序
开始是男主角在梦中的回忆，古兰斯公国王子夏多维那特要杀他所说的“邪教徒”也就是“玛娜一族”之一的女主角。在父母的拖延下两人逃出家里，但是男主角在逃跑各种不小心拌了一交，从而被士兵抓住了，女主角逃脱。
醒来后和监牢中的房友商量逃亡计划，这时画面一转，夏多维那特正在竞技场发表痛诉“玛娜之力”的激情演说，台下群众热情高涨~这时候再回到监牢，士兵带主角和一同伴到竞技场和虎怪搏斗。那个虎怪和GB 版一样，巨傻的说，和它拼血都成。
战胜后往上逃脱。在桥上不幸被夏多维那特逮个正着，对话中得知主角的父母都被他给杀了，愤怒的男主角拔出剑打算为父母报仇，但是质嫩的他怎么是大BOSS夏多维那特的对手，被一剑打下瀑布，另一个同伴眼睁睁的看着他摔下瀑布却无能为力，只能为主角祈祷。
トップル村
画面转到瀑布下，兔子商人尼基塔正在悠闲的钓鱼，不一会儿它感到有一条大鱼上钩了，用力一甩竟然把摔下瀑布的男主角给钓了上来，瞎扯一通后开溜了。
边上的女神象能回复HP,MP，记录。往下走听见一少女的呼救声，下去一看一少女被怪物所围困，不容分说，先英雄救美吧。战胜敌人后得知她的名字和之前从家里和主角一起逃走的MM一样，现在护送她带到东北方向的トップル村吧。（备注：地上的草能割开，随即得到花朵，路上有两个宝箱）把Mm带到トップル村后暂时分别，先进入右边的村长家，对话中得知古兰斯公国王子夏多维那特为了追求自己的理想不惜违背自然法则来对抗万物之源“玛娜”，为了建造一个不依靠“玛娜”之力而存在的国家，想方设法迫害“玛娜一族”的人，把他们指认为“邪教徒”，要想打倒他只能用“圣剑”，因此主角塔上了寻找圣剑的旅程（得到魔法のロ-プ，使用后能回到记录点，宿屋房间里有宝箱）整顿之后正要出村是被之前救过自己的兔子商人尼基塔叫住，原来它是来向你推销地图的，必买的（打开后能查看地图，怪物图签，基础解说）
伯爵城堡
从左面出口走出トップル村向西面行进，在瀑布边的“泷之小屋”里发生剧情，主角正在看桌子上的信的时候之前的那个MM冲了进来以为是古兰斯公国的士兵，二话不说就用法杖一阵猛敲~~~，搞清楚了之后了解了主角的目的，然后加入。（出去了之后学会了“跳”这个技能，按L键即可，使用MM可以轻点一下R 是回复魔法，按住R在放开后能发出跟踪光球）然后往右走可以跳上上面的台阶，
前行一段又遇到尼基塔，搞知主角要在バットムの洞穴要小心，进入洞里，开始遇到的象史来姆一样的敌人用剑砍不伤血，先逃。前进一段之后在多打打上放的弓箭手得到弓箭就能使用弓了，这时候就能用弓干掉使来姆。还有一种灰色的圆球状敌人，只能用法杖敲才能打死。走出洞后前行一段往下走再次遇到尼基塔向你推销东西，买了之后调查同一版面里有个象花盆一样的东西，竟然变出个仙人掌屋子，进入后看见了仙人掌君，呵呵。左边的屋子装备打造，暂时无法使用，右边的屋子用两种种子可以种出强化道具的果实，要善加利用，出来后仙人掌君还会帮你写日记。
之后往上走，等到晚上的时候进去铁门就会打开了。女主角去调查的时候进来一个“迷之男”，说了通什么吸血鬼之类的话就走开了。接着女主角跑过来说自己看见了幽灵！不管怎么样，先进入城堡里调查一下吧，黑色的城堡被乌云笼罩，电闪雷鸣，十分恐怖。
一进去就遇到城堡的执事，说城堡的主人正在睡眠中，谈话间又进来一位少女，说要在这住一晚，说罢就扬长而去。男主角说要休息了，叫执事准备一间房间，女主角不乐意了，说自己看见幽灵，住在着可能有生命危险。但男主角不以为然，坚决要在这住宿，两人气的都把头转到了一边。最后还是决定住下，在2楼右边的屋子里找到了刚才进来的MM，然后回到自己的屋子，男主角一躺下就睡着了，女主角没办法，
也只好睡了。睡梦中又想起了小时侯逃亡的事，醒来后发现女主角不见了。走出房间看见执事鬼鬼祟祟的，好象女主角被捉走了，马上去救她！在地下2层的第二个屋子有一个黑球，打破它后能得到火精灵，
使用后能提升攻击力。然后到只有一个僵尸的房间，装备火精灵按住R打它才能伤血，干掉后门就打开了。
前进一段后来到一个有很多棺材的房间，看见那个迷之男子正在查看棺材，说是找自己的恋人，没有找到就离开了。这时刚才执事出现，也不知道怎么变身为狼人就开打，实在是太菜了，随便打打。
继续前进，稍微走了一段后找到了泊爵的房间，女主角也在，还有之前的那个MM被伯爵弄在天上不知道在搞什么，阻止他把。变成了大蝙蝠，但是实力并没有提高，还是很轻松就能解决他的。
战斗结束之后竟然出现了父亲的亡灵，原来女主角说看到幽灵就是指他。父亲对男主角说了现在身边的MM 就是当年和他一起逃跑的那个，要男主角守护好她。在逃离城堡的时候主角的感觉就象回到了那时侯。
ウェソヂルの町
到仙人掌屋逛一下，仙人掌君会帮你写下日记。然后来到沼之洞穴，用男主角装备上弓使用火精灵的魔法吧封印打破就能过去了。走了一阵子后有突发事件，来到一处有几个拿链球的敌人的地方，干掉敌人后得
到锁链，这样对着木桩使用后就能把人拉过去了。
在一池塘边得到月之镜，接着从池塘里冒出个双头怪。当心中毒，建议使用弓打比较简单，战胜后得到水精灵，但是现在还不能使用。
按原路返回出洞，向右走来到一泉水处让水精灵恢复，这下就可以使用了。
过桥后来到ウェソヂルヘの通路使用水精灵就能把封印打开了。
注意，这里有个宝箱
出洞来到ウェソヂル海岸，在夜里的时候到这会退潮，就能得到宝箱了。
进入ウェソヂルの町，（民家里有个宝箱）向上走在水池处传来优美的琴声，大伙都在倾听吟游诗人莱斯塔的琴，一位银发男子十分欣赏他的琴，对话后得志莱斯塔想用歌声寻求和平，打算只身前往古兰斯城，银发男子迪比亚斯再三忠告他古兰斯城的危险，但是他仍然执意前往...来到大圣殿通过女主角介绍得站在面前的伯加特是曾经大败汪底尔的三骑士之一，男主角感到很荣幸见到他，然后向异行老人询问如何找到圣剑的事，但是并没有得到明确的答复，只说那是勇者才能得到的剑，气愤的男主角跑出了大圣殿，刚走出门口发现天上有古兰斯公国的飞空艇飞过，这时村人跑来说古兰斯的部队攻入这个城里来了，随后夏多维那特出现，主角一见仇人，顿时复仇心起拔出剑攻向他，但是实力不及，被夏多维那特一剑砍中，接着又被他的心腹朱利亚斯魔法打飞到大圣殿里去了，还好打在月之镜上没有致命，但是镜子随之碎了。夏多维那特进入大圣殿里说要带走女主角，伯加特当然不同意，拔剑想和他对挑，但是卑鄙的伯加特说他飞空艇上的大炮已经瞄准了这个城镇，要是不答应的话就要让这里血流成河，强行把女主角带走了，男主角随之反抗，但是被夏多维那特一下打晕。醒来后被告知女主角已经被抓到了飞空艇上，大伙决定去营救她。出门后看见迪比亚斯和莱斯塔，对话后迪比亚斯说以后可能这里有危险，让主角去把他养的鸟放生，
回到屋子对着鸟笼把鸟都放生后来到大圣殿。大家策划着如何去营救女主角，得知要到通过ガイアの洞穴到西之湖追赶飞空艇，，随后就得到光精灵，三人出门后就分头行动了。
『因此围绕着玛娜之树命运再次开始轮回
邂逅的人们
告别的人们
基于各种思想
全部开始了活动
向未来...
借助这玛娜之力世界再次开始骚动
人与人的命运...
象大河的水流一般...』
飞空艇
在左边的出口出去，看见个仙人掌屋，进去写个日记吧。（来回进入应该能写两次）往左行进，在小溪边对着黑色的石头使用锁链能把人拉过去。先沿着下面的路来到トワ-フの洞穴，和中间红色衣服的对话，询问如何打开ガイアの洞穴，被告知要到“禁断之废坑”得到”ミスリル“才行，但是“禁断之废坑”十分危险，一定要有同伴一起才能进入。向右上方走，来到“禁断之废坑”入口，看见有一队矿工正在忙活着，和ワッツ对话得知他正想进入去采矿，准备打造究级之剑，但是苦于没有有实力的同伴一同进入，两人一拍即合，于是结伴进入。开始跳到采矿车里矿车就会自动开了，
途中看准时机按动机关改变轨道。下车后往下走进入左边的门，干掉里面拿镰刀的敌人后就会得到镰刀了
。找到矿车后再次乘上
途中每一个机关都要扳动一次。下车后往上走就到了矿石堆了，ワッツ兴奋不已，正当想去开采的时候听见有一声说他们入侵的话，原来是镇守这矿场的一个沙虫，使用刚才得到的镰刀会对它造成很大的伤害，没几下就干掉它了。
回到トワ-フの洞穴，ワッツ为了完成究级之剑，再次去寻找材料了，这时可以进入ガイアの洞穴了，进入后用火精灵打破一开始的那个封印进去能得到两个宝箱，走了一段后发现一个在睡觉的精灵，
对话后得到土精灵。装备后旧能打破下来的一个封印出洞了。往左走遇到了ツ-バ，对话后加入，在一个宝箱上面得到水之辉石，
在一处干掉狼人后得到拳击手套（虚力是龟派气功）。
没走一会儿就到了飞空艇，正好在起飞之前赶上，进入营救女主角吧！
拿好宝箱后进入左下角的房间，往下走打碎窗户
来到室外，ツ-バ感到附近的屋子里有魔力，从窗户里看见绑着的女主角和朱里亚斯，正当他想对女主角痛下杀手的时候ツ-バ及时放出冰球加以阻拦，但是朱里亚斯的实力非常强大，一击便吧ツ-バ打倒了，男主角打开窗户想救女主角，但是她却说要到圣域作为钥匙救她母亲，并且把一件物品扔给了男主角让他快点逃跑，但是还没来得及逃就被朱里亚斯打下飞空艇。
摔到地上正好有一少女搭救，把他带到了自己家里养伤。醒来后问这是哪里，得知这里是メノスの村，从空中摔下来没摔死真是不幸中的大幸少女感慨到。在一问得知原来是当初一同被关在牢房里的同伴，问及其他的同伴怎么样，被告知逃脱的时候又被士兵给抓了回去，生死不明...在睡梦中梦见了女主角正被一男子追赶，并且被他放出的魔法击中，顿时大叫アマソタ闻声而来，看见主角正被噩梦缠绕十分同情，这时候迪比亚斯突然闯入，把治疗男主角的药给了アマソタ。第二天女主角和伯加特竟然出现在男主角眼前，原来是伯加特把女主角救了出来。出屋去寻找刚才跑出去的アマソタ，逛了一圈后没有找到然后回屋。女主角和伯加特先行离开，先往上出村有好几个宝箱拿，在这里得到暗之辉石。
拿好宝箱后向下出村，先到仙人掌屋，这时可以去打造装备了，使用不同的材料装备的能力提升也不同，看自己爱好了。往下走来到ヅャドの町收集情报，在一屋子里一MM要主角帮他要债...，第一个在右下角，第二个在隔壁邻居家，第三个在强化屋打铁处，第四个在左下角的屋子里，最后一个在デビアスの馆二楼找到，全部完成后得到“アナゲマ金货”。
再回到デビアスの馆在里面找到了アマソタ，随后加入。出城后来到沙漠，往下走来到一处有两棵树的地方按照“8”字路线走就能是上方的流沙停止，出现洞口进入，
出洞后前进一段看见有个沙漠旋涡，进去后来到沙之迷宫，踩下两个机关后出现通路。
回到沙漠旋涡那，边上出现了洞口，进入后用土精灵打开封印，踩下机关后出现洞口。出来后又找到一个洞进入，在里边打倒拿斧头的敌人得到斧头
踩下机关后退回，外面关着的石门打开了一个，连续踩下机关后先去拿好宝箱再出洞。向上走在一洞里得到风精灵，
进去踩下机关后出洞。使用风精灵打开右边的封印入洞。出洞后又找到一个洞口进入（晕），踩下机关回到有很多曲折流沙的地方出现了一个洞口，这里就是“时之祭坛”了。在那里找到了メヂュ-サ，但是她被魔体附身变成了美杜沙，当心石化光线，被击中的话会伤很多血，而且也巨搞笑,建议用剑打比较好。
战胜后女主角和伯加特赶来，赶紧给メヂュ-サ回复，但是与事无补，说了几句后就死了。这时迪比亚斯和夏多维纳特出现，迪比亚斯得知母亲被杀在夏多维纳特的煽风点火下十分愤怒，与主角他们为敌。アマソタ中了迪比亚斯的魔法变得狂暴化攻击女主角，这时边上的鸟唱起了歌使アマソタ回复了理智，但是她无法控制自己的身体，所以请求男主角把她杀掉。无奈之下只好痛下杀手下手，
刀落之后赶紧让女主角给她回复，到还真醒过来了。这时边上的鸟变回了莱斯塔，说了几句后アマソタ又倒下了。接着进入デビアスの馆，在齿轮那用弓箭射铃铛，射出清脆的声音后上面的门就会开了。
又来到一个有两个铃铛的地方，按照左右左的顺序敲打铃铛就能打开门了。
接着有一个四角有四个铃铛的房间，从左上角开始按照2—1—不打—1—1—1—1—1顺时针方向打铃铛，门就会开了。进入后发现伯加特被关在笼子里，主角试图打破它，但是这笼子是用强力魔法作成的，连伯加特都打不破不要说主角了。他对主角交代了些事后让主角上去找迪比亚斯。上去找到了他，他对母亲的死念念不忘，没说几句就开打。建议使用拳击手套打，要注意他发出来的波球，会造成盲目效果。
战胜他后他的魂会被死を食ろう男带走。众人站在デビアスの馆下，经历了这些事后都有所感悟，“吟游诗人”莱斯塔弹起竖琴唱到：
『最后的演奏
悲伤的旋律啊
抚慰人们的心灵...
抚慰死去人们的心灵...
这个旋律啊
飘向遥远的地方
传到古兰斯城那...』
古兰斯城
接着得到月精灵后先从城镇上方出城到仙人掌君的屋子逛逛吧，好久没来要多写几次日记了。（在ヅャドの町和右下角的老人对话得到アナゲマ金货）整顿好后再次回到沙漠，来到右上方之前不能通过的毒雾之谷，走出了毒雾之谷接着就进入泷之洞。里面一些洞口有蔓藤拦住，要用刀把它打开。在深处看见了朱利亚斯的影子，有汪德尔血统的他企图重建被毁灭的国家，说完召唤出了个植物怪，很简单，用剑猛砍就行了。
然后要打植物的母体，使用弓等下面弱点出来的时候打，破坏后再跳到台阶上用弓射花，当心自己的HP 要注意回复。
战胜后不精灵出现，说他在日光浴的时候突然遭到别人袭击，被师了法变成那样。往回走到刚才不能砍破的蔓藤的地方，砍一下，木精灵帮助我们把蔓藤弄开了，随后收得木精灵。出了洞后进入奇岩山，在门口处把两个石象都打成笑脸门就会开了，
接下来一个有三个石象的地方要把他们都打成发呆的表情
。途中路过个生气脸石象，先不要管，往上走在一处有很多拿流星锤的怪的地方干掉他们得到流星锤。然后往右走进入洞里把石象打成生气的脸，然后返回到刚才经过的生气脸石象的地方出现了洞。进入来到一处有4个石象的地方，全打成生气脸左边的门开，打成沮丧的脸有边的门开。走出奇岩山终于来到了久违的古兰斯城，在门口看见了イザベラ，她看见主角一行来了拿出了武器要迎战，问过后得知她爱慕夏多维纳特，正当两人动手的时候食ろう男出来了，说让我们进来，一进去后发现门关上了，原来是个圈套。在宫里的牢房找到了游戏刚开始的同伴，原来他们还没死，现在要去找监牢开不开。往左走进入监牢干掉两个宝箱怪后得到钥匙，
就能打开中间的门了，进入后在途中得到长枪。在一间屋子里和女主角一行人会师，女主角加入，在书架上看完3则日记后就能打开门继续往上走了，来到楼顶天台上遇到一只大鸟，用弓干掉它后继续前行。
之后见到了夏多伪纳特他们，说了一翻他的大道理后拔剑开战。注意不要中了盲目，用拳击手套近身猛K 很快便解决了，
接着死を食ろう男毫不留情的把他的魂夺走了。
『已经没有必要看到这场战斗的结束了...
就连自己的性命和都无法保护...
主角被时刻噩梦侵扰着呻吟...
打破漫漫的恶梦是怀念着的人们的...(心愿)
迎接唤醒的主角,(他)正是那我现在因该保护的最重要的人...
刹那的幸福一刻...
如果那一刻能够是永远那多么好呢...
这是谁都这么想的...』
圣域
醒来后得知自己已经昏迷了三天三夜了，和ツ-バ对话。这次主角问他圣剑在哪时他终于回答了，原来剑长眠在海底火山中，随后莱斯塔加入，在城里左上方的屋子里和门口一男子对话会得到“カンクン鸟の羽根”然后和上面的人对话，选择第二个选项（不受取），接着在和刚才门口的人对话选择第一个选项，最后和上面的人对话后就能得到“アナゲマ金货”了。从下面出城经过沙漠来到大炮屋，对话后就能传送到世界各地了（人不会死吗？？）现在传送到地图右上角的ロリマ-城。
，通过雪原进入ロリマ-城，发现里面的人都被冻住了，和国王对间“三骑士”之一的杰玛进来，告诉了主角进入“海底火山”的方法，并且给了“ロリマ-钥匙”，下楼用钥匙打开门后就能走出ロリマ-城了，攻击大冰块4次就能把冰块打碎，有的冰块下面藏有宝箱。来到カ-ラ山脉的洞里，出现一BOSS二话不说就开打，使用弓对付它比较好，尽量不要离的它太近到时候躲闪不及。
战胜它后ロリマ-城里的人恢复了正常。
『是这样呀
我为了见到阳光来到了这个世界
忘记了本来战斗的日子
只不过是无意义的谋生过活
谢谢你啊…年轻人…
被聚集的魔法成为了浓重的舞蹈在空中飘扬
流到了山间成为了雨露
流到了雪原成为了雨露
惊人的雨量似乎在讲述着那段漫长痛苦的岁月奠基着那些牺
牲的人们
那血雨乘风进入了城中
唤醒了人们,然后人么知道了发生了的一切
人们寻求到了真实
推翻了国王…』
出城回到大炮屋，这时地图左边右多出了一个地点（浮游岩），通过浮游岩之荒野来来到地下大河。途中在一瀑布地方斜着往下跳能得到两个宝箱，
还有一处瀑布可以往左通过，里面有4个宝箱，
调查3个有裂缝的室避让水流走后前面就有路了。
深入后和地上的机器对话就会出现个章鱼怪，很简单，使用弓比较好。
战胜后出来发现多出个洞口，进入海地火山。当心里面会自暴的南瓜和火球，一下费很多血的。在一处裂
缝那可以打开个洞进入往左走能得到个宝箱，
打开个石壁进入后调查士兵就能找到圣剑了，当然没那么容易就入手，要打倒守护这的赤炎魔。使用水精灵打，战士型的用弓比较安全，战胜后圣剑入手！
最后就要决定前往圣域了，每个人都度过了大战之前的晚上....
『在那个夜晚,因为开始的命运而邂逅的战友们
召开了小小简短的宴会
充满离别的眼泪
全部是为了感谢那邂逅
如果还有喜悦的心情
向前进
因为有了这些战斗伙伴
向前进
伴随着战友们的心灵
向时间追赶…
伴随着玛娜
生命开始运转的时刻
追赶人们的心灵
向未来,向未来… 』
第二天起程出发，和女主角对话后加入。先到下面的仙人掌屋里大灶一下装备后再北上，在晚上的时候之前无法通过的地方出现了一条透明的路，
在一处地方得到“光辉石”。
正当要打开遗迹的门时死を食ろう男出现，说现在还不能打开门，要到地图西南方解除封印，来到大炮屋传送到封印之洞穴。在里面拉动5个操纵甘解开封印，然后深入调查石板，要遗迹的封印的时候出现一BOSS，使用弓很轻松就能解决，
然后得到暗精灵。现在回到遗迹通路，在光精灵和暗精灵的帮助下打开了门。在里面拉动机关会改变地形，最后来到传送所进入ダイムの塔。进入后决定和女主角分头行动，打开机关往下走，发现这里有好多在海
底火山看见的机器人的残核，有一个竟然没坏还会动，对话后加入，然后回到石碑处把石碑破坏上方的门就打开了。按照碑文上的提示砍边上的机关3下右边的门就会打开。来到4层踏会塌陷一部分，之后的谜题都很简单，11层的谜题要使用机器人用激光把中间3个雪人怪打死门才会开。来到12层就会遇到BOSS，要等到它身体发绿色的时候用剑攻击，
解决之后和女主角会合，这时朱利亚斯的影子出现，他准备把塔弄塌，男女主角之间的地出现了裂痕，关键时刻机器人把女主角扔了过去，自己与塔共存亡~。终于来到了圣域!
开始是个迷宫，按照上上右下右上的顺序走，走了一段后又发现了朱利亚斯的影子，召唤出一条火龙，走上去用剑一阵猛砍就挂了....往右来到圣域2层，虽然之后没有什么谜题，但是路很长。最后找到了朱利亚斯，但是他吧伯加特他们附上了暗黑力量是他们与主角为敌人，女主角也未能幸免，最后在主角真情演说下他们解开了暗黑里的塑驳，此时ツ-バ与三骑士之一的古兰斯也赶到了，他们把朱利亚斯拖住让男女主角前行，在里面找到了朱利亚斯本人，对了一阵话后圣剑放出了光芒，圣剑复活，然后和朱利亚斯对决，没有什么要点，非常简单，朱利亚斯会放一个大魔法效果不错，有兴趣的话慢点打倒他等他放。
之后他会变身，别的到没什么，只是他会放一个超夸张的陨石球，如果放的时候你的HP比较少的话等死吧~
通过圣剑的力量终于铲除了这个大魔头，众人相聚在玛雅树下，虽然舍不得，但是最终女主角还是化做了玛雅女神与大家分别。
附：金手指：
事件道具
仙人掌的种子 02020D38
玛娜的项链 02020D3A
生锈的剑 02020D3C
月之镜 02020D3E
动力室的钥匙 02020D40
金色的钥匙 02020D42
银色的钥匙 02020D44
广告 02020D46
黄金剑 02020D48
黄金铠甲 02020D4A
黄金头盔 02020D4C
獾印金币 02020D4E
蜂蜜 02020D50
项链 02020D52
银制小刀 02020D54
装血的小袋 02020D56
珂特妮的信 02020ED0
卡特的信 02020ED2
烤蝾螈 02020ED4
烤蝾螈的尾巴 02020ED6
帐单 02020ED8
黑面具 02020EDA
月光露 02020EDC
嘎咕鸟的羽毛 02020EDE
回虫仆仆 02020EE0
光之辉石 02020EE2
暗之辉石 02020EE4
月之辉石 02020EE6
水之辉石 02020EEA 木之辉石 02020EEC 风之辉石 02020EEE 土之辉石 02020EF0 玛娜之剑 02020EF2
回复道具
圆圆的糖果 02020D58 咯嘣巧克力 02020D5A 蜂蜜饮料 02020D5C 魔法胡桃 02020D5E 呸呸草 02020D60 星星药草 02020D62 天使的圣杯 02020D64 青蛙茱萸 02020D66
不可思议的道具
闪光草 02020D68 怪味花 02020D6A 音符石 02020D6C 梦见草 02020D6E 小人榔头 02020D74
属性硬币
光之硬币 02020D78 暗之硬币 02020D7A 月之硬币 02020D7C 火之硬币 02020D7E 水之硬币 02020D80 木之硬币 02020D82 风之硬币 02020D84 土之硬币 02020D86
精灵之像
光精灵之像 02020D88 暗精灵之像 02020D8A