备用选择填空题） ●项目文件：.PJX 、.PJT ●表文件：.DBF 、.FPT 、.CDX ●数据库：.DBC 、.DCT 、.DCX
数据库及其应用重考复习资料 一、名词解释 1、数据处理：对各种数据的进行收集、存储、分类、计算、加工、检索和传输的过程 2、对象：是类的实例，类是对于拥有数据和一定行为特征的对象集合的描述。每个对象都有其属性和方法，并能响应特定的事件。可以通过对象的事件、属性和方法来处理对象 3、ODBC：开放式数据库互连ODBC是一种用于数据库服务器的标准协议，通过ODBC可访问多种数据库中的数据，可安装多种数据库的ODBC驱动程序，从而使VFP可以与该数据库相连，访问数据库中的数据。 4、超关键字：二维表中能唯一确定记录的一个或几个列的组称为“超关键字后（superkey）”。如果是用单一的列构成关键字，则称其为“单一关键字（Single Key）”；如果是用两个或两个以上的列构成关键字，则称其为“合成关键字（Composite Key）”。 5、主控索引:在复合索引的多个索引中，在某一时刻只有一个索引对表起作用，这个索引标志称为主控索引。 6、事件 7、类 8、数据处理 二、单项选择题 1、表单文件的扩展名是（ B ）。 A. PRG B. SCX C. MPR D. VCX 2、Visual FoxPro是一个（D ）。 A. 数据库管理员 B. 数据库 C. 数据库系统 D. 数据库管理系统 3、在Visual FoxPro环境下，运行表单的命令是（ A ）。 A. DO FORM <表单名> B. DO <表单名> C. CREATE FORM <表单名> D. REPORT FORM <表单名> 4、检测数据库文件指针是否已到文件头的函数是（D ）。
A. BOF（） B. EOF（） C. END（） D. FIEL（） 5、逻辑运算符的优先顺序是（a ）。 A. .NOT.、 .AND. 、.OR. B. .NOT.、 .OR.、 .AND. C. .AN D.、 .OR. 、.NOT. D. .AND.、 .NOT.、 .OR. 6、设S=“南京大学计算机基础教学部”，从变量S中取出“计算机”三个字的表达式是（）。 A. SUBS（S，5，3 ） B. SUBS（S，9，6） C. SUBS（S，9，3） D. SUBS（S，5，6） 7、下列字符中不能做变量名的开头的是（ d ）。 A. 英文字母 B. 下划线 C. 汉字 D. 数字 8、将当前表ZGB．DBF中男职工的工号、姓名、工资、奖金四个字段的数据复制成GZB1 .DBF表文件，应使用命令（）。 A. COPY TO GZB1 FIEL工号，姓名，工资，奖金FOR 性别="男" B. COPY GZB1 FIEL工号，姓名，工资，奖金FOR 性别="男" C. COPY TO GZB1 FOR性别="男" D. COPY TO GZB1 FIEL工号，姓名，工资，奖金 9、根据需要，可以把查询的结果输出到不同的目的地。以下不可以作为查询的输出类型的是（D）。 A. 自由表 B. 报表 C. 临时表 D. 表单 10、关系模型的基本结构是（A ）。 A. 二维表 B. 树形结构 C. 无向图 D. 有向图 11、表单的前景色由属性（ C ）的值确定。 A. BackColor B. Picture C. ForeColor D. Caption 12、在数据库表字段的扩展属性中，通过对（）可以限定字段内容取值的范围。 A. 字段格式 B. 输入掩码 C. 字段标题和注释 D. 字段级规则 13、DBA是（）。 A. 数据库管理员 B. 数据库 C. 数据库系统 D. 数据库管理系统 14、页框（PageFrame）能包容的对象是（）。 A. 列(Column) B. 标头(Header) C. 页面(Page) D. 表单集(FormSet) 15、下列说法正确的是（）。 A. 当数据库打开时，该库中的表将自动打开。
测验1 一、单选 1、 下列四项中说法不正确的是( )。 （分数：2 分） A. 数据库减少了数据冗余 B. 数据库中的数据可以共享 C. 数据库避免了一切数据的重复 D. 数据库具有较高的数据独立性 标准答案是：C。 2、 单个用户使用的数据视图的描述称为（）。 （分数：2 分） A. 外模式 B. 概念模式 C. 内模式 D. 存储模式 标准答案是：A。 3、 数据库物理存储方式的描述称为( ) 。
（分数：2 分） A. 外模式 B. 内模式 C. 概念模式 D. 逻辑模式 标准答案是：B。 4、 在下面给出的内容中，不属于DBA职责的是( ) 。 （分数：2 分） A. 定义概念模式 B. 修改模式结构 C. 编写应用程序 D. 编写完整性规则 标准答案是：C。 5、 在数据库三级模式间引入二级映象的主要作用是( ) 。 （分数：2 分） A. 提高数据与程序的独立性 B. 提高数据与程序的安全性
C. 保持数据与程序的一致性 D. 提高数据与程序的可移植性 标准答案是：A。 6、 DB、DBMS和DBS三者之间的关系是( ) 。 （分数：2 分） A. DB包括DBMS和DBS B. DBS包括DB和DBMS C. DBMS包括DB和DBS D. 不能相互包括 标准答案是：B。 7、位于用户和操作系统之间的一层数据管理软件是（）。（分数：2 分） A. DBS B. DB C. DBMS D. MIS 标准答案是：C。 8、数据库的三级模式中，数据的全局逻辑结构用（）来描述。（分数：2 分） A. 子模式 B. 用户模式 C. 模式
一、单选 1、 下列四项中说法不正确的是( )。 （分数：2 分） A. 数据库减少了数据冗余 B. 数据库中的数据可以共享 C. 数据库避免了一切数据的重复 D. 数据库具有较高的数据独立性 标准答案是：C。 2、 单个用户使用的数据视图的描述称为（）。 （分数：2 分） A. 外模式 B. 概念模式 C. 内模式 D. 存储模式 标准答案是：A。 3、 数据库物理存储方式的描述称为( ) 。 （分数：2 分） A. 外模式
C. 概念模式 D. 逻辑模式 标准答案是：B。 4、 在下面给出的内容中，不属于DBA职责的是( ) 。 （分数：2 分） A. 定义概念模式 B. 修改模式结构 C. 编写应用程序 D. 编写完整性规则 标准答案是：C。 5、 在数据库三级模式间引入二级映象的主要作用是( ) 。 （分数：2 分） A. 提高数据与程序的独立性 B. 提高数据与程序的安全性 C. 保持数据与程序的一致性 D. 提高数据与程序的可移植性 标准答案是：A。 6、 DB、DBMS和DBS三者之间的关系是( ) 。
（分数：2 分） A. DB包括DBMS和DBS B. DBS包括DB和DBMS C. DBMS包括DB和DBS D. 不能相互包括 标准答案是：B。 7、位于用户和操作系统之间的一层数据管理软件是（）。（分数：2 分） A. DBS B. DB C. DBMS D. MIS 标准答案是：C。 8、数据库的三级模式中，数据的全局逻辑结构用（）来描述。（分数：2 分） A. 子模式 B. 用户模式 C. 模式 D. 存储模式 标准答案是：C。 9、用户涉及的数据逻辑结构用（）描述。（分数：2 分） A. 模式 B. 存储模式 C. 概念模式 D. 子模式 标准答案是：D。 10、
C#常用操作数据方法整理 using System.Data.SqlClient; //导入sql数据库命名空间，这样可以用sql数据库操作相关类 String ConnectionStr = "server=.;database=数据库名；uid=sa;pwd=123456;"; //数据库连接字符串，server确定数据库服务器名，database定义数据库名,uid定义数据库使用者用户名，pwd为密码。 SqlConnection conn = new SqlConnection(ConnectionStr); //建立数据库连接，只有建立连接了才能操作数据。 //也可以合在一起：SqlConnection conn = new SqlConnection(“server=.;database=数据库名； uid=sa;pwd=123456;”); String SQLString=“”； //数据操作语句放在双引号中，语句有增，删，改，查操作。 SqlCommand comm = new SqlCommand(SQLString, conn); //建立数据库命令，确定sql数据操作语句，和数据库连接。 //也可以合并，SqlCommand comm = new SqlCommand(“数据库操作语句”, conn); conn.Open(); //打开数据库，只有打开数据库，数据库命令才能被执行。 int rows = comm.ExecuteNonQuery(); SqlDataReader dr = comm.ExecuteReader(); //专门用于读取数据库数据 Object result= comm. ExecuteScalar(); //或string result= Cmd. ExecuteScalar().Tostring(); //执行数据库命令： //ExecuteNonQuery（）用于增，删，改操作，返回受影响的行数; //ExecuteReader()用于查操作，返回一个SqlDataReader类的对象； //comm.ExecuteScalar()执行查找，返回从数据表中查询结果的第一行第一个单元格的数据。conn.Close();
《数据库及其应用》补考复习资料（一） 一、单项选择题：（每题2分，共20题，共40分） 1、下列描述的实体联系方式中错误的是（）。 A、一对一 B、一对二 C、一对多 D、多对多 2、文件系统与数据库系统的主要区别是（）。 A、文件系统简单,而数据库系统复杂 B、文件系统不能解决数据冗余和数据独立性问题,而数据库系统可以解决 C、文件系统管理的数据量少,而数据库系统可以管理大量数据 D、文件系统只能管理数据文件,而数据库系统可以管理各种类型文件 3、不同实体之所以不同是根据（）的不同加以区分的。 A、主键 B、外键 C、属性的语义、类型和个数 D、名称 4、存放金额数据，不能使用的字段数据类型是（）。 A、文本型 B、单精度数字型 C、双精度数字型 D、货币型 5、存放身份证号码最好采用（）。 A、数字型中的字节型 B、数字型中的整型 C、数字型中的长整型 D、文本型并设置字段大小为15 6、下列字段的数据类型中，不能作为主键的数据类型是（）。 A、文本 B、是／否 C、自动编号 D、数字 7、在表的设计视图中创建表，必须对每个字段进行定义的是（）。 A、字段名称和说明 B、字段名称、数据类型和说明 C、字段名称和标题 D、字段名称和数据类型 8、通过输入数据创建表，下列说法中错误的是（）。 A、系统自动提供10列21行的空表供用户输入数据
B、在一列中可以输入不同类型的数据 C、用户可以更改字段名 D、在空表的一列中均输入日期值，则该列字段将被指定为日期型 9、建立关系的两个表，主表与相关表（）。 A、具有相同的主键 B、主表的主键字段必须出现在相关表的字段中 C、相关表没有重复的值 D、主表可以有重复的值 10、Access中的基本查询类型是（）。 A、选择 B、交叉表 C、参数 D、操作 11、在查询设计视图窗口中设置（）行，可以使该字段只用于设置准则，而查询结果并不出现在查询数据表视图中。 A、准则 B、排序 C、显示 D、字段 12、如果在查询准则中输入Like张[小中大]军，能查到的是（）。 A、张伟军 B、张广军 C、张利军 D、张大军 13、下列关于选择查询论述中错误的是（）。 A、查询数据源可以来自于一个表 B、查询数据源可以来自于多个表或其他查询 C、查询数据源可以来自于一个数据库 D、查询数据源可以来自于网络数据库服务器中的某个表 14、下列设置的查询工资在1500元到2000元之间的准则正确的是（）。 A、>=1500 or <=2000 B、1500 and 2000 C、Between 1500 and 2000 D、Between >=1500 and <=2000 15、假定职工表只含姓名和出生日期两个字段，现要求在查询中建立一个年龄字段并计算出职工的年龄，下列设置中错误的是（）。 A、年龄Year(Date())-Year([]生日期]) B、年龄Year(Date())-Year(出生日期) C、年龄Year(Now())-Year([]生日期]) D、年龄Date()-Year(出生日期)
数据库及其应用（二） 一、单项选择题（本大题共20小题，每小题2分，共40分） 在每小题列出的四个备选项中只有一个是符合题目要求的，请将其代码填写在题后的括号内。错选、多选或未选均无分。 1.从用户需求观点看，对数据库全局逻辑结构的描述是数据库的( ) A.概念模型 B.逻辑模型 C.外部模型 D.内部模型 2.在数据库系统阶段，如果在整体逻辑结构和应用程序，不影响用户的逻辑结构及应用程序，我们就认为数据库达到（） A.物理数据独立性 B.关系数据独立性 C.逻辑数据独立性 D.概念数据独立性 3.下列选项中，不．属于关系模型三类完整性的是( ) A.实体完整性规则 B.参照完整性规则 C.用户定义完整性规则 D.数据完整性规则 4.下列哪种操作是对一个关系进行垂直分割，消去某些列，并重新安排列的顺序 ( ) A.连接 B.笛卡尔积 C.选择 D.投影 5.Access是一个( ) A.DB B.DBS C.DBMS D.OS 6.在Access数据库中真正存储数据的对象是（） A.表 B.窗体 C.报表 D.数据访问页7.下列选项中，不．属于Access数据库对象的是( ) A.表 B.查询 C.窗体 D.组 8.有学生和成绩表：S(学号，姓名，性别，系名称)和SC(学号，课程号，分数)。如下图所示，SC表是S表的子表，则S与SC之间的关系是( ) A.一对一 B.一对多 C.多对多 D.无关系 题8图 9.关于数据库的密码，下列说法错误的是（） A.维护数据库的安全性 B.维护数据库的可靠性 C.以独占方式才能打开数据库 D.撤销数据库密码需要原来的密码 10.在查询的设计视图中，若设置查询准则如图所示，则查询准则表达式是( ) A.BETWEEN 18 AND 60 AND"男" B.BETWEEN 18 OR 60 AND"男" C.年龄>=18AND 年龄<=60 AND 性别="男" D.年龄>=18AND 年龄<=60 OR 性别="男" 题10图 11.创建一个查询，若该查询在执行时能够根据输入的学号显示一个学生的成绩单，则这个查询是( ) A.追加查询 B.操作查询
题号:1 题型:单选题（请在以下几个选项中选择唯一正确答案）本题分数:2.5 下列程序段的输出结果是______。 CLOSE DATA a=0 USE 教师GO TOP DO WHILE .NOT. EOF() IF 主讲课程＝"数据结构" .OR. 主讲课程＝"C语言" a=a+1 ENDIF SKIP ENDDO ?a ?A、4 ?B、5 ?C、6 ?D、7 学员答案：c 说明： 本题得分：2.5 题号:2 题型:单选题（请在以下几个选项中选择唯一正确答案）本题分数:2.5 运行下列程序段后，输出的值是______。 y=DTOC(DATE(), 1) y=.NULL. ? TYPE("y") ?A、C ?B、D ?C、L ?D、NULL
说明： 本题得分：0 题号:3 题型:单选题（请在以下几个选项中选择唯一正确答案）本题分数:2.5 在CJ（成绩）表中有KCDH（课程代号，字符型）和CJ（成绩，数值型，宽度3，无小数位）字段。现要创建一个索引，要求先根据课程代号排序，课程代号相同时，再根据成绩排序，则索引表达式应为______。 ?A、KCDH+CJ ?B、KCDH-CJ ?C、KCDH+STR(CJ,3) ?D、DTOC(KCDH)+STR(CJ,3) 学员答案：c 说明： 本题得分：2.5 题号:4 题型:单选题（请在以下几个选项中选择唯一正确答案）本题分数:2.5 JS（教师）表中，有XDH（系代号，字符型）字段和GZRQ（参加工作日期，日期型）字段。现要创建一个索引，要求先根据系代号排序，系代号相同时，再根据参加工作日期排序，则索引表达式应为______。 ?A、xdh+gzrq ?B、DTOC(xdh)+DTOC(gzrq) ?C、xdh+DTOC(gzrq,1) ?D、DTOC（xdh,1）+DTOC(gzrq,1)
数据库的使用说明 一、登录 ●在Windows“开始”、“程序”中找到SQL Server 2000的程序项，运行查询分析器。 ●在“连接到SQL Server”对话框中选择“使用SQL Server身份验证”，输入登录名和 密码，服务器中填入“Server”，按“确定”即可使查询分析器客户端连上服务器。 用户帐号为pb05207，密码为pb05207。 ●在查询分析器的工具栏中可以选择当前要操作的数据库，在编辑窗口中写入SQL 语句后，就可以在“查询”菜单中或工具栏中选择“执行”，即可将输入的SQL语 句交给Server执行； ●在左边的树形视图中可以看到当前可以操作的数据库的结构。 ●更详细的使用可以查看帮助文件，帮助文件在 C:\Program Files\Microsoft SQL Server\Books下。 其中部分帮助文件的简要说明如下： qryanlzr.chm 查询分析器的帮助 tsqlref.chm Transact SQL语言的帮助 createdb.chm 创建和管理数据库、表、视图的帮助 acdata.chm 查询和更改数据库 dtswizrd.chm DTS导入/导出向导帮助 二、关于数据库的操作说明 登录后首先建立一个自己的数据库，以自己的学号作为数据库名； 然后进入自己的库中进行SQL语言的各种操作练习，例如建表，插入数据，删除表等等。
三、 查询分析器的一些使用说明 对象结构 模板工具 执行 数据库选择 查询窗口 打开新的查 询窗口， 系统根据选 择的菜单项， 自动地给出 相应的SQL 脚本
四、数据的导入和导出 ●运行SQL Server 2000的导入和导出数据。（其帮助信息参见dtswizrd.chm） ●选择数据源。如某表要插入的数据存放在文件中，则选择数据源的类型为“文本文 件”，操作如下： ●选择文件格式。如数据文件中每一行表示一条记录，列之间通过TAB键分隔，字 符串以单引号限定，则作如下设置：
。测验1 一、单选 1、 下列四项中说法不正确的是( )。 （分数：2 分） A. 数据库减少了数据冗余 B. 数据库中的数据可以共享 C. 数据库避免了一切数据的重复 D. 数据库具有较高的数据独立性 标准答案是：C。 2、 单个用户使用的数据视图的描述称为（）。 （分数：2 分） A. 外模式 B. 概念模式 C. 内模式 D. 存储模式 标准答案是：A。 3、 数据库物理存储方式的描述称为( ) 。
（分数：2 分） A. 外模式 B. 内模式 C. 概念模式 D. 逻辑模式 标准答案是：B。 4、 在下面给出的内容中，不属于DBA职责的是( ) 。 （分数：2 分） A. 定义概念模式 B. 修改模式结构 C. 编写应用程序 D. 编写完整性规则 标准答案是：C。 5、 在数据库三级模式间引入二级映象的主要作用是( ) 。 （分数：2 分） A. 提高数据与程序的独立性 B. 提高数据与程序的安全性
C. 保持数据与程序的一致性 D. 提高数据与程序的可移植性 标准答案是：A。 6、 DB、DBMS和DBS三者之间的关系是( ) 。 （分数：2 分） A. DB包括DBMS和DBS B. DBS包括DB和DBMS C. DBMS包括DB和DBS D. 不能相互包括 标准答案是：B。 7、位于用户和操作系统之间的一层数据管理软件是（）。（分数：2 分） A. DBS B. DB C. DBMS D. MIS 标准答案是：C。 8、数据库的三级模式中，数据的全局逻辑结构用（）来描述。（分数：2 分） A. 子模式 B. 用户模式 C. 模式
数据库及其应用教材课后习题答案 1. 信息是现实世界各种事物的存在特征、运动形态以及不同事物间的相互联系等诸要素在人脑中的抽象反映，进而形成概念。信息是资源。数据是对信息的一种符号化表示，即用一定的符号表示信息。数据是用来载荷信息的。 信息与数据，是两个既有联系，又有区别的概念。数据是信息的载体，而信息是数据的内涵。同一信息可以有不同的数据表示形式，而同一数据也可能有不同的解释。 2.由于现实世界的事物往往是相互关联的，基于这仪事实，可以从已知数据出发，参照相关数据，进行加工计算，产生出一些新的数据，这些新的数据又表示了新的信息，可以作为某种决策的依据。上述整个过程，就叫做数据处理。 数据管理是指：数据的收集、整理、组织、存储、查询、维护和传送等各种操作，是数据处理的基本环节，是任何数据处理任务必有的共性部分。 3.数据管理的主要内容包括：数据的收集、整理、组织、存储、查询、维护和传送等操作。 4.文件系统中的文件是指若干记录的集合，它是操作系统管理数据的基本单位，文件之间不存在联系。而在数据库中文件是相互联系着的，并在总体上遵循着一定的结构形式，这是文件系统与数据库系统的最大区别。 5.数据库中的数据是按一定的数据结构组织起来的，具体是按SPARC数据库三级结构组织的，三级结构从内到外分三个层次，分别称为内模式、概念模式和外模式。 （1）概念模式简称模式，是对数据库的整体逻辑描述，并不涉及物理存储，故称DBA视图。 （2）内模式又称存储模式，具体描述了数据如何组织存储在存储介质上。内模式是系统程序员用一定的文件形式组织起来的一个个存储文件和联系手段，也是由他们编制存取程序，实现数据存取的，故称内模式为系统程序员视图。 （3）外模式通常是模式的一个子集，故又称外模式为子模式。外模式面向用户，是用户眼中的数据库，故称外模式为用户视图。 6.数据库按SPARC公布的标准分为三级结构：概念模式、外模式和内模式。 三种模式的关系是：模式是内模式的逻辑表示，内模式是模式的物理实现，外模式则是模式的部分抽取。三个模式反映了对数据库的三种不同观念：模式表示概念级数据库，体现了对数据库的总体观；内模式表示了物理级数据库，体现了对数据库的存储观；外模式表示了用户级数据库，体现了对数据库的用户观。总体观和存储观只有一个，而用户观可能有多个，有一个应用，旧有一个用户观。 7.B,C. 8.C,E,F. 9.数据库系统由数据库、支持数据库运行的硬件、数据库管理系统和应用程序等部分组成。 10.数据独立有两个方面的含义，即物理数据独立性和逻辑数据独立性。所谓物理数据独立性是指数据库物
《数据库及其应用》 （课程编号：B0901000） 实验报告 （2013-2014学年第2学期） 实验成绩： 声明 截图最好能用自己的 实验2-2的图和3-2的第三个图需要自己的截图 有错自己改，别打我 学号： 姓名： 专业班级： 课堂号： 任课教师：喻晓和 完成日期：2014.5.21
2．退出Access 练习不同的Access的启动方法。 1．单击Access主窗口关闭按钮。 2．选择“文件”选项卡单击，在Backstage 视图中选择“退出”项单击。 3．单击Access主窗口左上角图标，选择“控制菜单”中的“关闭”项单击。 4．按“ALT+F4”键组合。 3．观察并了解Access用户界面 不同方式启动进入Access，其界面有所差异。 通过“开始”按钮或桌面Access快捷方式启动进入Backstage视图；通过Access数据库文件关联则直接进入Access数据库窗口。 Access用户界面主要由三个组件组成： 5．功能区。 6．Backstage 视图。 7．导航窗格。
（1）观察Backstage视图：不同方式进入Backstage视图，注意其差别。 （2）观察功能区：了解组成功能区的选项卡。 （3）观察导航窗格。各种对象的显示组合。 4．Access选项及其设置 在Backstage视图中选择“选项”命令单击，进入Access选项对话框窗口。在该窗口可设置默认文件夹等。可设置文档窗口显示方式、定制导航窗格、定制工具栏的项目等。 #．回答问题 （1）启动Access一般有几种方法？ 答：3种。 1．单击“开始”按钮，选择“所有程序”|“Microsoft Office”|“Microsoft Access 2010”菜单项单击。 2．双击Access桌面快捷方式（若没有快捷方式可先创建）。 3．打开“计算机”窗口，找到要操作的Access数据库文件，双击 （2）按键退出Access，对应的键是什么？ 答：ALT+F4。 （2）几种方式进入Backstage视图？ 答：2种。通过“开始”按钮或桌面Access快捷方式启动进入Backstage视图。 （3）最初功能区有哪几个选项卡？
数据库及其应用复习提纲 1.实体联系方式有一对一、一对多、多对多 2.从用户到数据库之间，数据库数据结构经历了外模式、逻辑模式和内模式三个级别，用 户只需逻辑的使用数据，不必关心数据的存储。 3.数据管理技术经历了人工管理、文件系统、数据库系统三个阶段。 4.数据库与文件系统的根本区别在于数据的结构化 5.支持数据库各种操作的软件是数据库管理系统 6.分解是解决冗余的主要方法，也是规范化的一条原则。 7.在关系中凡能惟一标识元组的属性（或属性集），称为关系模式的候选键。 8.设关系R（A，B,C,D,E）中的属性函数依赖为：A→B，A→C，C→D，D→E，若将关 系R分解为以下R1和R2两个关系：R1（A，B,C）R2(C,D,E)则R1属于3 范式，R2属于2范式。 9.若关系R（A,B,C,D）中，属性C只依赖于主键中的B，而与A无关，则该种依赖称为 部分函数依赖 10.关系的主属性不能取空值，属于实体完整性规则 11.学生关系S（学号，姓名，班级，班主任，课程号，课程名，学时数）属于第1范式 12.在数据库设计中，将E-R图转换成关系数据模型的过程属于概念设计阶段 13.基于“雇员”表查找所有“女”雇员的关系运算属于选择运算 14.DBMS是用户与数据库的接口，应用程序只有通过它才能和数据库打交道。 15.按下Alt+F4可以退出Access 16.Access数据库可以包含7个对象，文件扩展名为.mdb。 17.若双击Access标题栏上的控制按钮，则会关闭数据库。 18.为某个数据库对象设置说明信息的方法是单击视图菜单中选择属性命令来完成。 19.Access提供的数据压缩和修复功能，可以是受损的数据库在一定程度上得到修复。 20.Access提供的设置数据库密码和使用用户级安全机制保护都可以提高数据库的安全性 管理。 21.空数据库是指不含任何对象的数据 22.设置“默认数据库文件夹”可通过“工具”菜单中的“选项”命令并在“常规”选项卡 中进行设置 23.更改字段名称不会造成表中数据丢失 24.建立关系的两个表，主表与相关表主表的主键字段必须出现在相关表的字段中 25.除了表可作为窗体数据源外，查询也是窗体的一个重要数据源 26.获取外部数据，Access提供导入和链接两种不同的方法创建新表。 27.Access提供10种字段数据类型。 28.文本类型的字段大小属性中默认的字段大小是50个字符，最大字段大小为 255个字符。 29.在Access中创建学生表：S(学号，姓名，年龄)，要实现在年龄字段中只允许输入18 到26之间的数，则应设置年龄字段的有效性规则 30.对于一对多的表，如果设置了级联删除意味着如果删除“一”方表中的记录，则删除“多” 方表中的相关记录。 31.主窗体用来显示基表数据，子窗体用于显示相关表的数据，则基表与相关表可以是一对 一或一对多关系 32.条件中“性别＝“女” and 工资额>2000” 的意思是性别为“女”并且工资额大于2000的
一、美国 (1)Wiley InterScience(英文文献期刊) Wiley InterScience是John Wiely & Sons 公司创建的动态在线内容服务，1997年开始在网上开通。通过InterScience，Wiley公司以许可协议形式向用户提供在线访问全文内容的服务。Wiley InterScience收录了360多种科学、工程技术、医疗领域及相关专业期刊、30多种大型专业参考书、13种实验室手册的全文和500多个题目的Wiley学术图书的全文。其中被SCI 收录的核心期刊近200种。期刊具体学科划分为：Business, Finance & Management (商业、金融和管理)、Chemistry (化学)、Computer Science （计算机科学）、Earth Science （地球科学）、Education （教育学）、Engineering （工程学）、Law （法律）、Life and Medical Sciences （生命科学与医学）、Mathematics and Statistics （数学统计学）、Physics （物理）、Psychology （心理学）。 [转帖]如何用代理注册自己的wiley interscience密码 忘记了是在哪里看到的了，不过的确是好用，我已经注册了一个，介绍给大家，大家不妨也注册一个。wiley interscience原来的确验证方法已经失效，大家不妨用SD代理试试看，一般来说定了SD的确图书馆大多也定了wiley interscience。 注意:（1）必须进入代理后进行注册,否则没有相应的权限,注册后要击活,方法是:进入代理后（2）当你手上有INTERSCIENCE的密码时,不要忘记去看看过期了没有!inTERSCIENCE的PWD 用90天左右，必须续用！（据说不必须进入代理就右进行续用）方法是快到期之前点MYPROFILE--------点ActivateRoaming Access-----点LICENSE SOURCES、REFRESH ROAMING ACCESS即可。 =============================================== (2)美国IEEE (英文文献期刊) IEEE（Institute of Electrical & Electronics Engineers）是电子信息领域最著名的跨国性学术团体，其会员分布在世界150多个国家和地区。据IEEE统计，IEEE会员总数2001年比2000年增加3.1%，达到377342人，其中学生会员为65669人，增长12.6%。 随着人们的信息越来越多地来自Internet，IEEE需要为会员提供更加完善和全面的电子信息产品和服务。IEEE应成为IEEE会员获得信息的首选之地。IEEE必须识别正确的信息，并提供对它们的访问方法。实现这个目标的重要一步是通过IEEE Xplore与IEEE/IEE Electronic Library (IEL)连接。IEL包括了1988年以来IEEE和IEE的所有期刊杂志和会议录，以及IEEE的标准，可以通过题目、关键词和摘要进行查阅。 IEEE密码 =============================================== (3)美国EBSCO(英文文献期刊) https://www.doczj.com/doc/e02112076.html, 登陆-----点MYPROFILE--------点ActivateRoaming Access即可。 数据库简介： EBSCO公司从1986年开始出版电子出版物，共收集了4000多种索引和文摘型期刊和2000多种全文电子期刊。该公司含有Business Source Premier （商业资源电子文献库）、Academic Search Elite（学术期刊全文数据库）等多个数据库。500XK6 Business Source Premier收录了三千多种索引、文摘型期刊和报纸，其中近三千种全文
2010 数据库及其应用复习资料参考 一、计分方式: 60%+20%+20% 二、期末考试:闭卷 三、题型:单项选择题、填空题、简答题、数据库设计题、操作题、SQL命令。 四、具体情况: 选择题、填空题、简答题涉及第1、2、3、4、5、11、12章得内容。 数据库设计题涉及:ER模型设计、关系模型、数据库表结构得设计。 操作题涉及:表定义(字段及常见类型、主键、外键及关系、有效性规则、查阅绑定)、交叉表查询、表得导入导出得基本过程(主要与EXCEL与文本文件交换方法。)。 表结构、数据类型(掌握主要类型)、表设计视图定义表(包括各类完整性得实现)、查阅选项(这次不考核格式属性与输入掩码)。 SQL命令:SELECT、DELETE、UPDATE SELECT查询包括条件项、内连接、分组汇总(含HAVING)、排序、简单子查询(不考EXISTS)及一些输出选项。 五、概念
信息与能源、物质并列为人类社会活动得三大要素。信息就是关于事物以及事物间联系得知识。 一般可以将信息分为三种类型或三个层次:事物得静态属性信息、动态属性信息及事物间得内在联系信息。 表达信息得符号记录就就是数据。数据就是信息得载体,信息就是数据得内涵。 所谓数据处理,就就是指对数据得收集、整理、组织、存储、维护、加工、查询、传输得过程。数据处理得目得就是获取有用得信息,核心就是数据。 计算机数据管理技术随着计算机软硬件得发展经历了三个阶段:手工管理阶段、文件系统阶段、数据库系统阶段。 数据库管理系统(DBMS,Data Base Management System)特点(1)数据结构化(2)数据共享性好、冗余度低、(3)数据独立性强(4)DBMS 统一管理。 所谓数据库(DB,Data Base),简而言之,就就是相关联得数据得集合。数据库系统就是指在计算机中引入数据库后得系统构成,由计算机软硬件、数据库、DBMS、应用程序以及数据库管理员(DBA,Data Base Administrator)与数据库用户构成。
关于Access数据库的说明： Microsoft Access是Microsoft Office中的一个套件，如果您的电脑中安装了Microsoft Office，那么一般来说您的电脑中就安装了Microsoft Access，因为Microsoft Access是Microsoft Office默认的安装套件。有了Microsoft Access你就可以用它来打开扩展名为MDB 的Access数据库文件了。 我们提供的Access数据库需要用Microsoft Access2000（或者Microsoft Access XP或者Microsoft Access2003，Microsoft Access97可能打不开），因此如果您的电脑中是Microsoft Access97，那么您需要将您的Microsoft Office升级到2000或者更高版本。 Access数据库文件必须用Microsoft Access来打开，如果您的电脑中没有Microsoft Access，那么您可能需要安装Microsoft Office2000或者更高版本；如果您的电脑中已有Microsoft Office，但没有Microsoft Access，那么您可能需要插入Microsoft Office光盘，安装Microsoft Access套件。 1、打开光盘，将ACCESS数据库复制到硬盘； 2、双击打开ACCESS数据库文件； 3、关闭ACCESS数据库窗口； 4、打开“工具”--“数据库实用工具”—“转换数据库”—“到当前ACCESS数据库版本； 5、选中ACCESS数据库文件--“转换” 6、重新命名ACCESS BD1文件即完成。 1、双击打开ACCESS数据库文件； 2、在“对象”选卡中点击“查询”—选取“企业名录查询”； 3、单击“设计”进入选择查询界面； 4、确定您需要检索的字段，如“企业名称”、“通讯地址”、“邮政编码”、“经营范围”、“行 业名录”等； 5、按字段检索时，请在“准则”表格中填入Like“*深圳*” 注意：“深圳”就是关键字，改变一下关键字就是您要设定的检索了，Like“*深圳*”就是检索命令。 6、点击“保存”即完成查询。
《数据库及应用》课后习题参考答案（部分） 第一章 数据库基础知识 一、 选择 题 1 C 2 B 3 A 4 B 5 D 6 A 7 B 8 D 9 A 10 A 二、 填空 题 1、实体标识符 2、记录（元组），属性（字段） 3、表、字段 4、数据的正确性和一致性 5、可作为键的属性 6、对关系逐步分解的过程 7、书号 8、3NF 、 2NF 9、 R S A B C D 2 3 5 8 7 4 4 1 7 6 4 1 4 3 5 8 R S 1=1 A C D B C D 3 4 9 3 5 8 2=2(R × S) A C D B C D 2 5 8 3 5 8 7 4 1 4 4 1 4 5 8 3 5 8 3 4 9 3 5 8 3 4 9 6 4 1 第二章 Access2000综述 一、选择题 1 C 2 D 3 A 4 C 5 A
6 D 7 C 8 D 9 B 10 B 二、填空题 1、一、 .mdb 2、表、查询、报表、窗体、数据访问 页 3、外 面 4、打开数据库 5、查询
第三章数据库的创建与管理 一、选择 题 1 C 2 C 3 A 4 C 5 C 6 A 7 B 8 A 9 D 10 B 11 B 12 D 二、填空 题 1、详细信息、小图标 2、关闭 Access 3、删除、删 除 4、数据 库 5、工具、数据库使用 工具 第四章表与关系 一、选择题 1 D 2 A 3 D 4 D 5 D 6 B 7 D 8 B 9 D 10 B 11 B 12 A 13 A 14 B 15 D 二、填空题 1、设计 2、导入 3、链接 4、链接 5、like ”W?????” “专科”or “本科”or “研究生” >=1000 and <=2000 >=#1960-01-01# and <=#2000-01-01# “男”or “女” >=1011 and <=1999 >=10 6、空值、空格 7、空、空格 8、自动编号 9、一个、多个 10、空值、升序11、提高查询效率 12、参照完整性 第五章查询 一、选择题 1 A 2 C 3 C 4 D 5 D 6 A 7 D 8 B 9 C 10 A 11 D 12 D 13 A 14 A 15 B 16 D 二填空题 1、1）select 姓名 from student where 年龄 >=19 and 年龄 <=20 and 性别 =“男”2）select 课程名，学时数from course where 课程名=“英语”
KEGG数据库的使用方法与介绍（转） KEGG的数据KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系；基因组信息主要是从NCBI 等数据库中得到的，除了有完整的基因序列外，还有没完成的草图；另外KEGG中有一个“专有名词”KO（KEGG Orthology），它是蛋白质（酶）的一个分类体系，序列高度相似，并且在同一条通路上有相似功能的蛋白质被归为一组，然后打上KO（或K）标签。下面就首先来讲一下KEGG orthology。任找一个代谢通路图，在上方有pathway meue | payhway entry | Show(Hide) description | 这3个选项，点击pathwayentry, 出现了一个页面，这个随时被连接出来的页面相信大家一定再熟悉不过了。在这个页面中的pathway map项中点击按钮状的链接Ortholog table 。就进入了Ortholog table如下的页面：在这个表中，行与物种对应，3个字母都是相应物中的英文单词缩写，比如has 表示Homo sapiens，mcc表示Macaca mulatta；列就表示相应的Ortholog分类，比如K00844就表示生物体内的己糖激酶hexokinase 这一类序列和功能相似的蛋白质类（酶类）。如上图has后有3101，3098，3099这3个条目，它表示在人类细胞中中存在3中不同的己糖激酶，它们分别由以上这3
组数字代表的基因所编码，这3组数字应该是这3个基因的登录号。空白则表示在该物种中不存在这种酶。点击K00844则这一KO分类信息及成员列表都可显示出来；点击has则链接到物种（人类）基因组去了；点击P，则显示相应的代谢通路。下面我们点击3101，如下： 如上图，就是我们常见的一个页面，3101是KEGG中的基因ID（登录号），H.sapiens表示物种，然后是基因的名称，表达的酶，属于哪个KO分类以及参与哪些代谢途径；下面还有结构、序列信息等等。所以从Ortholog table 中可以很容易地知道一张代谢通路上有哪些KO分类（酶类），并且这些酶类的成员在各物种中分配存在的情况以及特定的名称。怎么看KEGG中代谢通路图比如以上这个图，方框一般就是酶，方框里面的5.4.2.2不是IP 而是EC编号；小圆圈代表代谢物，你把鼠标放上去，（别放我这上面，放KEGG中去）会出现C00668的东西，C代表compound，00668是这种化合物在KEGG中的编号，一般在KEGG中数据条目都是这样的，前面一个标志，后面一个五位数编号；大的圆方块，就表示是另一个代谢图了，所以就不展开了。但是：为什么这个图上有的小框框是绿色呢？（这是绿色吧？我蓝绿不分的，下同）因为这是一张特定物种（S. cere. 酿酒酵母）的代谢图，蓝色的框框表示专属于这个物种。在KEGG中有两种代谢图，一