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王镜岩生物化学第三版考研笔记-共122页(2)(2)

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王镜岩

第一章糖

一、糖的概念

糖类物质是多羟基(2个或以上)的醛类(aldehyde)或酮类(Ketone)化合物,以及它们的衍生物或聚合物。

据此可分为醛糖(aldose)和酮糖(ketose)。

还可根据碳层子数分为丙糖(triose),丁糖(terose),戊糖(pentose)、己糖(hexose)。

最简单的糖类就是丙糖(甘油醛和二羟丙酮)

由于绝大多数的糖类化合物都可以用通式Cn (H2O)n表示,所以过去人们一直认为糖类是碳与水的化合物,称为碳水化合物。现在已经这种称呼并恰当,只是沿用已久,仍有许多人称之为碳水化合物。

二、糖的种类

根据糖的结构单元数目多少分为:

(1)单糖:不能被水解称更小分子的糖。

(2)寡糖:2-6个单糖分子脱水缩合而成,以双糖最为普遍,意义也较大。

(3)多糖:

均一性多糖:淀粉、糖原、纤维素、半纤维素、几丁质(壳多糖)

不均一性多糖:糖胺多糖类(透明质酸、硫酸软骨素、硫酸皮肤素等)

(4)结合糖(复合糖,糖缀合物,glycoconjugate):糖脂、糖蛋白(蛋白聚糖)、糖-核苷酸等

(5)糖的衍生物:糖醇、糖酸、糖胺、糖苷

三、糖类的生物学功能

(1) 提供能量。植物的淀粉和动物的糖原都是能量的储存形式。

(2) 物质代谢的碳骨架,为蛋白质、核酸、脂类的合成提供碳骨架。

(3) 细胞的骨架。纤维素、半纤维素、木质素是植物细胞壁的主要成分,肽聚糖是细胞壁的主要成分。

(4) 细胞间识别和生物分子间的识别。

细胞膜表面糖蛋白的寡糖链参与细胞间的识别。一些细胞的细胞膜表面含有糖分子或寡糖链,构成细胞的天线,参与细胞通信。

红细胞表面ABO血型决定簇就含有岩藻糖。

第一节单糖

一、单糖的结构

1、单糖的链状结构

确定链状结构的方法(葡萄糖):

a. 与Fehling试剂或其它醛试剂反应,含有醛基。

b. 与乙酸酐反应,产生具有五个乙酰基的衍生物。

c. 用钠、汞剂作用,生成山梨醇。

图2

最简单的单糖之一是甘油醛(glyceraldehydes),它有两种立体异构形式(Stereoismeric form),图7.3。

这两种立体异构体在旋光性上刚好相反,一种异构体使平面偏振光(Plane polarized liyot)的偏振面沿顺时针方向偏转,称为右旋型异构体(dextrorotary),或D型异构体。另一种异构体则使平面偏振不的编振机逆时针编转,称左旋异构体(levorotary,L)或L型异构体。

像甘油醛这样具有旋光性差异的立体异构体又称为光学异构体(Cptical lsmer),常用D,L表示。

以甘油醛的两种光学异构体作对照,其他单糖的光学异构构与之比较而规定为D型或L型。

差向异构体(epimer):又称表异构体,只有一个不对称碳原子上的基因排列方式不同的非对映异构体,如D-等等糖与D-半乳糖。

链状结构一般用Fisher投影式表示:碳骨架、竖直写;氧化程度最高的碳原子在上方,

2、单糖的环状结构

在溶液中,含有4个以上碳原子的单糖主要以环状结构。

单糖分子中的羟基能与醛基或酮基可逆缩合成环状的半缩醛(emiacetal)。环化后,羰基C就成为一个手性C原子称为端异构性碳原子(anomeric carbon -型头异构体。β-型及αatom),环化后形成的两种非对映异构体称为端基异构体,或头异构体(anomer),分别称为

环状结构一般用Havorth结构式表示:

用FisCher投影式表示环状结构很不方便。Haworth结构式比Fischer投影式更能正确反映糖分子中的键角和键长度。转化方法:

① 画一个五员或六员环

② 从氧原子右侧的端基碳(anomerio carbon)开始,画上半缩醛羟基,在Fischer投影式中右侧的居环下,左侧居环上。

构象式:

Haworth结构式虽能正确反映糖的环状结构,但还是过于简单,构象式最能正确地反映糖的环状结构,它反映出了糖环的折叠形结构。

3、几种重要的单糖的链状结构和环状结构

(1) 丙糖:D-甘油醛二羟丙酮

(2) 丁糖:D-赤鲜糖 D-赤鲜酮糖

(3) 戊糖:D-核糖 D-脱氧核糖 D-核酮糖 D-木糖 D-木酮糖

型) D-果糖β-型及α(4) 己糖:D-葡萄糖(

(5) 庚糖:D-景天庚酮糖

4、变旋现象

)之间可以相互转变,最后达到一个动态平衡,称为变旋现象。β、α在溶液中,糖的链状结构和环状结构(

型占63%,链式占1%。β型占36%,αC。原因就是葡萄糖的不同结构形式相互转变,最后,各种结构形式达到一定的平衡,其中?-D-(+)葡萄糖分别溶于水中,放置一段时间后,其旋光率都逐渐转变为+52.7β-D-(+)葡萄糖与α从乙醇水溶液中结晶出的D—glucose称为α-D-(+)Glucose([α]20D=+113°),从吡啶溶液中结晶出的D—glucose称为β-D-(+)glucose([α]20D=+18.7°)。将

图5 葡萄糖的变旋

5、构型与构象

构型:分子中由于各原子或基团间特有的固定的空间排列方式不同而使它呈现出不同的较定的立体结构,如D-甘油醛与 -D-葡萄糖是环状葡萄糖的两种构型。β-D-葡萄糖和αL-甘油醛,D-葡萄糖和L葡萄糖是链状葡萄糖的两种构型,一般情况下,构型都比较稳定,一种构型转变另一种构型则要求共价键的断裂、原子(基团)间的重排和新共价键的重新形成。

图3甘油醛的构型:

构象:由于分子中的某个原子(基团)绕C-C单键自由旋转而形成的不同的暂时性的易变的空间结构形式,不同的构象之间可以相互转变,在各种构象形式中,势能最低、最稳定的构象是优势对象。

图1-3 吡喃型己糖构象

6、构型与旋光性

旋光性是分子中具有不对称结构的物质的一种物理性质。

显然,构型不同旋光性就不同。

构型是人为规定的,旋光性是实验测出的。

因此,构型与旋光性之间没有必然的对应规律,每一种物质的旋光性只能通过实验来确定。

二、单糖的物理化学性质

(一)物理性质

旋光性:是鉴定糖的一个重要指标

甜度:以蔗糖的甜度为标准

溶解性:易溶于水而难溶于乙醚、丙酮等有面溶剂

(二)化学性质

1、变旋

图7-11

)之间可以相互转变,最后达到一个动态平衡,称为变旋现象。三者间的比例因糖种类而异。β、α在溶液中,糖的链状结构和环状结构(

只有链状结构才具有下述的氧化还原反应。

2、糖醛反应(与酸的反应)

(1) Molish反应

Molish反应可以鉴定单糖的存在。

(2) Seliwannoff反应

据此区分酮糖与醛糖。还可利用溴水区分醛糖与酮糖。

3、氧化反应

氧化只发生在开链形式上。

在氧化剂、金属离子如Cu2+、酶的作用下,单糖可以发生几种类型的氧化:

图7、12

醛基氧化:糖酸(aldonic acid)

伯醇基氧化:醛酸(uronic acid)

醛基、伯醇基同时氧化:二酸(alduric acid)

能被弱氧化剂(如Fehhing试剂、Benedict试剂)氧化的糖称为还原性糖,所有的单糖都是还原性糖。

单糖氧化形成的羟基可以进一步形成环状内酯(Lactone)。

内酯在自然界中很普遍,如L-抗坏血酸(L-ascorbio acid),又称VC (Vitamcn c),就是D-葡萄糖酸的内酯衍生物。分子量176.1,它在体内是一种强还原剂。豚鼠(guinea pig)、猿(ape)和人不能合成Vc,从能合成Vc的肝脏微粒体中分离到合成Vc的三种酶,人和猿缺乏gulonolactone oxidase)。缺乏抗坏血酸将导致坏血病(scurvy),龄龈(gum)、腿部等开始出血,肿胀,逐渐扩展到全身,柑橘类果实(citrus frait)中含有丰富的Vc。

4、还原反应

单糖可以被还原成相应的糖醇(Sugar alcohol)。

D-葡萄糖被还原成D-葡萄糖醇,又称山犁醇(D-Sorbitol)。

糖醇主要用于食品加工业和医药,山犁醇添加到糖果中能延长糖果的货架期,因为它能防止糖果失水。用糖精处理的果汁中一般都有后味,添加山犁醇后能去除后味。人体食用后,山犁醇在肝中又会转化为果糖。

5、异构化

在弱碱性溶液中,D-葡萄糖、D-甘露糖和D-果糖,可以通过烯醇式相互转化(enediol intermediate)

图7.15

D-葡萄糖异构化为D-甘露糖后,由于其中的一个手性碳原子的构型发生变化,又称差向异构化(epimerization)。6、酯化

生物体中最常见也是最重要的糖酯是磷酸糖酯和硫酸糖酯。

磷酸糖酯及其衍生物是糖的代谢活性形式(糖代谢的中间产物)。

硫酸糖酯主要发现于结缔组织的蛋白聚糖中(Proteo glycan),由于硫酸糖酯带电荷,因此它能结合大量的水和阳离子。

葡萄糖的核苷二磷酸酯,如UDPG参与多糖的生物合成。

7、糖苷化

单糖环状结构上的半缩醛羟基与醇或酚的羟基缩合失水成为缩醛式衍生物,通称为糖苷(glycosides)。

8、糖脎反应(亲核加成)

糖脎反应发生在醛糖和酮糖的链状结构上。

糖脎易结晶,可以根据结晶的形状,判断单糖的种类。

三、重要的单糖

四、重要的单糖衍生物

1、糖醇

2、糖醛酸

单糖的伯醇基被氧化成-COOH。

-L-艾杜糖醛酸,它们在结缔组织中含量很高。β-D-葡萄醛酸和差向异构物α动物体内有两种很重要的糖醛酸:glucuronic acid β-L-iduronate

葡萄糖醛酸是肝脏内的一种解毒剂,它与类固醇、一些药物、胆红素(血红蛋白的降解物)结合增强其水溶性,使之更易排出体外。

3、氨基糖(糖胺,amino sugar, glycosamine)

单糖的一个羟基(通常是C2位)被氨基取代。

常见的氨基糖有D-葡萄糖胺(D-glucosamine)和D-半乳糖胺(D-galactosamine)。

氨基糖的氨基还经常被乙酰化形成N-乙酰糖胺。

4、糖苷

单糖的半缩醛羟基与其它分子的醇、酚等羟基缩合,脱水生成缩醛式衍生物,称糖苷Glycoside。

半缩醛部分是Glc,称Glc糖苷。半缩醛部分是Gal,称Gal糖苷。

O糖苷、N糖苷、S糖苷。

糖苷物质与糖类的区别:糖是半缩醛,不稳定,有变旋;苷是缩醛,较稳定,无变旋。

糖苷大多数有毒。

5、脱氧糖

重要的有6-脱氧D-甘露糖,L-岩藻糖(L-fucose)和2-脱氧D-核糖。

岩藻糖常见于一些糖蛋白中,如红细胞表面ABO血型决定簇。

第二节双糖和三糖

双糖在自然界中含量也很丰富,它是人类饮食中主要的热源之一。在小肠中,双糖必须在酶的作用下水解成单糖才能被人体吸收。如果这些酶有缺陷的话,那么人体摄入双糖后由于不能消化它就会出现消化病。未消化的双糖进入大肠,

在渗透压的作用下从周围组织夺取水分(腹泻,diarrhea),结肠中的细菌消化双糖(发酵)产生气体(气胀和绞痛或痉孪)。最常见的双糖消化缺陷是乳糖过敏,就是由于缺乏乳糖酶(Lactose),解决办法就是乳糖酶处理食物或避免摄入乳糖。

一、麦芽糖(maltose, malt sugar)

-麦芽糖),在自然界中似乎并不存在天然的麦芽糖。α它是直链淀粉的水解中间物(

(1-4)糖苷键。α-葡萄糖,α结构:两分子

(1-4)-葡萄糖苷]β, α-麦芽糖[葡萄糖-β(1-4)-葡萄糖苷) α,α-麦芽糖(葡萄糖-α

性质:

① 和开链的混合物β、α变旋现象,在水溶解中形成

② 具有还原性

③ 能成脎

(1-6)键型,支链淀粉和糖元的水解产物α异麦芽糖:

二、蔗糖

植物的茎、叶都可以产生蔗糖,它可以在整个植物体中进行运输,也是光合产物的运输形式之一。

-果糖β-葡萄糖,α结构: (1-2)糖苷键,无异构体β,α

(1-2)-果糖苷]β,α蔗糖[葡萄糖-

性质:① 无变旋现象② 无还原性③ 不能成脎

三、乳糖

顾名思义,主要存在于哺乳动物的乳汁中

(1-4)糖苷键β-半乳糖β结构: )-葡萄糖。两种异构体。β(或α

(1-4)-葡萄糖苷]β,β-lactose[半乳糖-β(1-4)-葡萄糖苷] α,β-Lactose[半乳糖-α

性质:① 有变旋现象② 具有还原性③ 能成脎

四、纤维二糖(cellobiose)

纤维素的降解产物和基基本结构单位,自然界中不存在游离的纤维二糖

-葡萄糖β结构:两分子 -(1,4)糖苷键β

(1,4)-葡萄糖苷]β纤维二糖[葡萄糖-

性质:① 具有变旋现象② 具有还原性③ 能成脎

五、海藻糖

两分子α-D-Glc,在C1上的两个半缩醛羟基之间脱水,由α-1.1糖苷键构成。

六、棉子糖(三糖)

P31 结构

非还原性三糖

第三节寡糖

寡糖是指含有2-10个单糖单元的糖类。它们常常与蛋白质或脂类共价结合,以糖蛋白或糖脂的形式存在。

连接它们的共价键类型主要两大类:N-糖甘键型和O-糖苷键型。

①N-糖苷键型:寡糖链与多肽上的Asn的氨基相连。这类寡糖链有三种主要类型:高甘露糖型,杂合型和复杂型。

图7.29

② O-糖苷键型,寡糖链与多肽链上的Ser或Thr的羟基相连,或与膜脂的羟基相连。

第四节多糖

多糖是由多个单糖分子缩合脱水而形成的。由于构成它的单糖的种类、数量以及连接方式的不同,多糖的结构极其复杂而且数量、种类庞大。

多糖是重要的能量贮存形式(如淀粉和糖原等)和细胞的骨架物质(如植物的纤维素和动物的几丁质),此外多糖还有更复杂的生理功能(如粘多糖和血型物质等)。

107,当血糖水平下降时,肝脏中的酶类就水解糖原,把葡萄糖释放到血液中。?大部分的多糖类物质没有固定的分子

量。多糖的大小从一定程度上可以反映细胞的代谢状态。例如:当血糖水平高时(如饭后),肝脏就合成糖原(glycogen)这时就分子量可达2

多糖在水溶液中只形成胶体,虽然具有旋光性,但无变旋现象,也无还原性。

多糖可以分为均一性多糖(由同一种单糖分子组成)和不均一性多糖(由两种或两种以上单糖分子组成)

一、均一性多糖

自然界中最丰富的均一性多糖是淀粉和糖原、纤维素。它们都是由葡萄糖组成。淀粉和糖原分别是植物和动物中葡萄糖的贮存形式,纤维素是植物细胞主要的结构组分。

1、淀粉

植物营养物质的一种贮存形式,也是植物性食物中重要的营养成分。

① 直链淀粉

(1-4)糖苷键依次相连成长而不分开的葡萄糖多聚物。典型情况下由数千个葡萄糖线基组成,分子量从150000到600000。α-葡萄糖以α许多

结构:长而紧密的螺旋管形。这种紧实的结构是与其贮藏功能相适应的。遇碘显兰色

图7.30

② 支链淀粉

-(1-6)支链。不能形成螺旋管,遇碘显紫色。α在直链的基础上每隔20-25个葡萄糖残基就形成一个

淀粉酶:内切淀粉酶(α-淀粉酶)水解α-1.4键,外切淀粉酶(β-淀粉酶)α-1.4,脱支酶α-1.6

2、糖元

与支链淀粉类似,只是分支程度更高,分支更,每隔4个葡萄糖残基便有一个分支。结构更紧密,更适应其贮藏功能,这是动物将其作为能量贮藏形式的一个重要原因,另一个原因是它含有大量的非原性端,可以被迅速动员水解。

糖元遇碘显红褐色。

3、纤维素

-(1-4)糖苷键相连而成直链。纤维素是植物细胞壁的主要结构成份,占植物体总重量的1/3左右,也是自然界最丰富的有机物,地球上每年约生产1011吨纤维素,经济价值:木材、纸张、纤维、棉花、亚麻。β-D-葡萄糖分子以β结构:许多

完整的细胞壁是以纤维素为主,并粘连有半纤维素、果胶和木质素。约40条纤维素链相互间以氢键相连成纤维细丝,无数纤维细丝构成细胞壁完整的纤维骨架。

图7.33

降解纤维素的纤维素主要存在于微生物中,一些反刍动物可以利用其消化道内的微生物消化纤维素,产生的葡萄糖供自身和微生物共同利用。虽大多数的动物(包括人)不能消化纤维素,但是含有纤维素的食物对于健康是必需的和有益的。

4、几丁质(壳多糖):

(1,4)糖苷链相连成的直链。β-D-葡萄糖胺以βN-乙酰-

5、菊糖 inulin

多聚果糖,存在于菊科植物根部。

6、琼脂 Ager

多聚半乳糖,是某些海藻所含的多糖,人和微生物不能消化琼脂。

几种均一多糖的结构、性质比较。

P35表1-6

二、不均一性多糖

不均一性多糖种类繁多。

有一些不均一性多糖由含糖胺的重复双糖系列组成,称为糖胺聚糖(glyeosaminoglycans,GAGs),又称粘多糖。(mucopoly saceharides)、氨基多糖等。

糖胺聚糖是蛋白聚糖的主要组分,按重复双糖单位的不同,糖胺聚糖有五类:

1、透明质酸

2、硫酸软骨素

3、硫酸皮肤素

4、硫酸用层酸

5、肝素

6、硫酸乙酰肝素

第五节结合糖(glycoconjugate)

糖与非糖物质共价结合形成的复合物称结合糖(复合糖,糖缀合物),包括糖脂(glycolipids),糖蛋白与蛋白聚糖、

肽聚糖(peptidoglycan),糖—核酸

一、糖蛋白

糖蛋白是由短的寡糖链与蛋白质共价相连构成的分子。其总体性质更接近蛋白质。糖与蛋白质之间以蛋白质为主,其一定部位上以共价健与若干短的寡糖链相连,这些寡糖链常常是具分支的杂糖链,不呈现重复的双糖系列,一般由2-10个单体(少于15)组成,未端成员常常是唾液酸或L-岩藻糖。

(一)组成

β-D-葡萄糖(Glc)α-D-甘露糖(Man)α-D-半乳糖(Gal)α-D-木糖(Xyl)α-D-阿拉伯糖(Ara)α-L-岩藻糖(Fuc)葡萄糖醛酸(GlcuA)艾杜糖醛酸(IduA) N-乙酰葡萄糖胺(GlcNAG) N-乙酰半乳糖胺(GalNAC) N-乙酰神经氨酸(NeuNAC)即唾液酸(Sia)

(二)糖链与蛋白的连接方式

糖蛋白的糖肽连接键,简称糖肽键。糖肽链的类型可以概况为:

-氨基、Lys或Arg的W-氨基相连 ①N-糖苷键型:寡糖链(GlcNAC的β-羟基)与Asn的酰胺基、N-未端的

图15

② O-糖苷键型:寡糖链(GalNAC的α-羟基)与Ser、Thr和羟基赖氨酸、羟脯氨酸的羟基相连。

图16

③ S-糖苷键型:以半胱氨酸为连接点的糖肽键。

④ 酯糖苷键型:以天冬氨酸、谷氨酸的游离羧基为连接点。

(三)糖蛋白中糖链的结构

糖蛋白中的糖链变化较大,含有丰富的结构信息。寡糖链往往是受体、酶类的识别位点。

1、N-糖苷键型(N-连接)

N-糖苷键型主要有三类寡糖链:① 高甘露糖型,由GlcNAc和甘露糖组成;② 复合型:除了GlcNAc和甘露糖外、还有果糖、半乳糖、唾液酸;③ 杂合型,包含①和②的特征。

图17 五糖核心

A. 高甘露糖型

中国地仓鼠卵细胞膜

图18

B. N-乙酰半乳糖型

图19

C. 混合型

卵白蛋白的一种糖链

图20

2、O-糖苷键型(O-连接)

没有五糖核心。

图21 人血纤维蛋白溶酶原:

图22 人免疫球蛋白IgA:

(四)糖蛋白的生物学功能

(1)糖蛋白携带某些蛋白质代谢去向的信息

糖蛋白寡糖链末端的唾液酸残基,决定着某种蛋白质是否在血流中存在或被肝脏除去的信息。

A脊椎动物血液中的铜蓝蛋白

肝细胞能降解丢失了唾液酸的铜蓝蛋白,唾液酸的消除可能是体内“老”蛋白的标记方式之一。

B.红细胞

新生的红细胞膜上唾液酸的含量远高于成熟的红细胞膜。用唾液酸酶处理新生的红细胞,回注机体,几小时后全部消失。而末用酶处理的红细胞,回注后,几天以后,仍能在体内正常存活。

(2)寡糖链在细胞识别、信号传递中起关键作用

淋巴细胞正常情况应归巢到脾脏,而切去唾液酸后,结果竞归巢到了肝脏。

在原核中表达的真核基因,无法糖基化。

糖蛋白可以是胞溶性的,也可以是膜结合型的,可以存在于细胞内在也可存在于细胞间质中。

糖蛋白在动植物中较为典型,脊柱动物中糖蛋白尤为丰富,金属转运蛋白(转铁蛋白)、血铜蓝蛋白,凝血因子、补体系统、一些激素,促卵泡素(Follicle-stimulating hormone, FSH,前脑下垂体分泌,促进卵子和精子的发育)、RNase、膜结合蛋白(如动物细胞膜的Na+-K+-ATPase)、主要组织相容性抗原(major histocompatibility antigen,细胞表面上介导供体器官与受体器官交叉匹配的标识)。

绝大多数糖蛋白的寡糖是糖蛋白的功能中心。有些糖蛋白的糖对于糖蛋白自身成机体起着保护作用或润滑作用,如牛的RNaseB(糖蛋白)对热的抗性大于RNaseA,大量的唾液酸能增强唾液粘蛋白的粘性从而增强唾液的润滑性。南极鱼抗冻蛋白的糖组分能与水形氢键,阻止冰品的形成从而提高了抗冻性。

糖蛋白在细胞间信号传递方面着更为复杂的作用。Hiv的靶细胞结合蛋白GP120是一个糖蛋白,能与人类靶细胞表面的CD4受体结合从而附着在靶细胞表面,如果去掉GP120的糖部分则不能与CD4受体结合从而失去感染能力。细胞表面的糖蛋白形成细胞的糖萼(糖衣)、参与细胞的粘连,这在胚和组织的生长、发育以及分化中起着关键性作用。

二、蛋白聚糖(oroteoglycans)

由糖胺聚糖与多肽链共价相连构成的分子,总体性质与多糖更为接近。糖胺聚糖链长而不分支,呈现重复双糖系列结构,其一定部位上与若干肽链相连。由于糖胺聚糖具有粘稠性,所以蛋白聚白又称为粘蛋白、粘多糖–蛋白质复合物等。

(一)蛋白聚糖中的糖肽键

在蛋白聚糖中已知有三种不同类型的糖肽键:

1、D-木糖与Ser羟基之间形成的O-糖肽键;

硫酸软骨素

硫酸皮肤素

硫酸类肝 GlcUAβ1→3Galβ1→3Galβ1→4Xyl1 → Ser

肝素

2、N-乙酰半乳糖胺与Thr或Ser羟基之间形成的O-糖肽键。

骨骼硫酸角质素→ GalNAc l→ 6 GalNAc→ser(Thr)

Sia 2→3 Gal1→3↗

3、N-乙酰葡萄糖胺与Asn之间形成的N-糖肽键;

角膜硫酸角质素→GlcNAc—N—Asn.

(二)糖白聚糖的生物学功能

糖白聚糖主要存在于软骨、键等结缔组织和各种腺体分泌的粘液中,有构成组织间质、润滑剂、防护剂等多方面的作用。

三、肽聚糖 peptidoglycan

是细菌细胞壁的主要成分,草兰氏阳性细菌胞壁所含的肽聚糖占干重的50-80%,草兰氏阴性细菌胞壁所含的肽聚糖占干重的1-10%

糖链由N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰胞壁酸通过β-1.4糖苷键连接而成,糖链间由肽链交联,构成稳定的网状结构,肽链长短视细菌种类不同而异。

图14

组成及结构特点(金黄色葡萄球菌)

1. G—M聚糖

2. 四肽及连接方式

四肽中N端的Ala上α-NH2与M中乳酸的羧基连接。

3.五聚Gly及连接方式

(1)五聚Gly的N端α—NH2与四肽C端Ala上的羧基连接。

(2)五聚Gly的C端羧基与另一个四肽的Lysε-NH2连接。

溶菌酶能水解G-M间的β-1.4糖苷键,使细胞壁出现孔洞,基至解体,从而杀死细菌。人的眼泪中存在大量的溶菌酶,某些噬菌体在感染宿主时也可分泌溶菌酶。鸡蛋中也含大量的溶菌酶。

生素能抑制肽聚糖的生物合成。

四、糖脂

见脂类第二章脂类 Lipids

重点:磷脂、糖脂

一、脂类的概念

不溶于水而能被乙醚、氯仿、苯等非极性有机溶剂抽提出的化合物,统称脂类。脂类包括油脂(甘油三脂)和类脂(磷脂、蜡、萜类、甾类)。

二、分类

(1)单纯脂:脂肪酸与醇类形成的酯,甘油酯、鞘脂、蜡

(2)复合脂:甘油磷脂、鞘磷脂。

(3)萜类和甾类及其衍生物:不含脂肪酸,都是异戊二烯的衍生物。

(4)衍生脂:上述脂类的水解产物,包括脂肪酸及其衍生物、甘油、鞘氨醇等。

(5)结合脂类:糖脂、脂蛋白

三、脂类的生物学功能

脂类的生物学功能也多种多样:

①生物膜的结构组分(甘油磷脂和鞘磷脂,胆固醇、糖脂);②能量贮存形式(动物、油料种子的甘油三酯);③激素、维生素和色素的前体(萜类、固醇类);④生长因子;⑤抗氧化剂;⑥ 化学信号(如 );⑦参与信号识别和免疫(糖脂);⑧动物的脂肪组织有保温,防机械压力等保护功能,植物的蜡质可以防止水分的蒸发。

第一节脂肪酸及其衍生物

一、脂肪酸

绝大多数的脂肪酸含有偶数个碳原子,形成长而不分支的链(也有分支的或含环的脂肪酸)。

不饱和脂肪酸有顺式和反式两种异物体。但生物体内大多数是顺式结构。

不饱和脂肪酸中,反式双键会造成脂肪酸链弯曲,分子间没有饱和脂肪酸链那样结合紧密。因此,不饱和脂肪酸的熔点低。

脂肪酸(主要是豆蔻酸与棕榈酸)可以与蛋白质共价相连,形成脂酰蛋白(acyloted protein),脂酰基团能促进膜蛋白与疏水环境间的相互作用。

1、必需脂肪酸 essential fatty acids

植物和细菌可以利用乙酰CoA合成所需的全部脂肪酸。

哺乳动物既可以从食物中获得大部分脂肪酸,也可以合成饱和脂肪酸和一些单不饱和脂肪酸。

但是,哺乳动物不能合成多不饱和脂肪酸(如亚油酸和亚麻酸),称为必需脂肪酸。

亚油酸和亚麻酸必须从植物中获取。花生四烯酸可由亚油酸在体内合成。

P52 表2—3某些油脂的脂肪酸组成

2、皂化值(评估油的质量)

完全皂化1克油脂所需KOH的毫克数,称皂化值。

用来评估油脂的质量。

3、酸值(酸败程度)

中和1克油脂中的游离脂肪酸所消耗的KOH毫克数。

4、(不饱和键的多少)

100克油脂吸收碘的克数。

二、类二十烷酸

也称类花生酸(eicosanoid),包括前列腺素类(prostaglandin),凝血恶烷类(thromboxane)和白细胞三烯类(leucotriene)

是一大类由许多哺乳动物组织产生的激素类的物质。它们只在产生的器官中起作用,所以称为自泌调控分子,而不是激素。

大多数的类二十烷酸是花生四烯酸的衍生物。

花生四烯酸也称5,8,11,14-二十碳四烯酸(eicosatetraenoio acid),是由亚油酸合成后加上一个二碳单位、引入两个双键。

1、前列腺素类

图9A

前列腺素类是花生四烯的衍生物。

前列腺素类有一个环戊烷结构,C11、C15位点各有一个-OH。

PGE在C9位上有一个C=O(carbonyl group),PGF在C9上有一个-OH。

角注数学表明分子中双键的数目,PG2类前列腺素是人类中最重要的前列腺素。

前列腺素参与许多生理过程的调节控制,促进炎症反应,参与生殖过程(如排卵、受孕和分娩时子宫的收缩),参与消化。

图9B

2、、凝血恶烷类(thromboxanes)

凝血恶烷类也是花生四烯酸的衍生物。

与其他类二十烷酸不同的是凝血恶烷类有环醚的结构。

凝血恶烷A2(TxA2)是该类化合物中最重要的一种,它主要由血小板产生,促进血小板凝聚和平滑肌收缩。

3、白细胞三烯(leucotriene,LT)

是花生四烯酸的羟基脂肪酸衍生物。

最初是在白细胞中发现的,并且有三烯结构,故名白细胞三烯。

LTC4、LTD4和LTE4是过敏性反应的慢反应物质的组分,在炎症反应起积极作用,促进白细胞趋向破坏组织。

第二节脂酰甘油

因为不带电荷,有时也称中性脂(neutral fats)

结构:

图1

简单三脂酰甘油

混合三脂酰甘油

第三节磷脂

磷脂是重要的两亲物质,它们是生物膜的重要组分、乳化剂和表面活性剂(表面活性剂是能降低液体,通常是水的,表面张力,沿水表面扩散的物质)。

磷脂有两类:甘油磷脂和鞘氨醇磷脂。

甘油磷脂由甘油、脂肪酸、磷酸和一分子氨基醇(如胆碱、乙醇胺、丝氨酸或肌醇)组成。

鞘氨醇磷脂只是以鞘氨醇代替了甘油。

一、甘油磷脂

天然存在的甘油磷脂都是L—构型。

1、结构与分类

依照氨基醇的不同可分以下几类:

P57 表2-6各种甘油磷脂的极性头部和电荷量

(1)、磷脂酰胆碱(卵磷脂)(PC)

HO—CH2CH2N+(CH3)3(胆碱)

分布:

植物:大豆等,

动物:脑、精液、肾上腺、红细胞,蛋卵黄(8-10%)。

作用:控制肝脂代谢,防止脂肪肝的形成。

(2)、磷脂酰乙醇胺(脑磷脂)(PE)

HO—CH2CH2—N+H3(乙醇胺)

参与血液凝结。

(3)、磷脂酰丝氨酸(PS)

HO—CH2CH—COO-(丝氨酸)

N+H3

(1)—(3)X均为氨基醇。

(4)、磷脂酰肌醇(PI)

(5)、磷脂酰甘油(PG)

(6)、二磷脂酰甘油(心磷脂)

2、甘油磷脂的性质

①极性:极性头、非极性尾

②带电性(可用于分离纯化)

二、鞘磷脂

高等动物组织中含量较丰富。

1、组成:

一个鞘氨醇一个脂肪酸一个磷酸一个胆碱或乙醇胺2、结构与性质

鞘磷脂极性头部分是磷脂酰胆碱或磷脂酰乙醇胺。

鞘磷脂结构与甘油磷脂相似,因此性质与甘油磷脂基本相同。

第四节鞘脂类

鞘脂类也是动植物生物膜的重要组分。

鞘脂类含有一个长的氨基醇。

一、鞘氨醇

已发现的鞘氨醇类约有30种。

图 2-氨基-4-十八碳烯-1.3-二醇

此双键还原,即二氢鞘氨醇

鞘氨醇植物鞘氨醇

二、神经酰胺

鞘脂类的核心结构是神经酰胺(ceramide),由鞘氨醇氨基以酰胺键与长链(18—26C)脂肪酸的羟基相连。

图神经酰胺

在鞘磷脂中,神经酰胺1位的-OH被磷酸胆碱(phosphorylcholine)或磷酸乙醇胺(phosphorylethanolamine)的磷酸基因酯化。

除了动物细胞膜外,鞘磷脂在神经细胞的髓鞘中含量最丰富。

第五节结合脂类

一、糖脂 glycolipid

P478 图9—8 P479 图9—10

甘油醇糖脂 N—脂酰神经鞘氨醇糖脂(神经酰胺糖脂)

1、甘油醇糖脂

半乳糖甘油二酯称:6—磺基Glc甘油二酯

2、N—脂酰神经鞘氨醇糖脂(神经酰胺糖脂)

神经酰胺还是糖脂的前体物,有时称鞘糖脂。

图9.9

在鞘糖脂中,单糖、双糖或寡糖通过O-糖苷键与神经酰胺相连,重要的鞘糖脂有脑苷脂(cerebroside)、硫脑苷脂(sulfatide)和神经节苷脂(ganglioside)。

脑苷脂是单糖与神经酰胺形成的糖脂,是非离子型的。半乳糖脑苷脂(galatocerebroside)几乎全部存在于脑的细胞膜中。

脑苷脂被硫酸化后称为硫脑苷脂,在生理pH下带负电荷。

寡糖链(带有一个或多个唾液酸残基)与神经酰胺形成的鞘糖脂称为神经节苷脂,最初是从神经组织中分离到的,在其它组织中也有分布。

神经节苷脂的命名含有M、D、T和角注数字,M、D、T分别表示含有一个、两个、三个唾液酸,数字表示在糖链上的位置。

(1)、脑苷脂(中性糖鞘脂类)

主要在神经、脑组织中,X为Glc称Glc脑苷脂,X为Gal称Gal脑苷脂。X还可能是:Fuc、GlcNAc、GalNAc (2)、神经节苷酯(酸性糖鞘脂类)

含有唾液酸,在脑灰质和胸腺中含量高。

中枢神经系统某些神经元膜的特征性脂,可能与通过神经元的神经冲动传递有关。

人的神经系统细胞膜至少有15种神经节苷脂,它们的生物功能尚未完全了解。

3、糖脂的生物学功能

糖脂的功能还不十分清楚,有些动物细胞膜上的糖脂分子能与细菌毒素以及细菌细胞结合,起受体的作用。

(1)细胞结构的刚性

(2)抗原的化学标记血型抗原

人的A、B、O血型差异在于糖链末端残基。现在临床上正研究用酶促降解B—抗原或A抗原的末端残基Gal或GalNAc,从而增加O—抗原的血液来源。

(3)细胞分化阶段可鉴定的化学标记

可能与糖链的长短有关

(4)调节细胞的正常生长

与正常细胞转化成肿癌细胞有关。肿癌Cell的神经节苷脂糖链比正常Cell的短。

(5)授予细胞与其它生物活性物质的反应性倾向。

鞘脂贮积病(sphingolipld storage disease,υ sphingolipidose)

-氨基己糖苷酶)缺陷造成的。当细胞积累GM2时就溶胀最终死亡,Tay-Sachs综合症(失明,肌肉萎缩,抽搐,精神错乱),通常在出生数月后表现出来。β-hexosaminidaseA(β溶酶体贮积病是由于降解某种特定代谢物的酶发生遗传性缺陷造成的。一些溶解体贮积病与鞘脂代谢有关,也称鞘脂贮积病,常见的就是Tay-sochs神经节苷GM2贮积病,这是由于降解它的

disease symptern Accumulating spluingolipid Enzyme deficiency

Tay-sachs disease Blindness

Muscle weakness

Seizures

Mental retardation Ganglioside -hexosaminidoseAβGM2

Gaucheris disease Mental retardations,

Liver and spleen enlargement

Eresion of cong -glucosidaseβbones Glucocerebosile

Niemann-Pick disease Montal retardution sphingomyelin sphingomylinase

二、脂蛋白 lipoprotein

要点:血桨脂蛋白血桨白蛋白

(学生自己看,此处不讲,在脂代谢中讲。)

虽然脂蛋白可以指任何与脂基(如脂肪酸、异戊二烯)共价相连的蛋白、但它常常用来指哺乳动物血浆(尤其是人)中的脂-蛋白质复合物。

血浆脂蛋白可以把脂类(三酰甘油、磷脂、胆固醇)从一个器官运输到另一个器官。

图9.17 P233

血浆脂蛋白根据密度来分类:

(1)乳糜微粒,密度非常低,运输甘油三酯和胆固醇脂,从小肠到组织肌肉和adipose组织。

(2)极低密度脂蛋白VLDL(0.95-1.006g/cm3),在肝脏中生成,将脂类运输到组织中,当VLDL被运输到全身组织时,被分解为三酰甘油、脱辅基蛋白和磷脂,最后,VLDL被转变为低密度脂蛋白。

(3)低密度脂蛋白(LDL,1.006-1.063g/cm3),把胆固醇运输到组织,经过一系列复杂的过程,LDL与LDL受体结合并被细胞吞食。

(4)高密度脂蛋白(HDL,1.063-1.210g/cm3),也是在肝脏中生成,可能负责清除细胞膜上过量的胆固醇。当血浆中的卵磷脂:胆固醇酰基转移酶(Lecithin cholesterol acyltransferase, LCAT)将卵磷脂上的脂肪酸残基转移到胆固醇上生成胆固醇脂时,HDL将这些胆固醇脂动输到肝。肝脏将过量的胆固醇转化为胆汁酸。

脂蛋白与动脉粥样硬化:(atherosclerosis)υ

动脉粥样硬化是一个慢性病,在此过程中,粥样物质逐渐沉积在动脉的内壁上,这些沉积物称为Plaque(蚀斑),在plaque形成过程中,平滑肌细胞、巨噬细胞和各种细胞残渣逐渐聚集。当巨噬细胞中吞食了大量脂类物质(主要是胆固醇和胆固醇脂)它们就成为粥样化细胞。最后,粥样硬化斑钙化(calcify)突入动脉腔,阻止血液流动,大脑、心、肺等器官就会缺氧和营养。冠状动脉粥样硬化病是最常见的一种,由于缺氧和营破坏了心肌。

Plaque中的胆固醇大部分是来自粥样细胞吞噬的LDL。因此,毫不奇怪,高水平的血浆LDL与冠状动脉粥样症直接相关(LDL含有大量的胆固醇及胆固醇脂),其它相关因素还包括高脂类饮食、吸烟、抑郁和缺少运动,高水平的血浆HDL 与代几率的冠状动脉病有关。肝细胞是唯一具有HDL受体的细胞。

可粥样化的细胞具有LDL受体,当LDL与受体结合后这些细胞就通过胞吞作用吞食LDL。在正常情况下,进入细胞中的LDL释放出的胆固醇和其它脂类可用于细胞结构和代谢上的需要。通常情况下LDL受体功能是高度调控的,吞入相对大量的LDL后,LDL受体合成就降低。巨噬细胞却不同,LDL受体的合成并不降低,粥样硬化斑中的巨噬细胞含有高水平的LDL受体,而且对氧化破坏的LDL仍有亲和力。抗坏血酸(Vc)和VE都是抗氧化剂,能抑止粥样斑的形成。第六节萜类和固醇类化合物

可以统称为类异戊二烯类(isoprenoid),由乙酰-CoA经由异戊二烯焦磷酸生成的,而不是由异戊二烯合成的

一、萜类

一些真核蛋白质合成后经过异戊二烯化,常见的异戊二烯基团就是farnesyl和geranylgeranyl group

二、固醇类

结构:

含有环戊烷多氢菲母核的一类醇、酸及其衍生物。包括:固醇、固醇衍生物。

1、胆固醇(二氢胆固醇、T—脱氢胆酸、胆固醇酯)

以游离或酯的形态存在于一切动物组织中,植物中没有。是最早由从动物胆石中分离出的固醇。

(1)、结构

C3 羟基

C10和C13各一个甲基

C5与C6间一个双键

C17异辛烷

(2)、性质

白色、斜方晶体。

a. 醇基可与脂酸成酯(棕榈酸、硬脂酸、油酸)

b. 双键可加氢

(3)、分布及功能

a. 70千克人体含140克左右,1/4在脑及神经组织中,肝、肾含量较多。肾上腺、卵巢等合成固醇激素的腺体含量也较多,可达1—5%。血清中含量升高,会增加患心血管疾病的可能性。

b. 胆固醇是生物膜的重要成分,羟基极性端分布于膜的亲水界面,母核及侧链深入膜双层,控制膜的流动性,阻止磷脂在相变温度以下时转变成结晶状态,保证膜在低温时的流动性及正常功能。

c. 胆固醇是合成胆汁酸、类固醇激素、维生素D等生理活性物质的前体。

胆汁酸(在肝中合成)参与肠道脂类吸收

肾上腺皮质激素、雌激素、雄激素

7一脱氢胆固醇紫外线维生素D3

2、植物固醇

不能被动物吸收和利用。

主要有:豆固醇(大豆中)

麦固醇(麦芽中)

3、酵母固醇

麦角固醇,经紫外光照射可转化成维生素D3。

三、固醇衍生物

1、胆汁酸

多数脊椎动物的胆酸,能以肽键与Gly或牛磺酸结合。胆酸与脂肪酸或其他脂类结合(胆固醇,胡萝卜素)成盐,乳化肠腔内油脂,增加脂肪酶作用位点,便于油脂消化吸收。

2、类固醇激素

(1)肾上腺皮质激素(7种)

(2)性激素

雄性激素:睾丸酮

雌性激素:雌二醇、、黄体酮

第七节酶类

酶是一类具有高效率、高度专一性、活性可调节的高分子生物催化剂。

1957巴斯德提出酒精发酵是酵母细胞活动的结果。

1 分子Glc→2分子乙醇+2分子CO

2 从Glc开始,经过12种酶催化,12步反应,生成乙醇。

1897 Buchner兄弟证明发酵与细胞的活动无关,不含细胞的酵母汁也能进行乙醇发酵。

1913 Michaelis和Menten提出米氏学说—酶促动力学原理。

1926 Sumner首次从刀豆中提出脲酶结晶,并证明具有蛋白质性质。

1969 化学合成核糖核酸酶。

1967-1970 从E.coli中发现第I、第II类限制性核酸内切酶。

1986 Cech发现四膜虫细胞大核期间26S rRNA前体具有自我剪接功能。

ribozyme , deoxyribozyme

E.coRI

5’——GAATTC——3’

3’——CTTAAG——5’

限制作用修饰作用

5’——GAATTC——3’5’——GAATTC——3’

3’——CTTAAG——5’3’——CTTAAG——5’

第一节酶学概论

一、酶的生物学意义

大肠杆菌生命周期20分钟,生物体内化学反应变得容易和迅速进行的根本原因是体内普通存在生物催化剂—酶。没有酶,生长、发育、运动等等生命活动就无法继续。

限制性核酸内切酶(限制-修饰)

二、酶的概念及其作用特点

1、酶是一种生物催化剂

酶是一类具有高效率、高度专一性、活性可调节的高分子生物催化剂。

生物催化剂:酶(enzyme),核(糖)酶(ribozyme),脱氧核(糖)酶(deoxyribozyme)

2、酶催化反应的特点

(1)、催化效率高

酶催化反应速度是相应的无催化反应的108-1020倍,并且至少高出非酶催化反应速度几个数量级。

(2)、专一性高

酶对反应的底物和产物都有极高的专一性,几乎没有副反应发生。

(3)、反应条件温和

温度低于100℃,正常大气压,中性pH环境。

(4)、活性可调节

根据据生物体的需要,许多酶的活性可受多种调节机制的灵活调节,包括:别构调节、酶的共价修饰、酶的合成、活化与降解等。

(5)、酶的催化活性离不开辅酶、辅基、金属离子

3、酶与非生物催化剂相比的几点共性:

①催化效率高,用量少(细胞中含量低)。

②不改变化学反应平衡点。

③降低反应活化能。

P234 图4-1 非催化过程及催化过程自由能的变化

④反应前后自身结构不变。

催化剂改变了化学反应的途径,使反应通过一条活化能比原途径低的途径进行,催化剂的效应只反映在动力学上(反应速度),不影响反应的热力学(化学平衡)。

三、酶的化学本质

(一)酶的蛋白质本质

经典概念:所有的酶都是蛋白质,酶是具有催化功能的蛋白质,因此酶具有蛋白质的一切共性。

1、酶的蛋白质组成

有些酶仅由蛋白质组成,例如,脲酶、溶菌酶、淀粉酶、脂肪酶、核糖核酸酶等

有些酶不仅含有蛋白质(酶蛋白),还含有非蛋白质成分(辅助因子),只有酶蛋白与辅助因子结合形成复合物(全酶)才表现出酶活性,如超氧化物歧化酶Cu2+、Zn2+)、乳酸脱氢酶(NAD+)

酶的专一性由酶蛋白的结构决定,辅助因子传递电子或某些化学基团。

2、酶的辅助因子

酶的辅助因子主要有金属离子(Fe2+、Fe3+ 、Cu+、Cu2+、 Mn2+、、Mn3+、Zn2+、Mg2+ 、K+、 Na+ 、Mo6+ 、Co2+等)和有机化合物。

辅酶:与酶蛋白结合较松,可透析除去。

辅基:与酶蛋白结合较紧。

酶辅助因子

CuZn-SOD Cu2+ Zn2+

Mn-SOD Mn2+

过氧化物酶 Fe2+或Fe3+

II型限制性核酸内切酶 Mg2+

羧肽酶 Zn2+

P235 表4-1 一些酶的辅助因子(金属离子)

P237 表4-2 基团反应中的辅酶和辅基。

酶蛋白决定酶专一性,辅助因子决定酶促反应的类型和反应的性质。比如,NAD+可与多种酶蛋白结合,构成专一性强的乳酸脱氢酶、醇脱氢酶、苹果酸脱氢酶、异柠檬酸脱氢酶。

生物体内酶种类很多,而辅助因子种类却很少,原因是一种辅助因子可与多种酶蛋白结合。

(二)ribozyme核酶(具有催化功能的RNA)

1980以前,已知所有的生物催化剂,其化学本质都是蛋白质。

80年代初,美国科罗拉多大学博尔德分校的Thomas Cech和美国耶鲁大学Sidney Altman各自独立发现RNA具有生物催化功能,此发现被认为是近十年生化领域最令人鼓舞的发现,此二人分亨1989诺贝尔化学奖。

ribozyme种类:①自我剪接ribozyme ②自我剪切ribozyme ③催化分子间反应ribozyme 后边细讲

四、按酶蛋白的亚基组成及结构特点分类

1、单体酶

由一条或多条共价相连的肽链组成的酶分子

牛胰RNase 124a.a 单链

鸡卵清溶菌酶 129a.a 单链

胰凝乳蛋白酶三条肽链

单体酶种类较少,一般多催化水解反应。

2、寡聚酶

由两个或两个以上亚基组成的酶,亚基可以相同或不同,一般是偶数,亚基间以非共价键结合。

①含相同亚基的寡聚酶

苹果脱胱氢酶(鼠肝),2个相同的亚基

②含不同亚基的寡聚酶

琥珀酸脱氢酶(牛心),αβ2个亚基

寡聚酶中亚基的聚合,有的与酶的专一性有关,有的与酶活性中心形成有关,有的与酶的调节性能有关。

大多数寡聚酶是胞内酶,而胞外酶一般是单体酶。

3、多酶复合体

由两个或两个以上的酶,靠非共价键结合而成,其中每一个酶催化一个反应,所有反应依次进行,构成一个代谢途径或代谢途径的一部分。如脂肪酸合成酶复合体。

例如:大肠杆菌丙酮酸脱氢酶复合体由三种酶组成

①丙酮酸脱氢酶(E1)以二聚体存在2×9600

②二氢硫辛酸转乙酰基酶(E2) 70000

③二氢硫辛酸脱氢酶(E3)以二聚体存在2×56000

复合体:12个E1二聚体24×96000

24个E2单体24×70000

6个E3二聚体12×56000

总分子量560万

4、多酶融合体

一条多肽链上含有两种或两种以上催化活性的酶,这往往是基因融合的产物。

例如:天冬氨酸激酶I---高丝氨酸脱氢酶I融合体(双头酶)

该酶是四聚体α4,每条肽链含两个活性区域:N-端区域是Asp激酶,C端区域是高Ser脱氢酶。

五、酶在细胞中的分布

一个细胞内含有上千种酶,互相有关的酶往往组成一个酶体系,分布于特定的细胞组分中,因此某些调节因子可以比较特异地影响某细胞组分中的酶活性,而不使其它组分中的酶受影响。

1. 分布于细胞核的酶

核被膜酸性磷酸酶

染色质三磷酸核苷酶

核仁核糖核酸酶

核内可溶性部分酵解酶系、乳酸脱氢酶

2. 分布于细胞质的酶

参与糖代谢的酶酵解酶系

磷酸戊糖途径酶系

参与脂代谢的酶脂肪酸合成酶复合体

参与a.a蛋白质的酶 Asp氨基转移酶

参与核酸合成的酶核苷激酶核苷酸激酶

3. 分布于内质网的酶

光滑内质网胆固醇合成酶系

粗糙内质网蛋白质合成酶系

(细胞质一侧)

4. 分布于线粒体的酶

外膜:酰基辅酶A合成酶

内膜:NADH脱氢酶

基质:三羧酸循环酶系

脂肪酸β-氧化酶系

5. 分布于溶酶体的酶

水解蛋白质的酶

水解糖苷类的酶

水解核酸的酶

水解脂类的酶

6. 标志酶

有些酶只分布于细胞内某种特定的组分中,

核:尼克酰胺单核苷酸腺苷酰转移酶,功能:DNA、RNA生物合成

线粒体:琥珀酸脱氢酶(电子转移、三羧酸循环)

溶酶体:酸性磷酸酶(细胞成分的水解)

微粒体:(核蛋白体、多核蛋白体、内质网)Glc-6-磷酸酶

上清液:乳酸脱氢酶

第二节酶的国际分类及命名

一、习惯命名

1961年6以前使用的酶沿用习惯命名

1.(绝大多数酶)依据底物来命名

如:催化蛋白质水解的酶称蛋白酶。催化淀粉水解的酶称淀粉酶。

2. 依据催化反应的性质命名

如:水解酶、转氨酶

3 结合上述两个原则命名,琥珀酸脱氢酶。

4. 有时加上酶的来源

如:胃蛋白酶、牛胰凝乳蛋白酶

习惯命名较简单,但缺乏系统性。

二、国际系统命名

系统名称应明确标明酶的底物及催化反应的性质。

如:草酸氧化酶(习惯名),系统名称:草酸:氧氧化酶

又如:谷丙转氨酶(习惯名),系统名:丙氨酸:α-酮戊二酸氨基转移酶

反应:丙氨酸+α--酮戊二酸→Glu+丙酮酸

三、国际系统分类法及编号(EC编号)

原则:将所有酶促反应按性质分为六类,分别用1、2、3、4、5、6表示。

再根据底物中被作用的基团或键的特点,将每一大类分为若干个亚类,编号用1、2、3……,每个亚类又可分为若干个亚一亚类,用编号1、2、3……表示。

每一个酶的编号由4个数字组成,中间以“?”隔开。第一个数字表示大类,第二个数字表示亚类,第三个表示亚-亚类,第四个数字表示在亚-亚中的编号。

1、氧化还原酶类

催化氧化还原反应:A?2H+B=A+B?2H

乳酸:NAD+氧化还原酶(EC1.1.1.27),习惯名:乳酸脱氢酶

2、转移酶类

AB+C=A+BC

Ala:酮戊二酸氨基移换酶(EC2.6.1.2),习惯名:谷丙转氨酶

3、水解酶类

催化水解反应,包括淀粉酶、核酸酶、蛋白酶、脂酶。

亮氨酸氨基肽水解酶(EC3.4.1.1),习惯名: Ile氨肽酶。

4、裂合酶类(裂解酶)

催化从底物上移去一个基团而形成双键的反应或其逆反应

二磷酸酮糖裂合酶(EC4.1.2.7),习惯名:醛缩酶

5、异构酶(EC5.3.1.9)

催化同分异构体相互转化,6-磷酸Glc异构酶

6、合成酶(连接酶)

催化一切必须与ATP分解相偶联、并由两种物质合成一种物质的反应。

P241 表4-8 酶的国际分类——大类和亚类

举例:乙醇脱氢酶的分类编号是 EC1.1.1.1 ,乳酸脱氢酶EC1.1.1.27 ,苹果酸脱氢酶EC1.1.1.37

第一个数字表示大类:氧化还原

第二个数字表示反应基团:醇基

第三个数字表示电子受体:NAD+或NADP+

第四个数字表示此酶底物:乙醇,乳酸,苹果酸。

前面三个编号表明这个酶的特性:反应性质、底物性质(键的类型)及电子或基团的受体,第四个编号用于区分不同的底物。

酶的物种和组织的差异

来自不同物种或同一物种不同组织或不同细胞器的同一种酶,虽然它们催化同一个生化反应,但它们的一级结构可能不相同,有时反应机制也可能不同,可是无论是酶的系统命名法还是习惯命名法,对这些均不加以区别,而定为相同的名称,这是因为命名酶的根据是酶所催化的反应。

例如, SOD不管来源如何,均催化如下反应

2O2-+2H+→H2O2+O2 H2O2再由过氧化氢酶催化、分解

它们有同一个名称和酶的编号EC1.15.1.1

实际此酶可分三类:

CuZn-SOD 真核生物细胞质中

Mn-SOD 真核生物线粒体中

Fe-SOD

即使同是CuZn-SOD,来自牛红细胞与猪红细胞的,其一级结构也有很大不同。

因此,在讨论一个具体的酶时,应对它的来源与名称一并加以说明。

第三节酶促反应动力学

酶促反应动力学是研究酶促反应的速度以及影响酶促反应速度的各种因素,包括低物浓度、酶浓度、pH、温度、激活剂与抑制剂、等。

一、酶的量度

酶的含量不能直接用重量和摩尔数表示(不纯、失活、分子量不知),而采用酶的活力单位表示

1、酶活力与酶促反应速度

酶活力:用在一定条件下,酶催化某一反应的反应速度表示。反应速度快,活力就越高。

酶量—酶活力一反应速度

酶促反应速度的表示方法:单位时间、单位体积中底物的减少量或产物的增加量。

单位:浓度/单位时间

P243 图4-4 酶反应速度曲线

研究酶促反应速度,以酶促反应的初速度为准。因为底物浓度降低、酶部分失活产物抑制和逆反应等因素,会使反应速度随反应时间的延长而下降。

2、酶的活力单位(U)

国际酶学会标准单位:在特定条件下,1分钟内能转化1umol底物的酶量,称一个国际单位(IU)。特定条件:25℃ pH及底物浓度采用最适条件(有时底物分子量不确定时,可用转化底物中1umol的有关基团的酶量表示)。

实际工作中,每一种酶的测活方法不同,对酶单位分别有一个明确的定义。

如:限制性核酸内切酶

用粘度法测活性:定义为30℃, 1分钟,使底物DNA溶液的比粘度下降25%的酶量为1个酶单位。

转化率法:标准条件,5分钟使1ug供体DNA残留37%的转化活性所需的酶量为1个酶单位。

凝胶电泳法测活:37℃,1小时,使1ugλDNA完全水解的酶量为1个酶单位。

可见,同一种酶采用不同的测活方法,得到的酶活单位是不同的,即使是同一种测活法,实验条件稍有相同,测得的

酶单位亦有差异。

如淀粉酶,两种定义

A:1 g可溶性starch,在1h内液化所需的enzyme量。

B:l ml 2%可溶性starch ,在1h内液化所需的enzyme量。

1g 酶制剂溶于1000ml H2O,取0.5ml与2%的starch 20ml反应,pH6.0,10分钟完全液化,求酶活力。

A:60/10×20×2%×1/0.5×1000=4800u/克enzyme制剂

B:60/10×20/0.5×1000=240000u/克enzyme制剂

3、酶的比活力 Specific activity

每毫克酶蛋白所具有的酶活力。酶的比活力是分析酶的纯度是重要指标。

单位:U/mg蛋白质。

有时用每克酶制剂或每毫升酶制剂含有多少个活力单位表示。

举例:一个酶的分离纯化分为4 步。

步骤 1 2 3 4

总活力(U) 6 4 3 2

总蛋白质(mg) 20 10 5 2

比活力(U/mg) 6/20 4/10 3/5 2/2

酶的提纯过程中,总蛋白减少,总活力减少,比活力增高。

酶的纯化倍数:

酶的回收率:×100%

4、酶的转换数和催化周期

分子活性定义:每mol的 enzyme 在1秒内转化substrate的 mol数。

亚基或催化中心活性定义:每mol 的active subunit或 active center 在一秒内转化的substrate 的mol 数,称为转换数Kcat

P244图表4—4

转换数的倒数即为催化周期:一个酶分子每催化一个底物分子所需的时间。

如:乳糖脱氢酶转换数为1000/秒,则它的催化周期为10-3秒。

二、底物浓度对酶促反应速度的影响

单底物酶促反应,包括异构酶、水解酶及大部分裂合催化的反应。

1913 Michaelis 和Menten 提出米—曼方程。

(一)底物浓度对酶促反应速度的影响——米式学说的提出

1903 Henri 研究蔗糖水解反应。

sucrose +H2O acid glucose +fructose

sucrase

酸水解

V V

[sucrose]

酶水解

V

V

[enzyme]( substrate不变) [sucrose]

底物浓度与酶促反应速度的关系:

当底物浓度不断增大时,反应速度不再上升,趋向一个极限,酶被底物饱和(底物饱和现象)。

中间产物假说:酶与底物先络合成一个中间产物,然后中间产物进一步分解成产物和游离的酶。

证据:(1)竞争性抑制实验(2)底物保护酶不变性(3)结晶ES复合物的获得。

米式学说:

1913年,Michaelis和Menten继承和发展了中间产物学说,在前人工作基础上提出酶促动力学的基本原理,并以数学公式表明了底物浓度与酶促反应速度的定量关系,称米式学说:

(二)米式方程的导出:

1、基于快速平衡假说——早年的米式方程

最初,Michaelis和Menten是根据“快速平衡假说”推出米式方程。

快速平衡假说:

①在反应的初始阶段,底物浓度远远大于酶浓度,因此,底物浓度{S}可以认为不变。

②游离的酶与底物形成ES的速度极快,E + S ES,而ES形成产物的速度极慢,ES分解成产物P对于[ES]浓度的动态平衡没有影响,不予考虑。

K1、K2》K3

③因为研究的是初速度,P的量很小,由P ES可以忽略不记。

ES的生成速度:K1([E] - [ES])[S]

ES的分解速度:K2[ES]

K1([E] - [ES])[S] = K2[ES]

反应速度:

KS现在称为底物常数

2、Briggs和Haldane的“稳态平衡假说”及其对米式方程的发展:

稳态平衡假说:

[ES]的的生成与分解处于动态平衡(稳态),有时必须考虑[ES]分解成产物P对于[ES]动态平衡的影响([ES]分解速度)。或者说,[ES]的动态平衡(分解速度)不仅与ES E+S有关,还与ES P + E有关。

稳态平衡假说的贡献在于第②点。

用稳态假说推导米式方程:

ES生成速度:

k1([E] - [ES])[S]

ES分解速度:

k2[ES]+k3[ES]

以上两个速度相等。

k1([E] - [ES])[S] = k2[ES]+k3[ES]

反应速度:

Vmax=k3 [E]

Km称米氏常数,当Km及Vmax已知时,即可确定酶反应速度与底物浓度的关系。

(三)米式方程讨论

1、快速平衡假说与稳态平衡假说的实质区别

当K1、K2>>K3时,即ES P是整个反应平衡中极慢的一步,那么

这就是早年提出的米式方程

因此说,稳态平衡 = 快速平衡 + 慢速平衡,

当ES P(即K3/K1)极慢时,稳态平衡基本等于快速平衡

2、Km的物理意义

当反应速度v=1/2 Vmax时, Km = [S],

Km的物理意义是:当反应速度达到最大反应速度的一半时底物的浓度。

单位:与底物浓度的单位一致,mol?L-1或mmol?L-1

Km是酶的特征常数之一。一般只与酶的性质有关,与酶的浓度无关。不同的酶Km值不同。

P248 表4-5 一些酶的Km值。

3、Km与天然底物

如果一个酶有几种底物,则每一种底物各有一个特定的Km,其中Km最小的底物称该酶的最适底物或天然底物。因为Km愈小(达到Vmax一半所需的底物浓度愈小)表示V变化越灵敏底物。

4、Km、Ks与底物亲和力

Km称米式常数,Km=(K2+K3)/K1 ,从某种意义上讲,Km是ES分解速度(K2+K3)与形成速度(K1)的比值,它包含ES解离趋势(K2/K1)和产物形成趋势(K3/K1)。

Ks称为底物常数,Ks=K2/K1,它是ES的解离常数,只反映ES解离趋势,因此,1/Ks可以表示酶与底物的亲和力大小(ES形成趋势),不难看出,底物亲和力大不一定反应速度大(产物形成趋势,K3/K1)

只有当K2、K1>>K3时,Km≈Ks,因此,1/Km只能近似地表示底物亲和力的大小。

问题:

(1)Km越小,底物亲和力越大(X)

(2)Ks越小,底物亲和力越大(√)

(3)天然底物就是亲和力最大的底物(X)

(4)天然底物就是Km值最小的底物(√)

5、Km与米式方程的实际用途

已知V求[S]

已知[S]求V

相对速度(酶活性中心被占据分数Y):

当v=Vmax时,表明酶的活性部位已全部被底物占据,v与[S]无关,只和[Et]成正比。当v=1/2 Vmax时,表示活性部位有一半被占据。

设定达到最大反应速度的0.9倍时,所需底物浓度为[S]0.9

[S]0.9=9Km

同理有:[S]0.8=4Km

[S]0.7=2.33Km

[S]0.6=1.5Km

[S]0.5=1Km

[S]0.1=1/9Km

[S]0.9 /[S]0.1=81

[S]0.7/[S]0.1=21

(四)Km和Vmax的求解方法

1、双倒数作图法

要从实验数据所得到的v-[S]曲线来直接决定Vmax是很困难的,也不易求出Km值。

由米式方程两边取倒数:

将实验所得的初速度数据v和[S]取倒数,得各种1/v和1/[S]值,将1/v对1/[S]作图,得

P250 图4-6

上图[S]范围在0.330—2.0Km,最适。

若[S]范围在3.3—20 Km ,直线斜率太小。

若[S]范围在0.033––0.2 Km ,直线斜率太大。

如当Km=1×10-5mol/L时,实验所取底物浓度范围应在0.33×10-5-2.0×10-5mol/L。

一般选底物浓度应考虑能否得到1/[S]的常数增量。

如当选[S]为1.01、1.11、1.25、1.42、1.66、2.0、2.5、3.33、5.0、10时

1/[S]为0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0是常数增量。

反之,若选[S]为常数增量1.0、2.0、3.0、4.0、5.0、10时,

1/[S]为0.1、0.111、0.125、0.5、1.0,是非常数增量,点多集中在1/v轴附近。

2、V—V/[S]作图法

P250 图4-7

三、多底物的酶促反应

前面讨论的米氏方程(推导米氏方程时用的是单底物),适用于单底物酶促反应,如异构、水解及大部分裂合反应,不适用于多底物反应。

A、B、C表示底物,按照底物与酶的结合顺序,产物则按它们从酶产复合物中释放次序分别用P、Q、R表示。

双底物酶促反应已知有三种机理

1、有序顺序反应机理

底物A、B与酶结合的顺序是一定的,产物P、Q的释放顺序也是一定的。

P251

生物化学王镜岩(第三版)课后习题解答

第一章糖类 提要 糖类是四大类生物分子之一,广泛存在于生物界,特别是植物界。糖类在生物体内不仅作为结构成分和主要能源,复合糖中的糖链作为细胞识别的信息分子参与许多生命过程,并因此出现一门新的学科,糖生物学。 多数糖类具有(CH2O)n的实验式,其化学本质是多羟醛、多羟酮及其衍生物。糖类按其聚合度分为单糖,1个单体;寡糖,含2-20个单体;多糖,含20个以上单体。同多糖是指仅含一种单糖或单糖衍生物的多糖,杂多糖指含一种以上单糖或加单糖衍生物的多糖。糖类与蛋白质或脂质共价结合形成的结合物称复合糖或糖复合物。 单糖,除二羟丙酮外,都含有不对称碳原子(C*)或称手性碳原子,含C*的单糖都是不对称分子,当然也是手性分子,因而都具有旋光性,一个C*有两种构型D-和L-型或R-和S-型。因此含n个C*的单糖有2n个旋光异构体,组成2n-1对不同的对映体。任一旋光异构体只有一个对映体,其他旋光异构体是它的非对映体,仅有一个C*的构型不同的两个旋光异构体称为差向异构体。 单糖的构型是指离羧基碳最远的那个C*的构型,如果与D-甘油醛构型相同,则属D系糖,反之属L 系糖,大多数天然糖是D系糖Fischer E论证了己醛糖旋光异构体的立体化学,并提出了在纸面上表示单糖链状立体结构的Fischer投影式。许多单糖在水溶液中有变旋现象,这是因为开涟的单糖分子内醇基与醛基或酮基发生可逆亲核加成形成环状半缩醛或半缩酮的缘故。这种反应经常发生在C5羟基和C1醛基之间,而形成六元环吡喃糖(如吡喃葡糖)或C5经基和C2酮基之间形成五元环呋喃糖(如呋喃果糖)。成环时由于羰基碳成为新的不对称中心,出现两个异头差向异构体,称α和β异头物,它们通过开链形式发生互变并处于平衡中。在标准定位的Hsworth式中D-单糖异头碳的羟基在氧环面下方的为α异头物,上方的为β异头物,实际上不像Haworth式所示的那样氧环面上的所有原子都处在同一个平面,吡喃糖环一般采取椅式构象,呋喃糖环采取信封式构象。 单糖可以发生很多化学反应。醛基或伯醇基或两者氧化成羧酸,羰基还原成醇;一般的羟基参与成脂、成醚、氨基化和脱氧等反应;异头羟基能通过糖苷键与醇和胺连接,形成糖苷化合物。例如,在寡糖和多糖中单糖与另一单糖通过O-糖苷键相连,在核苷酸和核酸中戊糖经N-糖苷键与心嘧啶或嘌呤碱相连。 生物学上重要的单糖及其衍生物有Glc, Gal,Man, Fru,GlcNAc, GalNAc,L-Fuc,NeuNAc (Sia),GlcUA 等它们是寡糖和多糖的组分,许多单糖衍生物参与复合糖聚糖链的组成,此外单糖的磷酸脂,如6-磷酸葡糖,是重要的代谢中间物。 蔗糖、乳糖和麦芽糖是常见的二糖。蔗糖是由α-Glc和β- Fru在两个异头碳之间通过糖苷键连接而成,它已无潜在的自由醛基,因而失去还原,成脎、变旋等性质,并称它为非还原糖。乳糖的结构是Gal β(1-4)Glc,麦芽糖是Glcα(1-4)Glc,它们的末端葡萄搪残基仍有潜在的自由醛基,属还原糖。环糊精由环糊精葡糖基转移酶作用于直链淀粉生成含6,7或8个葡萄糖残基,通过α-1,4糖苷键连接成环,属非还原糖,由于它的特殊结构被用作稳定剂、抗氧化剂和增溶剂等。 淀粉、糖原和纤维素是最常见的多糖,都是葡萄糖的聚合物。淀粉是植物的贮存养料,属贮能多糖,是人类食物的主要成分之一。糖原是人和动物体内的贮能多糖。淀粉可分直链淀粉和支链淀粉。直链淀粉分子只有α-1,4连键,支链淀粉和糖原除α-1,4连键外尚有α-1,6连键形成分支,糖原的分支程度比支链淀粉高。纤维素与淀粉、糖原不同,它是由葡萄糖通过β-1.4糖苷键连接而成的,这一结构特点使纤维素具有适于作为结构成分的物理特性,它属于结构多糖。 肽聚糖是细菌细胞壁的成分,也属结构多糖。它可看成由一种称胞壁肽的基本结构单位重复排列构成。胞壁肽是一个含四有序侧链的二糖单位,G1cNAcβ(1-4)MurNAc,二糖单位问通过β-1,4连接成多糖,链相邻的多糖链通过转肽作用交联成一个大的囊状分子。青霉素就是通过抑制转肽干扰新的细胞壁形成而起抑菌作用的。磷壁酸是革兰氏阳性细菌细胞壁的特有成分;脂多糖是阴性细菌细胞壁的特有成分。 糖蛋白是一类复合糖或一类缀合蛋白质。许多内在膜蛋白质和分泌蛋白质都是糖蛋白。糖蛋白和糖脂中的寡糖链,序列多变,结构信息丰富,甚至超过核酸和蛋白质。一个寡糖链中单糖种类、连接位置、异

王镜岩(第三版)生物化学下册课后习题答案

王镜岩(第三版)生物化学下册课后习题答案第34章DNA的复制和修复 ⒈生物的遗传信息如何由亲代传给子代? 答:在细胞分裂间期,DNA分子边解旋边复制,分别以亲代DNA的两条母链为模板,以核中游离的脱氧核苷酸为原料,根据碱基互补配对原则,合成两条子链,它们分别与相应的模板链螺旋化就形成了两个与亲代DNA 一样的子代DNA,在生物传种接代的过程中,亲代将复制出的一份DNA通过配子传给子代,从而实现了亲子代间遗传信息的传递。接下来,在子代个体发育的过程中,将利用DNA(gene)来指导自身蛋白质的合成,从而表现出与亲代相似的性状。 也有一些生物如某些病毒,是通过将亲代的RNA复制后传给子代的方式进行遗传信息的传递。 ⒉何谓DNA的半保留复制?是否所有的DNA复制都以半保留的方式进行?(双链DNA通常都以半保留方式复制。) 答:DNA在复制时首先两条链之间的氢键断裂两条链分开,然后以每一条链分别做模板各自合成一条新的DNA链,这样新合成的子代DNA分子中一条链来自亲代DNA,另一条链是新合成的,这种复制方式为半保留复制(semiconservative replication)。 并非所有的DNA复制都以半保留的方式进行,但双链DNA通常都以半保留方式复制。 ⒊若使15N标记的大肠杆菌在14N培养基中生长三代,提取

DNA,并用平衡沉降法测定DNA密度,其14N-DNA分子与14N-15N 杂合DNA分子之比应为多少?答:这两者之比为1:3。 ⒋比较DNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ性质的异同。DNA聚合酶Ⅳ和Ⅴ的功能是什么?有何生物学意义? 答:在E.coli中,共发现了3种DNA聚合酶,即DNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ。 DNA聚合酶Ⅰ是个多功能酶,具有5’--→ 3’聚合功能;3’--→ 5’外切功能以及3’--→ 5’外切功能。DNA聚合酶Ⅱ与DNA聚合酶Ⅰ功能相似,但没有5’--→ 3’外切功能。DNA聚合酶Ⅲ与DNA 聚合酶Ⅱ功能相同,但其聚合活性比DNA聚合酶Ⅰ高1000倍,是E.coliDNA复制中的最主要酶。 DNA聚合酶Ⅳ和Ⅴ是在1999年才被发现的,它涉及DNA的错误倾向修复(errorprone repair)。当DNA受到较严重损伤时, 即可诱导产生这两个酶,使修复缺乏准确性(accuracy),因而出现高突变率。其生物学意义在于高突变率虽会杀死许多细胞,但至少可以克服复制障碍, 使少数突变的细胞得以存活。 ⒌DNA复制的精确性、持续性和协同性是通过怎样的机制实现的? 答:DNA聚合酶Ⅲ由10个亚基组成,这些亚基将催化DNA合成、校对和夹位DNA等功能有机地组合在一起,保证了DNA复制的精确性、持续性和协同性。 ⒍何谓DNA的半不连续复制?何谓冈崎片断?试述冈崎片断合

生物化学笔记(整理版)1

《生物化学》绪论 生物化学可以认为是生命的化学,是研究微生物、植物、动物及人体等的化学组成和生命过程中的化学变化的一门科学。 生命是发展的,生命起源,生物进化,人类起源等,说明生命是在发展,因而人类对生命化学的认识也在发展之中。 20世纪中叶直到80年代,生物化学领域中主要的事件: (一)生物化学研究方法的改进 a. 分配色谱法的创立——快捷、经济的分析技术由Martin.Synge创立。 b. Tisellius用电泳方法分离血清中化学构造相似的蛋白质成分。吸附层析法分离蛋白质及其他物质。 c. Svedberg第一台超离心机,测定了高度复杂的蛋白质。 d. 荧光分析法,同位素示踪,电子显微镜的应用,生物化学的分离、纯化、鉴定的方法向微量、快速、精确、简便、自动化的方向发展。 (二)物理学家、化学家、遗传学家参加到生命化学领域中来 1. Kendrew——物理学家,测定了肌红蛋白的结构。 2. Perutz——对血红蛋白结构进行了X-射线衍射分析。 3. Pauling——化学家,氢键在蛋白质结构中以及大分子间相互作用的重要性,认为某些protein具有类似的螺旋结构,镰刀形红细胞贫血症。 (1.2.3.都是诺贝尔获奖者) 4.Sanger―― 生物化学家 1955年确定了牛胰岛素的结构,获1958年Nobel prize化学奖。1980年设计出一种测定DNA内核苷酸排列顺序的方法,获1980年诺贝尔化学奖。 5.Berg―― 研究DNA重组技术,育成含有哺乳动物激素基因的菌株。 6.Mc clintock―― 遗传学家发现可移动的遗传成分,获1958年诺贝尔生理奖。 7.Krebs―― 生物化学家 1937年发现三羧酸循环,对细胞代谢及分生物的研究作出重要贡献,获1953年诺贝尔生理学或医学奖。 8.Lipmann―― 发现了辅酶A。 9. Ochoa——发现了细菌内的多核苷酸磷酸化酶 10.Korberg——生物化学家,发现DNA分子在细菌内及试管内的复制方式。(9.10.获1959年的诺贝尔生理医学奖) 11.Avery―― 加拿大细菌学家与美国生物学家Macleod,Carty1944年美国纽约洛克菲勒研究所著名实验。肺炎球菌会产生荚膜,其成分为多糖,若将具荚膜的肺炎球菌(光滑型)制成无细胞的物质,与活的无荚膜的肺炎球菌(粗糙型)细胞混合 ->粗糙型细胞也具有与之混合的光滑型的荚膜->表明,引起这种遗传的物质是DNA 1 / 29

王镜岩生物化学名词解释#精选.

生物化学名词解释 1 .氨基酸( i ):是含有一个碱性氨基( H 2)和一个酸性羧基()的有机化合物,氨基一般连在α -碳上。氨基酸是蛋白质的构件分子 2.必需氨基酸( i ):指人(或其它脊椎动物)(赖氨酸,苏氨酸等)自己不能合成,需要从食物中获得的氨基酸。 3.非必需氨基酸(n i d):指人(或其它脊椎动物)自己能由简单的前体合成,不需要从食物中获得的氨基酸。 4.等电点():使氨基酸处于兼性离子状态,在电场中不迁移(分子的静电荷为零)的值。 5.茚三酮反应():在加热条件下,氨基酸或肽与茚三酮反应生成紫色(与脯氨酸及羟脯氨酸反应生成黄色)化合物的反应。 6.层析() :按照在移动相和固定相(可以是气体或液体)之间的分配比例将混合成分分开的技术。 7.离子交换层析( n):一种用离子交换树脂作支持剂的层析技术。 8.透析():利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质,使蛋白质和其他小分子物质如无机盐、单糖等分开的一种分离纯化技术。 9.凝胶过滤层析(,):也叫做分子排阻层析/凝胶渗透层析。一种利用带孔凝胶珠作基质,按照分子大小分离蛋白

质或其它分子混合物的层析技术。 10.亲合层析():利用共价连接有特异配体的层析介质,分离蛋白质混合物中能特异结合配体的目的蛋白质或其它分子的层析技术。 11.高压液相层析():使用颗粒极细的介质,在高压下分离蛋白质或其他分子混合物的层析技术。 12.凝胶电泳():以凝胶为介质,在电场作用下分离蛋白质或核酸的分离纯化技术。 13聚丙烯酰氨凝胶电泳():在去污剂十二烷基硫酸钠存在下的聚丙烯酰氨凝胶电泳。只是按照分子的大小,而不是根据分子所带的电荷大小分离的。 14.等电聚焦电泳():利用一种特殊的缓冲液(两性电解质)在聚丙烯酰氨凝胶制造一个梯度,电泳时,每种蛋白质迁移到它的等电点()处,即梯度为某一时,就不再带有净的正或负电荷了。 1 5.双向电泳():等电聚焦电泳和的组合,即先进行等电聚焦电泳(按照)分离,然后再进行(按照分子大小分离)。经染色得到的电泳图是二维分布的蛋白质图。 1 6 降解():从多肽链游离的 N 末端测定氨基酸残基的序列的过程。N 末端氨基酸残基被苯异硫氰酸酯()修饰,然后从多肽链上切下修饰的残基,再经层析鉴定,余下的多肽链(少了一个残基)被回收再进行下一轮降解循环。

王镜岩生物化学题库精选(含详细标准答案)

第十章 DNA 的生物合成(复制) 一、A型选择题 1.遗传信息传递的中心法则是() A.DNA→RNA→蛋白质 B.RNA→DNA→蛋白质 C.蛋白质→DNA→RNA D.DNA→蛋白质→RNA E.RNA→蛋白质→DNA 2.关于DNA的半不连续合成,错误的说法是() A.前导链是连续合成的 B.随从链是不连续合成的 C.不连续合成的片段为冈崎片段 D.随从链的合成迟于前导链酶合成 E.前导链和随从链合成中均有一半是不连续合成的 3.冈崎片段是指() A.DNA模板上的DNA片段 B.引物酶催化合成的RNA片段 C.随从链上合成的DNA片段 D.前导链上合成的DNA片段 E.由DNA连接酶合成的DNA 4.关于DNA复制中DNA聚合酶的错误说法是() A.底物都是dNTP B.必须有DNA模板 C.合成方向是5,→3, D.需要Mg2+参与 E.需要ATP参与 5.下列关于大肠杆菌DNA聚合酶的叙述哪一项是正确() A.具有3,→5,核酸外切酶活性 B.不需要引物 C.需要4种NTP D.dUTP是它的一种作用物 E.可以将二个DNA片段连起来 6.DNA连接酶() A.使DNA形成超螺旋结构 B.使双螺旋DNA链缺口的两个末端连接 C.合成RNA引物D.将双螺旋解链 E.去除引物,填补空缺 7.下列关于DNA复制的叙述,哪一项是错误的() A.半保留复制 B.两条子链均连续合成 C.合成方向5,→3, D.以四种dNTP为原料 E.有DNA连接酶参加 8.DNA损伤的修复方式中不包括() A.切除修复 B.光修复 C.SOS修复 D.重组修复 E.互补修复 9.镰刀状红细胞性贫血其β链有关的突变是() A.断裂B.插入C.缺失 D.交联 E.点突变 10.子代DNA分子中新合成的链为5,-ACGTACG-3,,其模板链是() A.3,-ACGTACG-5, B.5,-TGCATGC-3, C.3,-TGCATGC-5, D.5,-UGCAUGC-3, E.3,-UGCAUGC-5, 二、填空题 1.复制时遗传信息从传递至;翻译时遗传信息从传递至。2.冈崎片段的生成是因为DNA复制过程中,和的不一致。 3.能引起框移突变的有和突变。 4.DNA复制的模板是;引物是;基本原料是;参与反应的主要酶类有、、、和。 5.DNA复制时连续合成的链称为链;不连续合成的链称为链。 6.DNA的半保留复制是指复制生成的两个子代DNA分子中,其中一条链是,另一条链是。 7.DNA 复制时,阅读模板方向是,子代DNA合成方向是,催化DNA合成的酶是。

生物化学重点笔记(整理版)

教学目标: 1.掌握蛋白质的概念、重要性和分子组成。 2.掌握α-氨基酸的结构通式和20种氨基酸的名称、符号、结构、分类;掌握氨基酸的重要性质;熟悉肽和活性肽的概念。 3.掌握蛋白质的一、二、三、四级结构的特点及其重要化学键。 4.了解蛋白质结构与功能间的关系。 5.熟悉蛋白质的重要性质和分类 导入:100年前,恩格斯指出“蛋白体是生命的存在形式”;今天人们如何认识蛋白质的概念和重要性? 1839年荷兰化学家马尔德(G.J.Mulder)研究了乳和蛋中的清蛋白,并按瑞典化学家Berzelius的提议把提取的物质命名为蛋白质(Protein,源自希腊语,意指“第一重要的”)。德国化学家费希尔(E.Fischer)研究了蛋白质的组成和结构,在1907年奠立蛋白质化学。英国的鲍林(L.Pauling)在1951年推引出蛋白质的螺旋;桑格(F.Sanger)在1953年测出胰岛素的一级结构。佩鲁茨(M.F.Perutz)和肯德鲁(J.C.kendrew) 在1960年测定血红蛋白和肌红蛋白的晶体结构。1965年,我国生化学者首先合成了具有生物活性的蛋白质——胰岛素(insulin)。 蛋白质是由L-α-氨基酸通过肽键缩合而成的,具有较稳定的构象和一定生物功能的生物大分子(biomacromolecule)。蛋白质是生命活动所依赖的物质基础,是生物体中含量最丰富的大分子。 单细胞的大肠杆菌含有3000多种蛋白质,而人体有10万种以上结构和功能各异的蛋白质,人体干重的45%是蛋白质。生命是物质运动的高级形式,是通过蛋白质的多种功能来实现的。新陈代谢的所有的化学反应几乎都是在酶的催化下进行的,已发现的酶绝大多数是蛋白质。生命活动所需要的许多小分子物质和离子,它们的运输由蛋白质来完成。生物的运动、生物体的防御体系离不开蛋白质。蛋白质在遗传信息的控制、细胞膜的通透性,以及高等动物的记忆、识别机构等方面都起着重要的作用。随着蛋白质工程和蛋白质组学的兴起和发展,人们对蛋白质的结构与功能的认识越来越深刻。 第一节蛋白质的分子组成 一、蛋白质的元素组成 经元素分析,主要有C(50%~55%)、H(6%~7%)、O(19%~24%)、N(13%~19%)、S(0%~4%)。有些蛋白质还含微量的P、Fe、Cu、Zn、Mn、Co、Mo、I等。 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。因此,可以用定氮法来推算样品中蛋白质的大致含量。 每克样品含氮克数×6.25×100=100g样品中蛋白质含量(g%) 二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸 蛋白质在酸、碱或蛋白酶的作用下,最终水解为游离氨基酸(amino acid),即蛋白质组成单体或构件分子。存在于自然界中的氨基酸有300余种,但合成蛋白质的氨基酸仅20种(称编码氨基酸),最先发现的是天门冬氨酸(1806年),最后鉴定的是苏氨酸(1938年)。 (一)氨基酸的结构通式 组成蛋白质的20种氨基酸有共同的结构特点: 1.氨基连接在α- C上,属于α-氨基酸(脯氨酸为α-亚氨基酸)。 2.R是側链,除甘氨酸外都含手性C,有D-型和L-型两种立体异构体。天然蛋白质中的氨基酸都是L-型。 注意:构型是指分子中各原子的特定空间排布,其变化要求共价键的断裂和重新形成。旋光性是异构体的光学活性,是使偏振光平面向左或向右旋转的性质,(-)表示左旋,(+)表示右旋。构型与旋光性没有直接对应关系。 (二)氨基酸的分类 1.按R基的化学结构分为脂肪族、芳香族、杂环、杂环亚氨基酸四类。 2.按R基的极性和在中性溶液的解离状态分为非极性氨基酸、极性不带电荷、极性带负电荷或带正电荷的四类。 带有非极性R(烃基、甲硫基、吲哚环等,共9种):甘(Gly)、丙(Ala)、缬(Val)、亮(Leu)、异亮(Ile)、苯丙(Phe)、甲硫(Met)、脯(Pro)、色(Trp) 带有不可解离的极性R(羟基、巯基、酰胺基等,共6种):丝(Ser)、苏(Thr)、天胺(Asn)、谷胺(Gln)、酪(Tyr)、半(Cys)带有可解离的极性R基(共5种):天(Asp)、谷(Glu)、赖(Lys)、精(Arg)、组(His),前两个为酸性氨基酸,后三个是碱性氨基酸。 蛋白质分子中的胱氨酸是两个半胱氨酸脱氢后以二硫键结合而成,胶原蛋白中的羟脯氨酸、羟赖氨酸,凝血酶原中的羧基谷氨酸是蛋白质加工修饰而成。 (三)氨基酸的重要理化性质 1.一般物理性质 α-氨基酸为无色晶体,熔点一般在200 oC以上。各种氨基酸在水中的溶解度差别很大(酪氨酸不溶于水)。一般溶解于稀酸或稀碱,

王镜岩(第三版)生物化学下册课后习题答案

第19章代谢总论 ⒈怎样理解新陈代谢? 答:新陈代谢是生物体内一切化学变化的总称,是生物体表现其生命活动的重要特征之一。它是由多酶体系协同作用的化学反应网络。新陈代谢包括分解代谢和合成代谢两个方面。新陈代谢的功能可概括为五个方而:①从周围环境中获得营养物质。②将外界引入的营养物质转变为自身需要的结构元件。③将结构元件装配成自身的大分子。④形成或分解生物体特殊功能所需的生物分子。⑤提供机体生命活动所需的一切能量。 ⒉能量代谢在新陈代谢中占何等地位? 答:生物体的一切生命活动都需要能量。生物体的生长、发育,包括核酸、蛋白质的生物合成,机体运动,包括肌肉的收缩以及生物膜的传递、运输功能等等,都需要消耗能量。如果没有能量来源生命活动也就无法进行.生命也就停止。 ⒊在能量储存和传递中,哪些物质起着重要作用? 答:在能量储存和传递中,ATP(腺苷三磷酸)、GTP(鸟苷三磷酸)、UTP(尿苷三磷酸)以及CTP(胞苷三磷酸)等起着重要作用。 ⒋新陈代谢有哪些调节机制?代谢调节有何生物意义? 答:新陈代谢的调节可慨括地划分为三个不同水平:分子水平、细胞水平和整体水平。 分子水平的调节包括反应物和产物的调节(主要是浓度的调节和酶的调节)。酶的调节是最基本的代谢调节,包括酶的数量调节以及酶活性的调节等。酶的数量不只受到合成速率的调节,也受到降解速率的调节。合成速率和降解速率都备有一系列的调节机制。在酶的活性调节机制中,比较普遍的调节机制是可逆的变构调节和共价修饰两种形式。 细胞的特殊结构与酶结合在一起,使酶的作用具有严格的定位条理性,从而使代谢途径得到分隔控制。 多细胞生物还受到在整体水平上的调节。这主要包括激素的调节和神经的调节。高等真核生物由于分化出执行不同功能的各种器官,而使新陈代谢受到合理的分工安排。人类还受到高级神经活动的调节。 除上述各方面的调节作用外,还有来自基因表达的调节作用。 代谢调节的生物学意义在于代谢调节使生物机体能够适应其内、外复杂的变化环境,从而得以生存。 ⒌从“新陈代谢总论”中建立哪些基本概念? 答:从“新陈代谢总论”中建立的基本概念主要有:代谢、分解代谢、合成代谢、递能作用、基团转移反应、氧化和还原反应、消除异构及重排反应、碳-碳键的形成与断裂反应等。 ⒍概述代谢中的有机反应机制。 答:生物代谢中的反应大体可归纳为四类,即基团转移反应;氧化-还原反应;消除、异构化和重排反应;碳-碳键的形成或断裂反应。这些反应的具体反应机制包括以下几种:酰基转移,磷酰基转移,葡糖基基转移;氧化-还原反应;消除反应,分子内氢原子的迁移(异构化反应),分子重排反应;羟醛综合反应,克莱森酯综合反应,β-酮酸的氧化脱羧反应。

王镜岩《生物化学》课后习题详细解答

生物化学(第三版)课后习题详细解答 第三章氨基酸 提要 α-氨基酸是蛋白质的构件分子,当用酸、碱或蛋白酶水解蛋白质时可获得它们.蛋白质中的氨基酸都是L型的.但碱水解得到的氨基酸是D型和L型的消旋混合物。 参与蛋白质组成的基本氨基酸只有20种。此外还有若干种氨基酸在某些蛋白质中存在,但它们都是在蛋白质生物合成后由相应是基本氨基酸(残基)经化学修饰而成.除参与蛋白质组成的氨基酸外,还有很多种其他氨基酸存在与各种组织和细胞中,有的是β-、γ-或δ—氨基酸,有些是D型氨基酸。 氨基酸是两性电解质。当pH接近1时,氨基酸的可解离基团全部质子化,当pH在13左右时,则全部去质子化.在这中间的某一pH(因不同氨基酸而异),氨基酸以等电的兼性离子(H3N+CHRCOO-)状态存在。某一氨基酸处于净电荷为零的兼性离子状态时的介质pH称为该氨基酸的等电点,用pI表示。 所有的α—氨基酸都能与茚三酮发生颜色反应。α—NH2与2,4-二硝基氟苯(DNFB)作用产生相应的DNP-氨基酸(Sanger反应);α—NH2与苯乙硫氰酸酯(PITC)作用形成相应氨基酸的苯胺基硫甲酰衍生物( Edman反应).胱氨酸中的二硫键可用氧化剂(如过甲酸)或还原剂(如巯基乙醇)断裂.半胱氨酸的SH基在空气中氧化则成二硫键.这几个反应在氨基酸荷蛋白质化学中占有重要地位。 除甘氨酸外α—氨基酸的α-碳是一个手性碳原子,因此α-氨基酸具有光学活性.比旋是α-氨基酸的物理常数之一,它是鉴别各种氨基酸的一种根据. 参与蛋白质组成的氨基酸中色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸在紫外区有光吸收,这是紫外吸收法定量蛋白质的依据。核磁共振(NMR)波谱技术在氨基酸和蛋白质的化学表征方面起重要作用。 氨基酸分析分离方法主要是基于氨基酸的酸碱性质和极性大小。常用方法有离子交换柱层析、高效液相层析(HPLC)等。 习题 1。写出下列氨基酸的单字母和三字母的缩写符号:精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。[见表3-1]

封面、目录、 概要 王镜岩《生物化学》第三版笔记(打印版)

生物化学笔记王镜岩等《生物化学》第三版 适合以王镜岩《生物化学》第三版为考研指导 教材的各高校的生物类考生备考

目录 第一章概述------------------------------01 第二章糖类------------------------------06 第三章脂类------------------------------14 第四章蛋白质(注1)-------------------------21 第五章酶类(注2)-------------------------36 第六章核酸(注3)--------------------------------------45 第七章维生素(注4)-------------------------52 第八章抗生素------------------------------55 第九章激素------------------------------58 第十章代谢总论------------------------------63 第十一章糖类代谢(注5)--------------------------------------65 第十二章生物氧化------------------------------73 第十三章脂类代谢(注6)--------------------------------------75 第十四章蛋白质代谢(注7)-----------------------------------80 第十五章核苷酸的降解和核苷酸代谢--------------86 第十六章 DNA的复制与修复(注8)---------------------------88 第十七章 RNA的合成与加工(注9)---------------------------93 第十八章蛋白质的合成与运转--------------------96 第十九章代谢调空------------------------------98 第二十章生物膜(补充部分)---------------------102

生物化学笔记(完整版)

第一章绪论 一、生物化学的的概念: 生物化学(biochemistry)是利用化学的原理与方法去探讨生命的一门科学,它是介于化学、生物学及物理学之间的一门边缘学科。 二、生物化学的发展: 1.叙述生物化学阶段:是生物化学发展的萌芽阶段,其主要的工作是分析和研究生物体的组成成分以及生物体的分泌物和排泄物。 2.动态生物化学阶段:是生物化学蓬勃发展的时期。就在这一时期,人们基本上弄清了生物体内各种主要化学物质的代谢途径。 3.分子生物学阶段:这一阶段的主要研究工作就是探讨各种生物大分子的结构与其功能之间的关系。 三、生物化学研究的主要方面: 1.生物体的物质组成:高等生物体主要由蛋白质、核酸、糖类、脂类以及水、无机盐等组成,此外还含有一些低分子物质。 2.物质代谢:物质代谢的基本过程主要包括三大步骤:消化、吸收→中间代谢→排泄。其中,中间代谢过程是在细胞内进行的,最为复杂的化学变化过程,它包括合成代谢,分解代谢,物质互变,代谢调控,能量代谢几方面的内容。 3.细胞信号转导:细胞内存在多条信号转导途径,而这些途径之间通过一定的方式方式相互交织在一起,从而构成了非常复杂的信号转导网络,调控细胞的代谢、生理活动及生长分化。 4.生物分子的结构与功能:通过对生物大分子结构的理解,揭示结构与功能之间的关系。 5.遗传与繁殖:对生物体遗传与繁殖的分子机制的研究,也是现代生物化学与分子生物学研究的一个重要内容。 第二章蛋白质的结构与功能 一、氨基酸: 1.结构特点:氨基酸(amino acid)是蛋白质分子的基本组成单位。构成天然蛋白质分子的氨基酸约有20种,除脯氨酸为α-亚氨基酸、甘氨酸不含手性碳原子外,其余氨基酸均为L-α-氨基酸。 2.分类:根据氨基酸的R基团的极性大小可将氨基酸分为四类:①非极性中性氨基酸(8种);②极性中性氨基酸(7种);③酸性氨基酸(Glu和Asp);④碱性氨基酸(Lys、Arg和His)。 二、肽键与肽链: 肽键(peptide bond)是指由一分子氨基酸的α-羧基与另一分子氨基酸的α-氨基经脱水而形成的共价键(-CO -NH-)。氨基酸分子在参与形成肽键之后,由于脱水而结构不完整,称为氨基酸残基。每条多肽链都有两端:即自由氨基端(N端)与自由羧基端(C端),肽链的方向是N端→C端。 三、肽键平面(肽单位): 肽键具有部分双键的性质,不能自由旋转;组成肽键的四个原子及其相邻的两个α碳原子处在同一个平面上,为刚性平面结构,称为肽键平面。 四、蛋白质的分子结构:

生物化学知识点汇总(王镜岩版)

生物化学知识点汇总(王镜岩版)

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生物化学讲义(2003) 孟祥红 绪论(preface) 一、生物化学(biochemistry)的含义: 生物化学可以认为是生命的化学(chemistryoflife)。 生物化学是用化学的理论和方法来研究生命现象。 1、生物体是有哪些物质组成的?它们的结构和性质如何?容易回答。 2、这些物质在生物体内发生什么变化?是怎样变化的?变化过程中能量是怎样转换的?(即这些物质在生物体 内怎样进行物质代谢和能量代谢?)大部分已解决。 3、这些物质结构、代谢和生物功能及复杂的生命现象(如生长、生殖、遗传、运动等)之间有什么关系?最复 杂。 二、生物化学的分类 根据不同的研究对象:植物生化;动物生化;人体生化;微生物生化 从不同的研究目的上分:临床生物化学;工业生物化学;病理生物化学;农业生物化学;生物物理化学等。 糖的生物化学、蛋白质化学、核酸化学、酶学、代谢调控等。 三、生物化学的发展史 1、历史背景:从十八世下半叶开始,物理学、化学、生物学取得了一系列的重要的成果(1)化学方面 法国化学家拉瓦锡推翻“燃素说”并认为动物呼吸是像蜡烛一样的燃烧,只是动物体内燃烧是缓慢不发光的 燃烧——生物有氧化理论的雏形 瑞典化学家舍勒——发现了柠檬酸、苹果酸是生物氧化的中间代谢产物,为三羧酸循环的发现提供了线索。 (2)物理学方面:原子论、x-射线的发现。 (3)生物学方面:《物种起源——进化论》发现。 2、生物化学的诞生:在19世纪末20世纪初,生物化学才成为一门独立的科学。 德国化学家李比希: 1842年撰写的《有机化学在生理与病理学上的应用》一书中,首次提出了新陈代谢名词。另一位是德国医生霍佩赛勒: 1877年他第一次提出Biochemie这个名词英文译名是Biochemistry(orBiologicalchemistry)汉语翻译成 生物化学。 3、生物化学的建立: 从生物化发展历史来看,20世纪前半叶,在蛋白质、酶、维生素、激素、物质代谢及生物氧化方面有了长足 进步。成就主要集中于英、美、德等国。 英国,代表人物是霍普金斯——创立了普通生物化学学派。

脂类--王镜岩生物化学第三版笔记(完美打印版)

第三章脂类 提要 一、概念 酸、皂化值、碘值、酸价、酸败、油脂的硬化、甘油磷脂、鞘氨醇磷脂、神经节苷脂、脑苷脂、乳糜微粒 二、脂类的性质与分类单纯脂、复合脂、非皂化脂、衍生脂、结合脂 单纯脂 脂肪酸的俗名、系统名和缩写、双键的定位 三、油脂的结构和化学性质 (1)水解和皂化脂肪酸平均分子量=3×56×1000÷皂化值 (2)加成反应碘值大,表示油脂中不饱和脂肪酸含量高,即不饱和程度高。 (3)酸败 蜡是由高级脂肪酸和长链脂肪族一元醇或固醇构成的酯。 四、磷脂(复合脂) (一)甘油磷脂类 最常见的是卵磷脂和脑磷脂。卵磷脂是磷脂酰胆碱。脑磷脂是磷脂酰乙醇胺。 卵磷脂和脑磷脂都不溶于水而溶于有机溶剂。磷脂是兼性离子,有多个可解离基团。在弱碱下可水解,生成脂肪酸盐,其余部分不水解。在强碱下则水解成脂肪酸、磷酸甘油和有机碱。磷脂中的不饱和脂肪酸在空气中易氧化。 (二)鞘氨醇磷脂 神经鞘磷脂由神经鞘氨醇(简称神经醇)、脂肪酸、磷酸与含氮碱基组成。脂酰基与神经醇的氨基以酰胺键相连,所形成的脂酰鞘氨醇又称神经酰胺;神经醇的伯醇基与磷脂酰胆碱(或磷脂酰乙醇胺)以磷酸酯键相连。 磷脂能帮助不溶于水的脂类均匀扩散于体内的水溶液体系中。 非皂化脂 (一)萜类是异戊二烯的衍生物 多数线状萜类的双键是反式。维生素A、E、K等都属于萜类,视黄醛是二萜。天然橡胶是多萜。(二)类固醇都含有环戊烷多氢菲结构 固醇类是环状高分子一元醇,主要有以下三种:动物固醇胆固醇是高等动物生物膜的重要成分,对调节生物膜的流动性有一定意义。胆固醇还是一些活性物质的前体,类固醇激素、维生素D3、胆汁酸等都是胆固醇的衍生物。 植物固醇是植物细胞的重要成分,不能被动物吸收利用。 1,酵母固醇存在于酵母菌、真菌中,以麦角固醇最多,经日光照射可转化为维生素D2。 2.固醇衍生物类 胆汁酸是乳化剂,能促进油脂消化。 强心苷和蟾毒它们能使心率降低,强度增加。 性激素和维生素D 3. 前列腺素 结合脂 1.糖脂。它分为中性和酸性两类,分别以脑苷脂和神经节苷脂为代表。 脑苷脂由一个单糖与神经酰胺构成。 神经节苷脂是含唾液酸的糖鞘脂,有多个糖基,又称唾液酸糖鞘脂,结构复杂。 2.脂蛋白 根据蛋白质组成可分为三类:核蛋白类、磷蛋白类、单纯蛋白类,其中单纯蛋白类主要有水溶性的血浆脂蛋白和脂溶性的脑蛋白脂。 血浆脂蛋白根据其密度由小到大分为五种: 乳糜微粒主要生理功能是转运外源油脂。 极低密度脂蛋白(VLDL) 转运内源油脂。 低密度脂蛋白(LDL) 转运胆固醇和磷脂。 高密度脂蛋白(HDL) 转运磷脂和胆固醇。 极高密度脂蛋白(VHDL) 转运游离脂肪酸。 脑蛋白脂不溶于水,分为A、B、C三种。top 第一节概述 一、脂类是脂溶性生物分子 脂类(lipids)泛指不溶于水,易溶于有机溶剂的各类生物分子。脂类都含有碳、氢、氧元素,有的还含有氮和磷。共同特征是以长链或稠环脂肪烃分子为母体。脂类分子中没有极性基团的称为非极性脂;有极性基团的称为极性脂。极性脂的主体是脂溶性的,其中的部分结构是水溶性的。 二、分类 1.单纯脂单纯脂是脂肪酸与醇结合成的酯,没有极

王镜岩《生物化学》笔记(整理版)第一章

导入:100年前,恩格斯指出“蛋白体是生命的存在形式”;今天人们如何认识蛋白 质的概念和重要性? 1839年荷兰化学家马尔德(G.J.Mulder)研究了乳和蛋中的清蛋白,并按瑞典化学家Berzelius的提议把提取的物质命名为蛋白质(Protein,源自希腊语,意指“第一重要的”)。德国化学家费希尔(E.Fischer)研究了蛋白质的组成和结构,在1907年奠立蛋白质化学。英国的鲍林(L.Pauling)在1951年推引出蛋白质的螺旋;桑格(F.Sanger)在1953 年测出胰岛素的一级结构。佩鲁茨(M.F.Perutz)和肯德鲁(J.C.kendrew) 在1960年测定血红蛋白和肌红蛋白的晶体结构。1965年,我国生化学者首先合成了具有生物活性的蛋白质——胰岛素(insulin)。 蛋白质是由L-α-氨基酸通过肽键缩合而成的,具有较稳定的构象和一定生物功能的 生物大分子(biomacromolecule)。蛋白质是生命活动所依赖的物质基础,是生物体中含 量最丰富的大分子。 单细胞的大肠杆菌含有3000多种蛋白质,而人体有10万种以上结构和功能各异的蛋 白质,人体干重的45%是蛋白质。生命是物质运动的高级形式,是通过蛋白质的多种功能 来实现的。新陈代谢的所有的化学反应几乎都是在酶的催化下进行的,已发现的酶绝大多 数是蛋白质。生命活动所需要的许多小分子物质和离子,它们的运输由蛋白质来完成。生 物的运动、生物体的防御体系离不开蛋白质。蛋白质在遗传信息的控制、细胞膜的通透性,以及高等动物的记忆、识别机构等方面都起着重要的作用。随着蛋白质工程和蛋白质组学 的兴起和发展,人们对蛋白质的结构与功能的认识越来越深刻。 第一节蛋白质的分子组成 一、蛋白质的元素组成 经元素分析,主要有 C(50%~55%)、H(6%~7%)、O(19%~24%)、N(13%~19%)、S(0%~4%)。有些蛋白质还含微量的P、Fe、Cu、Zn、Mn、Co、Mo、I等。 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。因此,可以用定氮法来推算样品中蛋白质 的大致含量。

生物化学王镜岩(三版)单元测试蛋白质章节

生物化学单元测试二(蛋白质3~7章) 一、名词解释 1、必需氨基酸 2、氨基酸等电点(pI) 3、肽键 4、蛋白质的一级结构 5、二级结构 6、超二级结构 7、结构域 8、三级结构 9、四级结构 10、蛋白质变性与复性 11、蛋白质的沉淀作用 12、肽平面 二、填空题: 1.谷氨酸的pK1(α-COOH)= 2.19,pK2(α-NH3)=9.67,pK3(R基)=4.25,其pI值应为()。 2.组成蛋白质分子的碱性氨基酸有()、()和();酸性氨基酸有()和();组成蛋白质的氨基酸中含硫的氨基酸有()和()。能形成二硫键的氨基酸是(),分子量最小的氨基酸是(),具有羟基的氨基酸是()和(),属于亚氨基酸是()。不同蛋白质的含氮量较恒定,平均含量为(),如测得1克样品含氮量为10mg,则蛋白质含量为()% 3.蛋白质具有两性电离性质,当蛋白质处在某一pH值溶液中时,它所带的正负电荷数相等,此时的蛋白质溶液的pH值称为蛋白质的()。此时蛋白质其净电荷为0,此时它的溶解度最小。当氨基酸溶液的pH=pI时,氨基酸以()离子形式存在,当pH>pI时,氨基酸以()离子形式存在,当pH

王镜岩《生物化学》第三版考研资料(配套习题023页)

王镜岩《生物化学》第三版考研资料(配套习题023页) 王镜岩, 习题, 生化 第一章蛋白质化学测试题-- 一、单项选择题 1.测得某一蛋白质样品的氮含量为0.40g,此样品约含蛋白质多少? A.2.00g B.2.50g C.6.40g D.3.00g E.6.25g 2.下列含有两羧基的氨基酸是: A.精氨酸B.赖氨酸C.甘氨酸 D.色氨酸 E.谷氨酸 3.维持蛋白质二级结构的主要化学键是: A.盐键 B.疏水键 C.肽键D.氢键 E.二硫键 4.关于蛋白质分子三级结构的描述,其中错误的是: A.天然蛋白质分子均有的种结构 B.具有三级结构的多肽链都具有生物学活性 C.三级结构的稳定性主要是次级键维系 D.亲水基团聚集在三级结构的表面biooo E.决定盘曲折叠的因素是氨基酸残基 5.具有四级结构的蛋白质特征是: A.分子中必定含有辅基 B.在两条或两条以上具有三级结构多肽链的基础上,肽链进一步折叠,盘曲形成 C.每条多肽链都具有独立的生物学活性 D.依赖肽键维系四级结构的稳定性 E.由两条或两条以上具在三级结构的多肽链组成 6.蛋白质所形成的胶体颗粒,在下列哪种条件下不稳定: A.溶液pH值大于pI B.溶液pH值小于pI C.溶液pH值等于pI D.溶液pH值等于7.4 E.在水溶液中 7.蛋白质变性是由于:biooo A.氨基酸排列顺序的改变B.氨基酸组成的改变C.肽键的断裂D.蛋白 质空间构象的破坏E.蛋白质的水解

8.变性蛋白质的主要特点是: A.粘度下降B.溶解度增加C.不易被蛋白酶水解 D.生物学活性丧失 E.容易被盐析出现沉淀 9.若用重金属沉淀pI为8的蛋白质时,该溶液的pH值应为: A.8 B.>8 C.<8 D.≤8E.≥8 10.蛋白质分子组成中不含有下列哪种氨基酸? A.半胱氨酸 B.蛋氨酸 C.胱氨酸 D.丝氨酸 E.瓜氨酸 二、多项选择题 (在备选答案中有二个或二个以上是正确的,错选或未选全的均不给分) 1.含硫氨基酸包括: A.蛋氨酸 B.苏氨酸 C.组氨酸D.半胖氨酸 2.下列哪些是碱性氨基酸: A.组氨酸B.蛋氨酸C.精氨酸D.赖氨酸 3.芳香族氨基酸是: A.苯丙氨酸 B.酪氨酸 C.色氨酸 D.脯氨酸 4.关于α-螺旋正确的是: A.螺旋中每3.6个氨基酸残基为一周 B.为右手螺旋结构 C.两螺旋之间借二硫键维持其稳定 D.氨基酸侧链R基团分布在螺旋外侧 5.蛋白质的二级结构包括: A.α-螺旋 B.β-片层C.β-转角 D.无规卷曲 6.下列关于β-片层结构的论述哪些是正确的: A.是伸展的肽链结构 B.肽键平面折叠成锯齿状 C.也可由两条以上多肽链顺向或逆向平行排列而成 D.两链间形成离子键以使结构稳定 7.维持蛋白质三级结构的主要键是: A.肽键B.疏水键C.离子键D.范德华引力 8.下列哪种蛋白质在pH5的溶液中带正电荷? A.pI为4.5的蛋白质B.pI为7.4的蛋白质 C.pI为7的蛋白质D.pI为6.5的蛋白质 9.使蛋白质沉淀但不变性的方法有: A.中性盐沉淀蛋白 B.鞣酸沉淀蛋白 C.低温乙醇沉淀蛋白D.重金属盐沉淀蛋白 10.变性蛋白质的特性有:

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王镜岩 第一章糖 一、糖的概念 糖类物质是多羟基(2个或以上)的醛类(aldehyde)或酮类(Ketone)化合物,以及它们的衍生物或聚合物。 据此可分为醛糖(aldose)和酮糖(ketose)。 还可根据碳层子数分为丙糖(triose),丁糖(terose),戊糖(pentose)、己糖(hexose)。 最简单的糖类就是丙糖(甘油醛和二羟丙酮) 由于绝大多数的糖类化合物都可以用通式Cn (H2O)n表示,所以过去人们一直认为糖类是碳与水的化合物,称为碳水化合物。现在已经这种称呼并恰当,只是沿用已久,仍有许多人称之为碳水化合物。 二、糖的种类 根据糖的结构单元数目多少分为: (1)单糖:不能被水解称更小分子的糖。 (2)寡糖:2-6个单糖分子脱水缩合而成,以双糖最为普遍,意义也较大。 (3)多糖: 均一性多糖:淀粉、糖原、纤维素、半纤维素、几丁质(壳多糖) 不均一性多糖:糖胺多糖类(透明质酸、硫酸软骨素、硫酸皮肤素等) (4)结合糖(复合糖,糖缀合物,glycoconjugate):糖脂、糖蛋白(蛋白聚糖)、糖-核苷酸等 (5)糖的衍生物:糖醇、糖酸、糖胺、糖苷 三、糖类的生物学功能 (1) 提供能量。植物的淀粉和动物的糖原都是能量的储存形式。 (2) 物质代谢的碳骨架,为蛋白质、核酸、脂类的合成提供碳骨架。 (3) 细胞的骨架。纤维素、半纤维素、木质素是植物细胞壁的主要成分,肽聚糖是细胞壁的主要成分。 (4) 细胞间识别和生物分子间的识别。 细胞膜表面糖蛋白的寡糖链参与细胞间的识别。一些细胞的细胞膜表面含有糖分子或寡糖链,构成细胞的天线,参与细胞通信。 红细胞表面ABO血型决定簇就含有岩藻糖。 第一节单糖 一、单糖的结构 1、单糖的链状结构 确定链状结构的方法(葡萄糖): a. 与Fehling试剂或其它醛试剂反应,含有醛基。 b. 与乙酸酐反应,产生具有五个乙酰基的衍生物。 c. 用钠、汞剂作用,生成山梨醇。 图2 最简单的单糖之一是甘油醛(glyceraldehydes),它有两种立体异构形式(Stereoismeric form),图7.3。 这两种立体异构体在旋光性上刚好相反,一种异构体使平面偏振光(Plane polarized liyot)的偏振面沿顺时针方向偏转,称为右旋型异构体(dextrorotary),或D型异构体。另一种异构体则使平面偏振不的编振机逆时针编转,称左旋异构体(levorotary,L)或L型异构体。 像甘油醛这样具有旋光性差异的立体异构体又称为光学异构体(Cptical lsmer),常用D,L表示。 以甘油醛的两种光学异构体作对照,其他单糖的光学异构构与之比较而规定为D型或L型。 差向异构体(epimer):又称表异构体,只有一个不对称碳原子上的基因排列方式不同的非对映异构体,如D-等等糖与D-半乳糖。 链状结构一般用Fisher投影式表示:碳骨架、竖直写;氧化程度最高的碳原子在上方, 2、单糖的环状结构 在溶液中,含有4个以上碳原子的单糖主要以环状结构。 单糖分子中的羟基能与醛基或酮基可逆缩合成环状的半缩醛(emiacetal)。环化后,羰基C就成为一个手性C原子称为端异构性碳原子(anomeric carbon -型头异构体。β-型及αatom),环化后形成的两种非对映异构体称为端基异构体,或头异构体(anomer),分别称为 环状结构一般用Havorth结构式表示:

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